--- /srv/rebuilderd/tmp/rebuilderdH1ntv5/inputs/r-bioc-makecdfenv_1.88.0+ds-1_amd64.deb +++ /srv/rebuilderd/tmp/rebuilderdH1ntv5/out/r-bioc-makecdfenv_1.88.0+ds-1_amd64.deb ├── file list │ @@ -1,3 +1,3 @@ │ -rw-r--r-- 0 0 0 4 2026-08-04 10:18:18.000000 debian-binary │ -rw-r--r-- 0 0 0 1788 2026-08-04 10:18:18.000000 control.tar.xz │ --rw-r--r-- 0 0 0 3523420 2026-08-04 10:18:18.000000 data.tar.xz │ +-rw-r--r-- 0 0 0 3523620 2026-08-04 10:18:18.000000 data.tar.xz ├── control.tar.xz │ ├── control.tar │ │ ├── ./md5sums │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │┄ Files differ ├── data.tar.xz │ ├── data.tar │ │ ├── file list │ │ │ @@ -27,36 +27,36 @@ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 348 2026-08-04 10:18:18.000000 ./usr/lib/R/site-library/makecdfenv/Meta/links.rds │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 411 2026-08-04 10:18:18.000000 ./usr/lib/R/site-library/makecdfenv/Meta/nsInfo.rds │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 1130 2026-08-04 10:18:18.000000 ./usr/lib/R/site-library/makecdfenv/Meta/package.rds 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│ │ ├── Rscript --vanilla - {} │ │ │ │ @@ -183,15 +183,15 @@ │ │ │ │ "imports" = " affyio = c(Read.CC.Generic = "Read.CC.Generic", read.celfile = "read.celfile", " │ │ │ │ "imports" = " read.celfile.header = "read.celfile.header", Read.CYCHP = "Read.CYCHP", " │ │ │ │ "imports" = " read.cdffile.list = "read.cdffile.list", read.celfile.probeintensity.matrices = "read.celfile.probeintensity.matrices", " │ │ │ │ "imports" = " get.celfile.dates = "get.celfile.dates", read_abatch = "read_abatch", " │ │ │ │ "imports" = " check.cdf.type = "check.cdf.type", read_abatch_stddev = "read_abatch_stddev"" │ │ │ │ "imports" = " ))" │ │ │ │ "lazydata" = "" │ │ │ │ - "path" = ""/home/moeller/Salsa/r-bioc-makecdfenv/debian/r-bioc-makecdfenv/usr/lib/R/site-library/makecdfenv"" │ │ │ │ + "path" = ""/build/reproducible-path/r-bioc-makecdfenv-1.88.0+ds/debian/r-bioc-makecdfenv/usr/lib/R/site-library/makecdfenv"" │ │ │ │ "spec" = "c(name = "makecdfenv", version = "1.88.0")" │ │ │ │ } │ │ │ │ │ │ │ │ .__S3MethodsTable__. (environment) = │ │ │ │ { │ │ │ │ } │ │ ├── ./usr/lib/R/site-library/makecdfenv/R/makecdfenv.rdx │ │ │ ├── makecdfenv.rdx-content │ │ │ │ ├── Rscript --vanilla -e 'args <- commandArgs(TRUE); readRDS(args[1])' {} │ │ │ │ │ @@ -1,310 +1,310 @@ │ │ │ │ │ $variables │ │ │ │ │ $variables$.__C__Cdf │ │ │ │ │ [1] 0 380 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$.__NAMESPACE__. │ │ │ │ │ -[1] 3894 52 │ │ │ │ │ +[1] 3903 52 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$.__S3MethodsTable__. │ │ │ │ │ -[1] 4077 52 │ │ │ │ │ +[1] 4086 52 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$`.__T__name.levels:makecdfenv` │ │ │ │ │ -[1] 5485 52 │ │ │ │ │ +[1] 5494 52 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$`.__T__name.levels<-:makecdfenv` │ │ │ │ │ -[1] 7300 52 │ │ │ │ │ +[1] 7309 52 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$`.__T__pbase.levels:makecdfenv` │ │ │ │ │ -[1] 8723 53 │ │ │ │ │ +[1] 8732 53 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$`.__T__pbase.levels<-:makecdfenv` │ │ │ │ │ -[1] 10544 53 │ │ │ │ │ +[1] 10553 53 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$`.__T__pbase:makecdfenv` │ │ │ │ │ -[1] 11945 53 │ │ │ │ │ +[1] 11954 53 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$`.__T__pbase<-:makecdfenv` │ │ │ │ │ -[1] 13745 53 │ │ │ │ │ +[1] 13754 53 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$`.__T__show:methods` │ │ │ │ │ -[1] 170338 53 │ │ │ │ │ +[1] 170347 53 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$`.__T__tbase.levels:makecdfenv` │ │ │ │ │ -[1] 171762 53 │ │ │ │ │ +[1] 171771 53 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$`.__T__tbase.levels<-:makecdfenv` │ │ │ │ │ -[1] 173589 53 │ │ │ │ │ +[1] 173598 53 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$`.__T__tbase:makecdfenv` │ │ │ │ │ -[1] 174990 53 │ │ │ │ │ +[1] 174999 53 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$`.__T__tbase<-:makecdfenv` │ │ │ │ │ -[1] 176790 53 │ │ │ │ │ +[1] 176799 53 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$.packageName │ │ │ │ │ -[1] 176843 55 │ │ │ │ │ +[1] 176852 55 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$getInfoInFile │ │ │ │ │ -[1] 176898 814 │ │ │ │ │ +[1] 176907 814 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$make.cdf.env │ │ │ │ │ -[1] 177712 5306 │ │ │ │ │ +[1] 177721 5306 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$make.cdf.package │ │ │ │ │ -[1] 183018 3062 │ │ │ │ │ +[1] 183027 3062 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$name.levels │ │ │ │ │ -[1] 186080 403 │ │ │ │ │ +[1] 186089 403 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$`name.levels<-` │ │ │ │ │ -[1] 186483 431 │ │ │ │ │ +[1] 186492 431 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$pbase │ │ │ │ │ -[1] 186914 399 │ │ │ │ │ +[1] 186923 399 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$pbase.levels │ │ │ │ │ -[1] 187313 405 │ │ │ │ │ +[1] 187322 405 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$`pbase.levels<-` │ │ │ │ │ -[1] 187718 432 │ │ │ │ │ +[1] 187727 432 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$`pbase<-` │ │ │ │ │ -[1] 188150 425 │ │ │ │ │ +[1] 188159 425 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$pmormm │ │ │ │ │ -[1] 188575 1377 │ │ │ │ │ +[1] 188584 1377 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$read.cdffile │ │ │ │ │ -[1] 189952 2012 │ │ │ │ │ +[1] 189961 2012 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$tbase │ │ │ │ │ -[1] 191964 398 │ │ │ │ │ +[1] 191973 398 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$tbase.levels │ │ │ │ │ -[1] 192362 404 │ │ │ │ │ +[1] 192371 404 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$`tbase.levels<-` │ │ │ │ │ -[1] 192766 433 │ │ │ │ │ +[1] 192775 433 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$`tbase<-` │ │ │ │ │ -[1] 193199 424 │ │ │ │ │ +[1] 193208 424 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $references │ │ │ │ │ $references$`env::1` │ │ │ │ │ -[1] 671 3223 │ │ │ │ │ +[1] 671 3232 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $references$`env::10` │ │ │ │ │ -[1] 6533 269 │ │ │ │ │ +[1] 6542 269 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $references$`env::11` │ │ │ │ │ -[1] 5537 498 │ │ │ │ │ +[1] 5546 498 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $references$`env::12` │ │ │ │ │ -[1] 6035 498 │ │ │ │ │ +[1] 6044 498 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $references$`env::13` │ │ │ │ │ -[1] 8353 370 │ │ │ │ │ +[1] 8362 370 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $references$`env::14` │ │ │ │ │ -[1] 8092 261 │ │ │ │ │ +[1] 8101 261 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $references$`env::15` │ │ │ │ │ -[1] 7352 370 │ │ │ │ │ +[1] 7361 370 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $references$`env::16` │ │ │ │ │ -[1] 7722 370 │ │ │ │ │ +[1] 7731 370 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ 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@@ │ │ │ │ structure(list(structure("L. Gautier ", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\author"), │ │ │ │ structure(list(structure("\n", Rd_tag = "TEXT"), structure(list( │ │ │ │ structure(list(structure("read.cdffile", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\link")), Rd_tag = "\\code"), │ │ │ │ structure(",\n", Rd_tag = "TEXT"), structure(list(structure(list( │ │ │ │ structure("make.cdf.env", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\link")), Rd_tag = "\\code"), │ │ │ │ structure(",\n", Rd_tag = "TEXT"), structure(list(structure(list( │ │ │ │ structure("make.cdf.package", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\link")), Rd_tag = "\\code"), │ │ │ │ - structure("\n", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\seealso")), Rdfile = "/home/moeller/Salsa/r-bioc-makecdfenv/man/Cdf-class.Rd", class = "Rd", meta = list( │ │ │ │ + structure("\n", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\seealso")), Rdfile = "/build/reproducible-path/r-bioc-makecdfenv-1.88.0+ds/man/Cdf-class.Rd", class = "Rd", meta = list( │ │ │ │ docType = "class", generator = ""), prepared = 3L) │ │ │ │ │ │ │ │ getInfoInAffyFile (list) = structure(list(structure(list(structure("get information from Affymetrix data files", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\title"), │ │ │ │ structure(list(structure("getInfoInFile", Rd_tag = "VERB")), Rd_tag = "\\name"), │ │ │ │ structure(list(structure("getInfoInFile", Rd_tag = "VERB")), Rd_tag = "\\alias"), │ │ │ │ structure(list(structure("manip", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\keyword"), │ │ │ │ structure(list(structure("\n", Rd_tag = "TEXT"), structure(" Get specific information stored in Affymetrix data files (CEL or CDF).\n", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\description"), │ │ │ │ @@ -261,15 +261,15 @@ │ │ │ │ structure(" is in CEL and CDF files in details and that you know what are doing.\n", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\details"), │ │ │ │ structure(list(structure("\n", Rd_tag = "TEXT"), structure(" a character with the value of the 'property'.\n", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\value"), │ │ │ │ structure(list(structure("\n", Rd_tag = "TEXT"), structure(" The code goes through the file until the rigth 'unit' is found. Then\n", Rd_tag = "TEXT"), │ │ │ │ structure(" it looks for the right 'property' further down (eventually going\n", Rd_tag = "TEXT"), │ │ │ │ structure(" through the next units if the property is not found).\n", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\note"), │ │ │ │ structure(list(structure(list(structure("read.celfile", Rd_tag = "RCODE")), Rd_tag = "\\code"), │ │ │ │ structure(", ", Rd_tag = "TEXT"), structure(list(structure("read.cdffile", Rd_tag = "RCODE")), Rd_tag = "\\code"), │ │ │ │ - structure(", ", Rd_tag = "TEXT"), structure(list(structure("whatcdf", Rd_tag = "RCODE")), Rd_tag = "\\code")), Rd_tag = "\\seealso")), Rdfile = "/home/moeller/Salsa/r-bioc-makecdfenv/man/getInfoInAffyFile.Rd", class = "Rd", meta = list( │ │ │ │ + structure(", ", Rd_tag = "TEXT"), structure(list(structure("whatcdf", Rd_tag = "RCODE")), Rd_tag = "\\code")), Rd_tag = "\\seealso")), Rdfile = "/build/reproducible-path/r-bioc-makecdfenv-1.88.0+ds/man/getInfoInAffyFile.Rd", class = "Rd", meta = list( │ │ │ │ docType = character(0), generator = ""), prepared = 3L) │ │ │ │ │ │ │ │ hideOutput (NULL) = NULL │ │ │ │ │ │ │ │ make.cdf.env (list) = structure(list(structure(list(structure("CDF Environment Maker", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\title"), │ │ │ │ structure(list(structure("make.cdf.env", Rd_tag = "VERB")), Rd_tag = "\\name"), │ │ │ │ structure(list(structure("make.cdf.env", Rd_tag = "VERB")), Rd_tag = "\\alias"), │ │ │ │ @@ -347,15 +347,15 @@ │ │ │ │ structure(" and ", Rd_tag = "TEXT"), structure(list(structure("syms", Rd_tag = "RCODE")), Rd_tag = "\\code"), │ │ │ │ structure(". See details.", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\value"), │ │ │ │ structure(list(structure("Rafael A. Irizarry, Wolfgang Huber", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\author"), │ │ │ │ structure(list(structure(list(structure(list(structure("make.cdf.package", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\link")), Rd_tag = "\\code")), Rd_tag = "\\seealso"), │ │ │ │ structure(list(structure("\n", Rd_tag = "RCODE"), structure(" env <- make.cdf.env(\"Hu6800.CDF.gz\",\n", Rd_tag = "RCODE"), │ │ │ │ structure(" cdf.path=system.file(\"extdata\", package=\"makecdfenv\"),\n", Rd_tag = "RCODE"), │ │ │ │ structure(" compress=TRUE)\n", Rd_tag = "RCODE"), │ │ │ │ - structure(" length(ls(env))\n", Rd_tag = "RCODE"), structure(" get(\"U53347_at\", env)\t \n", Rd_tag = "RCODE")), Rd_tag = "\\examples")), Rdfile = "/home/moeller/Salsa/r-bioc-makecdfenv/man/make.cdf.env.Rd", class = "Rd", meta = list( │ │ │ │ + structure(" length(ls(env))\n", Rd_tag = "RCODE"), structure(" get(\"U53347_at\", env)\t \n", Rd_tag = "RCODE")), Rd_tag = "\\examples")), Rdfile = "/build/reproducible-path/r-bioc-makecdfenv-1.88.0+ds/man/make.cdf.env.Rd", class = "Rd", meta = list( │ │ │ │ docType = character(0), generator = ""), prepared = 3L) │ │ │ │ │ │ │ │ make.cdf.package (list) = structure(list(structure(list(structure("CDF Environment Package Maker", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\title"), │ │ │ │ structure(list(structure("make.cdf.package", Rd_tag = "VERB")), Rd_tag = "\\name"), │ │ │ │ structure(list(structure("make.cdf.package", Rd_tag = "VERB")), Rd_tag = "\\alias"), │ │ │ │ structure(list(structure("manip", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\keyword"), │ │ │ │ structure(list(structure("\n", Rd_tag = "TEXT"), structure("This function reads an Affymetrix chip description file (CDF) and\n", Rd_tag = "TEXT"), │ │ │ │ @@ -452,15 +452,15 @@ │ │ │ │ structure(list(structure("Rafael A. Irizarry, Wolfgang Huber", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\author"), │ │ │ │ structure(list(structure(list(structure(list(structure("make.cdf.env", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\link")), Rd_tag = "\\code")), Rd_tag = "\\seealso"), │ │ │ │ structure(list(structure("\n", Rd_tag = "RCODE"), structure(" pkgpath <- tempdir()\n", Rd_tag = "RCODE"), │ │ │ │ structure(" make.cdf.package(\"Hu6800.CDF.gz\",\n", Rd_tag = "RCODE"), │ │ │ │ structure(" cdf.path=system.file(\"extdata\", package=\"makecdfenv\"),\n", Rd_tag = "RCODE"), │ │ │ │ structure(" compress=TRUE, species = \"Homo_sapiens\",\n", Rd_tag = "RCODE"), │ │ │ │ structure("\t package.path = pkgpath)\n", Rd_tag = "RCODE"), │ │ │ │ - structure(" dir(pkgpath)\t \n", Rd_tag = "RCODE")), Rd_tag = "\\examples")), Rdfile = "/home/moeller/Salsa/r-bioc-makecdfenv/man/make.cdf.package.Rd", class = "Rd", meta = list( │ │ │ │ + structure(" dir(pkgpath)\t \n", Rd_tag = "RCODE")), Rd_tag = "\\examples")), Rdfile = "/build/reproducible-path/r-bioc-makecdfenv-1.88.0+ds/man/make.cdf.package.Rd", class = "Rd", meta = list( │ │ │ │ docType = character(0), generator = ""), prepared = 3L) │ │ │ │ │ │ │ │ pmormm (list) = structure(list(structure(list(structure("PM or MM", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\title"), │ │ │ │ structure(list(structure("pmormm", Rd_tag = "VERB")), Rd_tag = "\\name"), │ │ │ │ structure(list(structure("pmormm", Rd_tag = "VERB")), Rd_tag = "\\alias"), │ │ │ │ structure(list(structure("manip", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\keyword"), │ │ │ │ structure(list(structure("\n", Rd_tag = "TEXT"), structure(" Determing if intensities on an array from the cdffile are PM, MM, or neither.\n", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\description"), │ │ │ │ @@ -472,15 +472,15 @@ │ │ │ │ structure(" object", Rd_tag = "TEXT"))), Rd_tag = "\\item"), │ │ │ │ structure("\n", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\arguments"), │ │ │ │ structure(list(structure("\n", Rd_tag = "TEXT"), structure(" The intensities on a chip fall in three categories: perfect match\n", Rd_tag = "TEXT"), │ │ │ │ structure(" (PM), mismatch (MM) or unknown (No information about them is contained\n", Rd_tag = "TEXT"), │ │ │ │ structure(" in the CDF file, yet they were found informative (details to come)).\n", Rd_tag = "TEXT"), │ │ │ │ structure(" PM are coded as TRUE, MM as FALSE and unknown as NA.\n", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\details"), │ │ │ │ structure(list(structure("A matrix (see section 'details').", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\value"), │ │ │ │ - structure(list(structure("L. 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readRDS(args[1])' {} │ │ │ │ │ @@ -1,43 +1,43 @@ │ │ │ │ │ $variables │ │ │ │ │ $variables$`Cdf-class` │ │ │ │ │ -[1] 273 5936 │ │ │ │ │ +[1] 288 5953 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$getInfoInAffyFile │ │ │ │ │ -[1] 6492 1955 │ │ │ │ │ +[1] 6540 1968 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$make.cdf.env │ │ │ │ │ -[1] 8724 3241 │ │ │ │ │ +[1] 8800 3253 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$make.cdf.package │ │ │ │ │ -[1] 12246 3701 │ │ │ │ │ +[1] 12348 3713 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$pmormm │ │ │ │ │ -[1] 16220 1124 │ │ │ │ │ +[1] 16349 1138 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $variables$read.cdffile │ │ │ │ │ -[1] 17622 2180 │ │ │ │ │ +[1] 17778 2194 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $references │ │ │ │ │ $references$`env::1` │ │ │ │ │ -[1] 0 273 │ │ │ │ │ +[1] 0 288 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $references$`env::2` │ │ │ │ │ -[1] 6209 283 │ │ │ │ │ +[1] 6241 299 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $references$`env::3` │ │ │ │ │ -[1] 8447 277 │ │ │ │ │ +[1] 8508 292 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $references$`env::4` │ │ │ │ │ -[1] 11965 281 │ │ │ │ │ +[1] 12053 295 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $references$`env::5` │ │ │ │ │ -[1] 15947 273 │ │ │ │ │ +[1] 16061 288 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $references$`env::6` │ │ │ │ │ -[1] 17344 278 │ │ │ │ │ +[1] 17487 291 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ $compressed │ │ │ │ │ [1] TRUE │ │ ├── ./usr/lib/R/site-library/makecdfenv/help/paths.rds │ │ │ ├── paths.rds-content │ │ │ │ ├── Rscript --vanilla -e 'args <- commandArgs(TRUE); readRDS(args[1])' {} │ │ │ │ │ @@ -1,8 +1,8 @@ │ │ │ │ │ -[1] "/home/moeller/Salsa/r-bioc-makecdfenv/man/Cdf-class.Rd" │ │ │ │ │ -[2] "/home/moeller/Salsa/r-bioc-makecdfenv/man/getInfoInAffyFile.Rd" │ │ │ │ │ -[3] "/home/moeller/Salsa/r-bioc-makecdfenv/man/make.cdf.env.Rd" │ │ │ │ │ -[4] "/home/moeller/Salsa/r-bioc-makecdfenv/man/make.cdf.package.Rd" │ │ │ │ │ -[5] "/home/moeller/Salsa/r-bioc-makecdfenv/man/pmormm.Rd" │ │ │ │ │ -[6] "/home/moeller/Salsa/r-bioc-makecdfenv/man/read.cdffile.Rd" │ │ │ │ │ +[1] "/build/reproducible-path/r-bioc-makecdfenv-1.88.0+ds/man/Cdf-class.Rd" │ │ │ │ │ +[2] "/build/reproducible-path/r-bioc-makecdfenv-1.88.0+ds/man/getInfoInAffyFile.Rd" │ │ │ │ │ +[3] "/build/reproducible-path/r-bioc-makecdfenv-1.88.0+ds/man/make.cdf.env.Rd" │ │ │ │ │ +[4] "/build/reproducible-path/r-bioc-makecdfenv-1.88.0+ds/man/make.cdf.package.Rd" │ │ │ │ │ +[5] "/build/reproducible-path/r-bioc-makecdfenv-1.88.0+ds/man/pmormm.Rd" │ │ │ │ │ +[6] "/build/reproducible-path/r-bioc-makecdfenv-1.88.0+ds/man/read.cdffile.Rd" │ │ │ │ │ attr(,"first") │ │ │ │ │ -[1] 43 │ │ │ │ │ +[1] 58 │ │ ├── ./usr/lib/R/site-library/makecdfenv/libs/makecdfenv.so │ │ │┄ File has been modified after NT_GNU_BUILD_ID has been applied. │ │ │ ├── readelf --wide --notes {} │ │ │ │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Displaying notes found in: .note.gnu.build-id │ │ │ │ Owner Data size Description │ │ │ │ - GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: 0787bcc95ce9d9145f03dbfd594115f24a93424b │ │ │ │ + GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: 1aca7c036fd3bac99fa0ea01bf0b8c9f7be8316b │ │ │ ├── readelf --wide --decompress --hex-dump=.gnu_debuglink {} │ │ │ │ @@ -1,7 +1,7 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Hex dump of section '.gnu_debuglink': │ │ │ │ - 0x00000000 38376263 63393563 65396439 31343566 87bcc95ce9d9145f │ │ │ │ - 0x00000010 30336462 66643539 34313135 66323461 03dbfd594115f24a │ │ │ │ - 0x00000020 39333432 34622e64 65627567 00000000 93424b.debug.... │ │ │ │ - 0x00000030 7d00ed78 }..x │ │ │ │ + 0x00000000 63613763 30333666 64336261 63393966 ca7c036fd3bac99f │ │ │ │ + 0x00000010 61306561 30316266 30623863 39663762 a0ea01bf0b8c9f7b │ │ │ │ + 0x00000020 65383331 36622e64 65627567 00000000 e8316b.debug.... │ │ │ │ + 0x00000030 53564368 SVCh