--- /srv/rebuilderd/tmp/rebuilderdIUUAWS/inputs/r-bioc-consensusclusterplus_1.76.0+ds-1_all.deb
+++ /srv/rebuilderd/tmp/rebuilderdIUUAWS/out/r-bioc-consensusclusterplus_1.76.0+ds-1_all.deb
├── file list
│ @@ -1,3 +1,3 @@
│  -rw-r--r--   0        0        0        4 2026-08-09 12:22:34.000000 debian-binary
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├── control.tar.xz
│ ├── control.tar
│ │ ├── ./md5sums
│ │ │ ├── ./md5sums
│ │ │ │┄ Files differ
├── data.tar.xz
│ ├── data.tar
│ │ ├── file list
│ │ │ @@ -15,27 +15,27 @@
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│ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)      221 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/Meta/vignette.rds
│ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)      363 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/NAMESPACE
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│ │ │  drwxr-xr-x   0 root         (0) root         (0)        0 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/R/
│ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)     1058 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/R/ConsensusClusterPlus
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│ │ │ --rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)      440 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/R/ConsensusClusterPlus.rdx
│ │ │ +-rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)    35015 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/R/ConsensusClusterPlus.rdb
│ │ │ +-rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)      447 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/R/ConsensusClusterPlus.rdx
│ │ │  drwxr-xr-x   0 root         (0) root         (0)        0 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/doc/
│ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)     5486 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/doc/ConsensusClusterPlus.R
│ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)    17894 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/doc/ConsensusClusterPlus.Rnw
│ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)   412455 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/doc/ConsensusClusterPlus.pdf
│ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)     1466 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/doc/index.html
│ │ │  drwxr-xr-x   0 root         (0) root         (0)        0 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/help/
│ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)       71 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/help/AnIndex
│ │ │ --rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)     5659 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/help/ConsensusClusterPlus.rdb
│ │ │ +-rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)     5679 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/help/ConsensusClusterPlus.rdb
│ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)      170 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/help/ConsensusClusterPlus.rdx
│ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)      124 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/help/aliases.rds
│ │ │ --rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)      139 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/help/paths.rds
│ │ │ +-rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)      152 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/help/paths.rds
│ │ │  drwxr-xr-x   0 root         (0) root         (0)        0 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/html/
│ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)     1324 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/html/00Index.html
│ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)     2133 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/html/R.css
│ │ │  drwxr-xr-x   0 root         (0) root         (0)        0 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/share/
│ │ │  drwxr-xr-x   0 root         (0) root         (0)        0 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/share/doc/
│ │ │  drwxr-xr-x   0 root         (0) root         (0)        0 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/share/doc/r-bioc-consensusclusterplus/
│ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)      864 2026-08-09 12:22:34.000000 ./usr/share/doc/r-bioc-consensusclusterplus/changelog.Debian.gz
│ │ ├── ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/R/ConsensusClusterPlus.rdb
│ │ │ ├── Rscript --vanilla - {}
│ │ │ │ @@ -9,15 +9,15 @@
│ │ │ │      "imports" = "pdf = "pdf", png = "png", rainbow = "rainbow", rgb = "rgb"), "
│ │ │ │      "imports" = "    stats = c(as.dendrogram = "as.dendrogram", as.dist = "as.dist", "
│ │ │ │      "imports" = "    cor = "cor", cutree = "cutree", dist = "dist", hclust = "hclust", "
│ │ │ │      "imports" = "    heatmap = "heatmap", kmeans = "kmeans"), utils = c(write.csv = "write.csv", "
│ │ │ │      "imports" = "    write.table = "write.table"), Biobase = c(exprs = "exprs"), "
│ │ │ │      "imports" = "    cluster = c(pam = "pam", diana = "diana"))"
│ │ │ │      "lazydata" = "<environment>"
│ │ │ │ -    "path" = ""/home/moeller/Salsa/r-bioc-consensusclusterplus/debian/r-bioc-consensusclusterplus/usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus""
│ │ │ │ +    "path" = ""/build/reproducible-path/r-bioc-consensusclusterplus-1.76.0+ds/debian/r-bioc-consensusclusterplus/usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus""
│ │ │ │      "spec" = "c(name = "ConsensusClusterPlus", version = "1.76.0")"
│ │ │ │  }
│ │ │ │  
│ │ │ │  .__S3MethodsTable__. (environment) = 
│ │ │ │  {
│ │ │ │  }
│ │ ├── ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/R/ConsensusClusterPlus.rdx
│ │ │ ├── ConsensusClusterPlus.rdx-content
│ │ │ │ ├── Rscript --vanilla -e 'args <- commandArgs(TRUE); readRDS(args[1])' {}
│ │ │ │ │ @@ -1,61 +1,61 @@
│ │ │ │ │  $variables
│ │ │ │ │  $variables$.__NAMESPACE__.
│ │ │ │ │ -[1] 852  52
│ │ │ │ │ +[1] 862  52
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $variables$.__S3MethodsTable__.
│ │ │ │ │ -[1] 1035   52
│ │ │ │ │ +[1] 1045   52
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $variables$.packageName
│ │ │ │ │ -[1] 1087   65
│ │ │ │ │ +[1] 1097   65
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $variables$CDF
│ │ │ │ │ -[1] 1152 2551
│ │ │ │ │ +[1] 1162 2551
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $variables$ConsensusClusterPlus
│ │ │ │ │ -[1] 3703 8961
│ │ │ │ │ +[1] 3713 8961
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $variables$calcICL
│ │ │ │ │ -[1] 12664  6458
│ │ │ │ │ +[1] 12674  6458
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $variables$ccRun
│ │ │ │ │ -[1] 19122  6130
│ │ │ │ │ +[1] 19132  6130
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $variables$clusterTrackingPlot
│ │ │ │ │ -[1] 25252  1696
│ │ │ │ │ +[1] 25262  1696
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $variables$connectivityMatrix
│ │ │ │ │ -[1] 26948  1063
│ │ │ │ │ +[1] 26958  1063
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $variables$myPal
│ │ │ │ │ -[1] 28011   506
│ │ │ │ │ +[1] 28021   506
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $variables$rankedBarPlot
│ │ │ │ │ -[1] 28517  2076
│ │ │ │ │ +[1] 28527  2076
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $variables$sampleCols
│ │ │ │ │ -[1] 30593  1490
│ │ │ │ │ +[1] 30603  1490
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $variables$setClusterColors
│ │ │ │ │ -[1] 32083  1742
│ │ │ │ │ +[1] 32093  1742
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $variables$triangle
│ │ │ │ │ -[1] 33825  1180
│ │ │ │ │ +[1] 33835  1180
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $references
│ │ │ │ │  $references$`env::1`
│ │ │ │ │ -[1] 300 552
│ │ │ │ │ +[1] 300 562
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $references$`env::2`
│ │ │ │ │  [1]   0 131
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $references$`env::3`
│ │ │ │ │  [1] 131 169
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $references$`env::4`
│ │ │ │ │ -[1] 904 131
│ │ │ │ │ +[1] 914 131
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $compressed
│ │ │ │ │  [1] TRUE
│ │ ├── ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/help/ConsensusClusterPlus.rdb
│ │ │ ├── Rscript --vanilla - {}
│ │ │ │ @@ -113,15 +113,15 @@
│ │ │ │          structure("#  tmp = diana(this_dist,diss=TRUE)\n", Rd_tag = "RCODE"), 
│ │ │ │          structure("#  assignment = cutree(tmp,k)\n", Rd_tag = "RCODE"), 
│ │ │ │          structure("#  return(assignment)  \n", Rd_tag = "RCODE"), 
│ │ │ │          structure("#}\n", Rd_tag = "RCODE"), structure("#rcc6 = ConsensusClusterPlus(d,maxK=6,reps=25,pItem=0.8,pFeature=1,title=\"example\",clusterAlg=\"dianaHook\")\n", Rd_tag = "RCODE"), 
│ │ │ │          structure("\n", Rd_tag = "RCODE"), structure("\n", Rd_tag = "RCODE"), 
│ │ │ │          structure("\n", Rd_tag = "RCODE"), structure("\n", Rd_tag = "RCODE"), 
│ │ │ │          structure("## ICL\n", Rd_tag = "RCODE"), structure("resICL = calcICL(rcc,title=\"example\")\n", Rd_tag = "RCODE"), 
│ │ │ │ -        structure("\n", Rd_tag = "RCODE"), structure("\n", Rd_tag = "RCODE")), Rd_tag = "\\examples")), Rdfile = "/home/moeller/Salsa/r-bioc-consensusclusterplus/man/ConsensusClusterPlus.Rd", class = "Rd", meta = list(
│ │ │ │ +        structure("\n", Rd_tag = "RCODE"), structure("\n", Rd_tag = "RCODE")), Rd_tag = "\\examples")), Rdfile = "/build/reproducible-path/r-bioc-consensusclusterplus-1.76.0+ds/man/ConsensusClusterPlus.Rd", class = "Rd", meta = list(
│ │ │ │      docType = character(0), generator = ""), prepared = 3L)
│ │ │ │  
│ │ │ │  hideOutput (NULL) = NULL
│ │ │ │  
│ │ │ │  safeDeparse (closure) = function (obj) 
│ │ │ │  {
│ │ │ │      tryCatch({
│ │ ├── ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/help/ConsensusClusterPlus.rdx
│ │ │ ├── ConsensusClusterPlus.rdx-content
│ │ │ │ ├── Rscript --vanilla -e 'args <- commandArgs(TRUE); readRDS(args[1])' {}
│ │ │ │ │ @@ -1,13 +1,13 @@
│ │ │ │ │  $variables
│ │ │ │ │  $variables$ConsensusClusterPlus
│ │ │ │ │ -[1]  285 5374
│ │ │ │ │ +[1]  299 5380
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $references
│ │ │ │ │  $references$`env::1`
│ │ │ │ │ -[1]   0 285
│ │ │ │ │ +[1]   0 299
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  $compressed
│ │ │ │ │  [1] TRUE
│ │ ├── ./usr/lib/R/site-library/ConsensusClusterPlus/help/paths.rds
│ │ │ ├── paths.rds-content
│ │ │ │ ├── Rscript --vanilla -e 'args <- commandArgs(TRUE); readRDS(args[1])' {}
│ │ │ │ │ @@ -1,3 +1,3 @@
│ │ │ │ │ -[1] "/home/moeller/Salsa/r-bioc-consensusclusterplus/man/ConsensusClusterPlus.Rd"
│ │ │ │ │ +[1] "/build/reproducible-path/r-bioc-consensusclusterplus-1.76.0+ds/man/ConsensusClusterPlus.Rd"
│ │ │ │ │  attr(,"first")
│ │ │ │ │ -[1] 53
│ │ │ │ │ +[1] 68