--- /srv/rebuilderd/tmp/rebuilderdPsQug3/inputs/python3-cctbx_2026.7+ds2+~3.30.0+ds1-1_amd64.deb
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│ │ │ │┄ Files differ
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│ │ │  p49
│ │ │  NsVexplicitly_requested_modules
│ │ │  p50
│ │ │  c__builtin__
│ │ │  set
│ │ │  p51
│ │ │  ((lp52
│ │ │ -Vannlib
│ │ │ +Vannlib_adaptbx
│ │ │  p53
│ │ │ -aVcctbx
│ │ │ +aVcbflib_adaptbx
│ │ │  p54
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│ │ │ +aVcrys3d
│ │ │  p55
│ │ │ -aVomptbx
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│ │ │  p56
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│ │ │  p57
│ │ │ -aVfable
│ │ │ -p58
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│ │ │ +p58
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│ │ │  p59
│ │ │ -aVcrys3d
│ │ │ +aVcctbx
│ │ │  p60
│ │ │ -aVccp4io_adaptbx
│ │ │ +aViotbx
│ │ │  p61
│ │ │ -aVcma_es
│ │ │ +aVfable
│ │ │  p62
│ │ │ -aVgltbx
│ │ │ +aVscitbx
│ │ │  p63
│ │ │ -aVspotfinder
│ │ │ +aVannlib
│ │ │  p64
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│ │ │ +aVxcif
│ │ │  p65
│ │ │ -aVdxtbx
│ │ │ +aVccp4io
│ │ │  p66
│ │ │ -aVsmtbx
│ │ │ +aVgltbx
│ │ │  p67
│ │ │ -aVxcif
│ │ │ -p68
│ │ │  aVboost_adaptbx
│ │ │ +p68
│ │ │ +aVccp4io_adaptbx
│ │ │  p69
│ │ │ -aVccp4io
│ │ │ +aVtbxx
│ │ │  p70
│ │ │ -aVcbflib_adaptbx
│ │ │ +aVlibtbx
│ │ │  p71
│ │ │  aVwxtbx
│ │ │  p72
│ │ │ -aVscitbx
│ │ │ +aVomptbx
│ │ │  p73
│ │ │ -aVrstbx
│ │ │ +aVserialtbx
│ │ │  p74
│ │ │ -aViotbx
│ │ │ +aVdxtbx
│ │ │  p75
│ │ │ -aVannlib_adaptbx
│ │ │ +aVspotfinder
│ │ │  p76
│ │ │  atp77
│ │ │  Rp78
│ │ │  sVbuild_options
│ │ │  p79
│ │ │  g0
│ │ │  (clibtbx.env_config
│ │ │ @@ -644,15 +644,15 @@
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │  Vannlib
│ │ │  p272
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp273
│ │ │  g272
│ │ │ -ag76
│ │ │ +ag53
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp274
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp275
│ │ │  Rp276
│ │ │ @@ -698,15 +698,15 @@
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │  Vcbflib
│ │ │  p292
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp293
│ │ │  g292
│ │ │ -ag71
│ │ │ +ag54
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp294
│ │ │  Nag0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp295
│ │ │  Rp296
│ │ │ @@ -741,15 +741,15 @@
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │  Vccp4io
│ │ │  p308
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp309
│ │ │  g308
│ │ │ -ag61
│ │ │ +ag69
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp310
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp311
│ │ │  Rp312
│ │ │ @@ -833,18 +833,18 @@
│ │ │  Rp343
│ │ │  (dp344
│ │ │  g135
│ │ │  g4
│ │ │  sg136
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │ -g54
│ │ │ +g60
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp345
│ │ │ -g54
│ │ │ +g60
│ │ │  aVcctbx_adaptbx
│ │ │  p346
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp347
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -881,18 +881,18 @@
│ │ │  Rp361
│ │ │  (dp362
│ │ │  g135
│ │ │  g4
│ │ │  sg136
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │ -g60
│ │ │ +g55
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp363
│ │ │ -g60
│ │ │ +g55
│ │ │  aVcrys3d_adaptbx
│ │ │  p364
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp365
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -1065,18 +1065,18 @@
│ │ │  Rp432
│ │ │  (dp433
│ │ │  g135
│ │ │  g4
│ │ │  sg136
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │ -g66
│ │ │ +g75
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp434
│ │ │ -g66
│ │ │ +g75
│ │ │  aVdxtbx_adaptbx
│ │ │  p435
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp436
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -1110,18 +1110,18 @@
│ │ │  Rp449
│ │ │  (dp450
│ │ │  g135
│ │ │  g4
│ │ │  sg136
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
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│ │ │ +g67
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp451
│ │ │ -g63
│ │ │ +g67
│ │ │  aVgltbx_adaptbx
│ │ │  p452
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp453
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -1153,18 +1153,18 @@
│ │ │  Rp465
│ │ │  (dp466
│ │ │  g135
│ │ │  g4
│ │ │  sg136
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │ -g59
│ │ │ +g58
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp467
│ │ │ -g59
│ │ │ +g58
│ │ │  aVmmtbx_adaptbx
│ │ │  p468
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp469
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -1250,18 +1250,18 @@
│ │ │  Rp502
│ │ │  (dp503
│ │ │  g135
│ │ │  g4
│ │ │  sg136
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │ -g74
│ │ │ +g59
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│ │ │  (lp504
│ │ │ -g74
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│ │ │  p505
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp506
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -1297,18 +1297,18 @@
│ │ │  Rp518
│ │ │  (dp519
│ │ │  g135
│ │ │  g4
│ │ │  sg136
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
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│ │ │ +g74
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp520
│ │ │ -g57
│ │ │ +g74
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│ │ │  p521
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp522
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -1381,18 +1381,18 @@
│ │ │  Rp550
│ │ │  (dp551
│ │ │  g135
│ │ │  g4
│ │ │  sg136
│ │ │  g137
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│ │ │  (lp552
│ │ │ -g68
│ │ │ +g65
│ │ │  aVxcif_adaptbx
│ │ │  p553
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp554
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -1435,41 +1435,41 @@
│ │ │  g218
│ │ │  sg238
│ │ │  g236
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│ │ │  sg308
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│ │ │ -sg54
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│ │ │  g343
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│ │ │  g326
│ │ │ -sg60
│ │ │ +sg55
│ │ │  g361
│ │ │ -sg66
│ │ │ +sg75
│ │ │  g432
│ │ │  sg414
│ │ │  g412
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│ │ │  sg396
│ │ │  g394
│ │ │ -sg63
│ │ │ +sg67
│ │ │  g449
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│ │ │ +sg58
│ │ │  g465
│ │ │ -sg74
│ │ │ +sg59
│ │ │  g502
│ │ │  sg486
│ │ │  g484
│ │ │ -sg57
│ │ │ +sg74
│ │ │  g518
│ │ │  sg72
│ │ │  g534
│ │ │ -sg68
│ │ │ +sg65
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│ │ │  ssVmodule_dist_paths
│ │ │  p567
│ │ │  (dp568
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│ │ │  g0
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│ │ │ @@ -1490,15 +1490,15 @@
│ │ │  Rp574
│ │ │  (dp575
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│ │ │  g23
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│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/annlib
│ │ │  p576
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│ │ │ +sbsg53
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp577
│ │ │  Rp578
│ │ │  (dp579
│ │ │  g21
│ │ │ @@ -1586,15 +1586,15 @@
│ │ │  Rp606
│ │ │  (dp607
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/fable
│ │ │  p608
│ │ │ -sbsg71
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│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp609
│ │ │  Rp610
│ │ │  (dp611
│ │ │  g21
│ │ │ @@ -1610,27 +1610,27 @@
│ │ │  Rp614
│ │ │  (dp615
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/ccp4io
│ │ │  p616
│ │ │ -sbsg61
│ │ │ +sbsg69
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│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp617
│ │ │  Rp618
│ │ │  (dp619
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/ccp4io_adaptbx
│ │ │  p620
│ │ │ -sbsg54
│ │ │ +sbsg60
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp621
│ │ │  Rp622
│ │ │  (dp623
│ │ │  g21
│ │ │ @@ -1646,27 +1646,27 @@
│ │ │  Rp626
│ │ │  (dp627
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/chiltbx
│ │ │  p628
│ │ │ -sbsg60
│ │ │ +sbsg55
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp629
│ │ │  Rp630
│ │ │  (dp631
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/crys3d
│ │ │  p632
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│ │ │  (g17
│ │ │  g2
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│ │ │  Rp634
│ │ │  (dp635
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│ │ │  Rp646
│ │ │  (dp647
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
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│ │ │  p648
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│ │ │  (g17
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│ │ │  (dp651
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/gltbx
│ │ │  p652
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│ │ │  (g17
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│ │ │  Ntp653
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│ │ │  (dp655
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│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/mmtbx
│ │ │  p656
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│ │ │ +sbsg59
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│ │ │  (g17
│ │ │  g2
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│ │ │  g21
│ │ │ @@ -1754,15 +1754,15 @@
│ │ │  Rp662
│ │ │  (dp663
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/spotfinder
│ │ │  p664
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│ │ │  (g17
│ │ │  g2
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│ │ │  Rp666
│ │ │  (dp667
│ │ │  g21
│ │ │ @@ -1778,15 +1778,15 @@
│ │ │  Rp670
│ │ │  (dp671
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/wxtbx
│ │ │  p672
│ │ │ -sbsg68
│ │ │ +sbsg65
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp673
│ │ │  Rp674
│ │ │  (dp675
│ │ │  g21
│ │ │ @@ -1806,19 +1806,19 @@
│ │ │  ((lp682
│ │ │  tp683
│ │ │  Rp684
│ │ │  sVmissing_optional
│ │ │  p685
│ │ │  g51
│ │ │  ((lp686
│ │ │ -g479
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│ │ │  ag478
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│ │ │ -ag480
│ │ │  atp687
│ │ │  Rp688
│ │ │  sVscons_dist_path
│ │ │  p689
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -1881,1984 +1881,1984 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp712
│ │ │  Rp713
│ │ │  (dp714
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.wait_for_file
│ │ │ +Vbin/libtbx.exec
│ │ │  p715
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp716
│ │ │  Rp717
│ │ │  (dp718
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/wait_for_file.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/exec.sh
│ │ │  p719
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp720
│ │ │  Rp721
│ │ │  (dp722
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.valgrind
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_untested
│ │ │  p723
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp724
│ │ │  Rp725
│ │ │  (dp726
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/valgrind.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_untested.py
│ │ │  p727
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp728
│ │ │  Rp729
│ │ │  (dp730
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.unpack_in_sources
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_full_command_path
│ │ │  p731
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp732
│ │ │  Rp733
│ │ │  (dp734
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/unpack_in_sources.csh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_full_command_path.py
│ │ │  p735
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp736
│ │ │  Rp737
│ │ │  (dp738
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.tcsh
│ │ │ +Vbin/libtbx.refresh
│ │ │  p739
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp740
│ │ │  Rp741
│ │ │  (dp742
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/tcsh.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/refresh.sh
│ │ │  p743
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp744
│ │ │  Rp745
│ │ │  (dp746
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.start_process
│ │ │ +Vbin/libtbx.printenv
│ │ │  p747
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp748
│ │ │  Rp749
│ │ │  (dp750
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/start_process.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/printenv.py
│ │ │  p751
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp752
│ │ │  Rp753
│ │ │  (dp754
│ │ │  g21
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│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.start_binary_bundle
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_dist_paths
│ │ │  p755
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp756
│ │ │  Rp757
│ │ │  (dp758
│ │ │  g21
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│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/start_binary_bundle.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_dist_paths.py
│ │ │  p759
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp760
│ │ │  Rp761
│ │ │  (dp762
│ │ │  g21
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│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/sphinx.build
│ │ │ +Vbin/libtbx.gdb
│ │ │  p763
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp764
│ │ │  Rp765
│ │ │  (dp766
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/sphinx_build.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/gdb.sh
│ │ │  p767
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp768
│ │ │  Rp769
│ │ │  (dp770
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_variable_names
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_reserved_names
│ │ │  p771
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp772
│ │ │  Rp773
│ │ │  (dp774
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_variable_names.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_reserved_names.py
│ │ │  p775
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp776
│ │ │  Rp777
│ │ │  (dp778
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_tests
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_but_no_repr
│ │ │  p779
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp780
│ │ │  Rp781
│ │ │  (dp782
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_tests.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_but_no_repr.py
│ │ │  p783
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp784
│ │ │  Rp785
│ │ │  (dp786
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_repository_paths
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_in_repositories
│ │ │  p787
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp788
│ │ │  Rp789
│ │ │  (dp790
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_repository_paths.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_in_repositories.py
│ │ │  p791
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp792
│ │ │  Rp793
│ │ │  (dp794
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_pythonpath
│ │ │ +Vbin/libtbx.create_installer
│ │ │  p795
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp796
│ │ │  Rp797
│ │ │  (dp798
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_pythonpath.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_installer.py
│ │ │  p799
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp800
│ │ │  Rp801
│ │ │  (dp802
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_python_sys_executable
│ │ │ +Vbin/libtbx.assert_stdin
│ │ │  p803
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp804
│ │ │  Rp805
│ │ │  (dp806
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_python_sys_executable.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_stdin.py
│ │ │  p807
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp808
│ │ │  Rp809
│ │ │  (dp810
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_python_dependencies
│ │ │ +Vbin/libtbx.clean_clutter
│ │ │  p811
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp812
│ │ │  Rp813
│ │ │  (dp814
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_python_dependencies.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/clean_clutter.py
│ │ │  p815
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp816
│ │ │  Rp817
│ │ │  (dp818
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_numpy_version
│ │ │ +Vbin/libtbx.create_install_script_bat
│ │ │  p819
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp820
│ │ │  Rp821
│ │ │  (dp822
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_numpy_version.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_install_script_bat.py
│ │ │  p823
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp824
│ │ │  Rp825
│ │ │  (dp826
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_numeric_version
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_env
│ │ │  p827
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp828
│ │ │  Rp829
│ │ │  (dp830
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_numeric_version.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_env.py
│ │ │  p831
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp832
│ │ │  Rp833
│ │ │  (dp834
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_number_of_processors
│ │ │ +Vbin/libtbx.run_tests_parallel
│ │ │  p835
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp836
│ │ │  Rp837
│ │ │  (dp838
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_number_of_processors.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/run_tests_parallel.py
│ │ │  p839
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp840
│ │ │  Rp841
│ │ │  (dp842
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_module_dependencies
│ │ │ +Vbin/libtbx.phil
│ │ │  p843
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp844
│ │ │  Rp845
│ │ │  (dp846
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_module_dependencies.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/phil.py
│ │ │  p847
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp848
│ │ │  Rp849
│ │ │  (dp850
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_lib_path
│ │ │ +Vbin/libtbx.resource_monitor_plot
│ │ │  p851
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp852
│ │ │  Rp853
│ │ │  (dp854
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_lib_path.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/resource_monitor_plot.py
│ │ │  p855
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp856
│ │ │  Rp857
│ │ │  (dp858
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_include_paths
│ │ │ +Vbin/libtbx.assert_stdin_ends_with
│ │ │  p859
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp860
│ │ │  Rp861
│ │ │  (dp862
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_include_paths.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_stdin_ends_with.py
│ │ │  p863
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp864
│ │ │  Rp865
│ │ │  (dp866
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_host_and_user
│ │ │ +Vbin/libtbx.bootstrap
│ │ │  p867
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp868
│ │ │  Rp869
│ │ │  (dp870
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_host_and_user.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bootstrap.py
│ │ │  p871
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp872
│ │ │  Rp873
│ │ │  (dp874
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_full_command_path
│ │ │ +Vbin/libtbx.sge_available_slots
│ │ │  p875
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp876
│ │ │  Rp877
│ │ │  (dp878
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_full_command_path.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/sge_available_slots.py
│ │ │  p879
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp880
│ │ │  Rp881
│ │ │  (dp882
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_environ_usage
│ │ │ +Vbin/libtbx.configure
│ │ │  p883
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp884
│ │ │  Rp885
│ │ │  (dp886
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_environ_usage.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/configure.sh
│ │ │  p887
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp888
│ │ │  Rp889
│ │ │  (dp890
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_env
│ │ │ +Vbin/libtbx.dtrace
│ │ │  p891
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp892
│ │ │  Rp893
│ │ │  (dp894
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_env.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/dtrace.py
│ │ │  p895
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp896
│ │ │  Rp897
│ │ │  (dp898
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_dist_paths
│ │ │ +Vbin/libtbx.wait_for_file
│ │ │  p899
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp900
│ │ │  Rp901
│ │ │  (dp902
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_dist_paths.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/wait_for_file.py
│ │ │  p903
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp904
│ │ │  Rp905
│ │ │  (dp906
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_date_and_time
│ │ │ +Vbin/libtbx.remove_unused_imports
│ │ │  p907
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp908
│ │ │  Rp909
│ │ │  (dp910
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_date_and_time.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/remove_unused_imports.py
│ │ │  p911
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp912
│ │ │  Rp913
│ │ │  (dp914
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_commands
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_module_dependencies
│ │ │  p915
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp916
│ │ │  Rp917
│ │ │  (dp918
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_commands.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_module_dependencies.py
│ │ │  p919
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp920
│ │ │  Rp921
│ │ │  (dp922
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_but_no_repr
│ │ │ +Vbin/libtbx.check_libcpp
│ │ │  p923
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp924
│ │ │  Rp925
│ │ │  (dp926
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_but_no_repr.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/check_libcpp.py
│ │ │  p927
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp928
│ │ │  Rp929
│ │ │  (dp930
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_build_path
│ │ │ +Vbin/libtbx.seconds_since_the_epoch
│ │ │  p931
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp932
│ │ │  Rp933
│ │ │  (dp934
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_build_path.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/seconds_since_the_epoch.py
│ │ │  p935
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp936
│ │ │  Rp937
│ │ │  (dp938
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_build_options
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_host_and_user
│ │ │  p939
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp940
│ │ │  Rp941
│ │ │  (dp942
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_build_options.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_host_and_user.py
│ │ │  p943
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp944
│ │ │  Rp945
│ │ │  (dp946
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_bin_path
│ │ │ +Vbin/libtbx.list_modules
│ │ │  p947
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp948
│ │ │  Rp949
│ │ │  (dp950
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_bin_path.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/list_modules.py
│ │ │  p951
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp952
│ │ │  Rp953
│ │ │  (dp954
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_all_on_path
│ │ │ +Vbin/libtbx.line_count
│ │ │  p955
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp956
│ │ │  Rp957
│ │ │  (dp958
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_all_on_path.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/line_count.py
│ │ │  p959
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp960
│ │ │  Rp961
│ │ │  (dp962
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.sh
│ │ │ +Vbin/libtbx.easy_qsub
│ │ │  p963
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp964
│ │ │  Rp965
│ │ │  (dp966
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/sh.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/easy_qsub.py
│ │ │  p967
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp968
│ │ │  Rp969
│ │ │  (dp970
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.sge_qstat_counts
│ │ │ +Vbin/libtbx.assert_line_count
│ │ │  p971
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp972
│ │ │  Rp973
│ │ │  (dp974
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/sge_qstat_counts.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_line_count.py
│ │ │  p975
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp976
│ │ │  Rp977
│ │ │  (dp978
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.sge_available_slots
│ │ │ +Vbin/libtbx.tcsh
│ │ │  p979
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp980
│ │ │  Rp981
│ │ │  (dp982
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/sge_available_slots.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/tcsh.sh
│ │ │  p983
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp984
│ │ │  Rp985
│ │ │  (dp986
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.seconds_since_the_epoch
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_lib_path
│ │ │  p987
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp988
│ │ │  Rp989
│ │ │  (dp990
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/seconds_since_the_epoch.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_lib_path.py
│ │ │  p991
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp992
│ │ │  Rp993
│ │ │  (dp994
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.scons
│ │ │ +Vbin/libtbx.list_source_files_sorted_by_size
│ │ │  p995
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp996
│ │ │  Rp997
│ │ │  (dp998
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/scons.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/list_source_files_sorted_by_size.py
│ │ │  p999
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1000
│ │ │  Rp1001
│ │ │  (dp1002
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.run_tests_parallel
│ │ │ +Vbin/libtbx.assert_stdin_contains_strings
│ │ │  p1003
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1004
│ │ │  Rp1005
│ │ │  (dp1006
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/run_tests_parallel.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_stdin_contains_strings.py
│ │ │  p1007
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1008
│ │ │  Rp1009
│ │ │  (dp1010
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.run_pickled_function
│ │ │ +Vbin/libtbx.assert_stdin_does_not_contain_strings
│ │ │  p1011
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1012
│ │ │  Rp1013
│ │ │  (dp1014
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/run_pickled_function.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_stdin_contains_strings.py
│ │ │  p1015
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1016
│ │ │  Rp1017
│ │ │  (dp1018
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.resource_monitor_plot
│ │ │ +Vbin/libtbx.add_docstrings_with_ai
│ │ │  p1019
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1020
│ │ │  Rp1021
│ │ │  (dp1022
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/resource_monitor_plot.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/add_docstrings_with_ai.py
│ │ │  p1023
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1024
│ │ │  Rp1025
│ │ │  (dp1026
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.remove_unused_imports
│ │ │ +Vbin/libtbx.reindent
│ │ │  p1027
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1028
│ │ │  Rp1029
│ │ │  (dp1030
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/remove_unused_imports.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/reindent.py
│ │ │  p1031
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1032
│ │ │  Rp1033
│ │ │  (dp1034
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.remove_tree
│ │ │ +Vbin/libtbx.any2unix
│ │ │  p1035
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1036
│ │ │  Rp1037
│ │ │  (dp1038
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/remove_tree.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/any2unix.py
│ │ │  p1039
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1040
│ │ │  Rp1041
│ │ │  (dp1042
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.remote_processing
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_date_and_time
│ │ │  p1043
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1044
│ │ │  Rp1045
│ │ │  (dp1046
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/remote_processing.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_date_and_time.py
│ │ │  p1047
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1048
│ │ │  Rp1049
│ │ │  (dp1050
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.reindent
│ │ │ +Vbin/libtbx.clear_paths
│ │ │  p1051
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1052
│ │ │  Rp1053
│ │ │  (dp1054
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/reindent.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/clear_paths.py
│ │ │  p1055
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1056
│ │ │  Rp1057
│ │ │  (dp1058
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.refresh
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_clutter
│ │ │  p1059
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1060
│ │ │  Rp1061
│ │ │  (dp1062
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/refresh.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_clutter.py
│ │ │  p1063
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1064
│ │ │  Rp1065
│ │ │  (dp1066
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.raise_exception_for_testing
│ │ │ +Vbin/libtbx.bibtex
│ │ │  p1067
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1068
│ │ │  Rp1069
│ │ │  (dp1070
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/raise_exception_for_testing.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bibtex.sh
│ │ │  p1071
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1072
│ │ │  Rp1073
│ │ │  (dp1074
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.py_compile_all
│ │ │ +Vbin/libtbx.bundle_as_exe
│ │ │  p1075
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1076
│ │ │  Rp1077
│ │ │  (dp1078
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/py_compile_all.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bundle_as_exe.py
│ │ │  p1079
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1080
│ │ │  Rp1081
│ │ │  (dp1082
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.printenv
│ │ │ +Vbin/libtbx.assert_not_show_diff
│ │ │  p1083
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1084
│ │ │  Rp1085
│ │ │  (dp1086
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/printenv.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_not_show_diff.py
│ │ │  p1087
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1088
│ │ │  Rp1089
│ │ │  (dp1090
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.prime_factors_of
│ │ │ +Vbin/libtbx.start_binary_bundle
│ │ │  p1091
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1092
│ │ │  Rp1093
│ │ │  (dp1094
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/prime_factors_of.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/start_binary_bundle.py
│ │ │  p1095
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1096
│ │ │  Rp1097
│ │ │  (dp1098
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.phil
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_under_build
│ │ │  p1099
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1100
│ │ │  Rp1101
│ │ │  (dp1102
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/phil.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_under_build.py
│ │ │  p1103
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1104
│ │ │  Rp1105
│ │ │  (dp1106
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.pdflatex
│ │ │ +Vbin/libtbx.start_process
│ │ │  p1107
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1108
│ │ │  Rp1109
│ │ │  (dp1110
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/pdflatex.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/start_process.py
│ │ │  p1111
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1112
│ │ │  Rp1113
│ │ │  (dp1114
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.path_utility
│ │ │ +Vbin/libtbx.create_mac_app
│ │ │  p1115
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1116
│ │ │  Rp1117
│ │ │  (dp1118
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/path_utility.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_mac_app.py
│ │ │  p1119
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1120
│ │ │  Rp1121
│ │ │  (dp1122
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.parallel_simple
│ │ │ +Vbin/libtbx.import_all_python
│ │ │  p1123
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1124
│ │ │  Rp1125
│ │ │  (dp1126
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/parallel_simple.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/import_all_python.py
│ │ │  p1127
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1128
│ │ │  Rp1129
│ │ │  (dp1130
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.nequal
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_number_of_processors
│ │ │  p1131
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1132
│ │ │  Rp1133
│ │ │  (dp1134
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/nequal.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_number_of_processors.py
│ │ │  p1135
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1136
│ │ │  Rp1137
│ │ │  (dp1138
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.make_sphinx_html
│ │ │ +Vbin/libtbx.pdflatex
│ │ │  p1139
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1140
│ │ │  Rp1141
│ │ │  (dp1142
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/make_sphinx_html.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/pdflatex.sh
│ │ │  p1143
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1144
│ │ │  Rp1145
│ │ │  (dp1146
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.make_dist
│ │ │ +Vbin/libtbx.remote_processing
│ │ │  p1147
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1148
│ │ │  Rp1149
│ │ │  (dp1150
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/make_dist.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/remote_processing.py
│ │ │  p1151
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1152
│ │ │  Rp1153
│ │ │  (dp1154
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.list_source_files_sorted_by_size
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_repository_paths
│ │ │  p1155
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1156
│ │ │  Rp1157
│ │ │  (dp1158
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/list_source_files_sorted_by_size.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_repository_paths.py
│ │ │  p1159
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1160
│ │ │  Rp1161
│ │ │  (dp1162
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.list_modules
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_numeric_version
│ │ │  p1163
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1164
│ │ │  Rp1165
│ │ │  (dp1166
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/list_modules.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_numeric_version.py
│ │ │  p1167
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1168
│ │ │  Rp1169
│ │ │  (dp1170
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.list_files
│ │ │ +Vbin/libtbx.help
│ │ │  p1171
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1172
│ │ │  Rp1173
│ │ │  (dp1174
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/list_files.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/help.py
│ │ │  p1175
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1176
│ │ │  Rp1177
│ │ │  (dp1178
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.line_count
│ │ │ +Vbin/libtbx.csh
│ │ │  p1179
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1180
│ │ │  Rp1181
│ │ │  (dp1182
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/line_count.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/csh.sh
│ │ │  p1183
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1184
│ │ │  Rp1185
│ │ │  (dp1186
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.latex
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_include_paths
│ │ │  p1187
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1188
│ │ │  Rp1189
│ │ │  (dp1190
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/latex.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_include_paths.py
│ │ │  p1191
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1192
│ │ │  Rp1193
│ │ │  (dp1194
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.install_conda
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_build_path
│ │ │  p1195
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1196
│ │ │  Rp1197
│ │ │  (dp1198
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/install_conda.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_build_path.py
│ │ │  p1199
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1200
│ │ │  Rp1201
│ │ │  (dp1202
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.install
│ │ │ +Vbin/libtbx.parallel_simple
│ │ │  p1203
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1204
│ │ │  Rp1205
│ │ │  (dp1206
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/install.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/parallel_simple.py
│ │ │  p1207
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1208
│ │ │  Rp1209
│ │ │  (dp1210
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.import_all_python
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_unused_imports
│ │ │  p1211
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1212
│ │ │  Rp1213
│ │ │  (dp1214
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/import_all_python.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_unused_imports.py
│ │ │  p1215
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1216
│ │ │  Rp1217
│ │ │  (dp1218
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.import_all_ext
│ │ │ +Vbin/libtbx.create_windows_exe
│ │ │  p1219
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1220
│ │ │  Rp1221
│ │ │  (dp1222
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/import_all_ext.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_windows_exe.py
│ │ │  p1223
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1224
│ │ │  Rp1225
│ │ │  (dp1226
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.help
│ │ │ +Vbin/libtbx.env_run
│ │ │  p1227
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1228
│ │ │  Rp1229
│ │ │  (dp1230
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/help.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/env_run.py
│ │ │  p1231
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1232
│ │ │  Rp1233
│ │ │  (dp1234
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.git_avoid_merges
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_python_dependencies
│ │ │  p1235
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1236
│ │ │  Rp1237
│ │ │  (dp1238
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/git_avoid_merges.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_python_dependencies.py
│ │ │  p1239
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1240
│ │ │  Rp1241
│ │ │  (dp1242
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.gdb
│ │ │ +Vbin/libtbx.nequal
│ │ │  p1243
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1244
│ │ │  Rp1245
│ │ │  (dp1246
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/gdb.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/nequal.py
│ │ │  p1247
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1248
│ │ │  Rp1249
│ │ │  (dp1250
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_unused_imports_crude
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_commands
│ │ │  p1251
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1252
│ │ │  Rp1253
│ │ │  (dp1254
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_unused_imports_crude.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_commands.py
│ │ │  p1255
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1256
│ │ │  Rp1257
│ │ │  (dp1258
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_unused_imports
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_build_options
│ │ │  p1259
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1260
│ │ │  Rp1261
│ │ │  (dp1262
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_unused_imports.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_build_options.py
│ │ │  p1263
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1264
│ │ │  Rp1265
│ │ │  (dp1266
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_untested
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_all_on_path
│ │ │  p1267
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1268
│ │ │  Rp1269
│ │ │  (dp1270
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_untested.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_all_on_path.py
│ │ │  p1271
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1272
│ │ │  Rp1273
│ │ │  (dp1274
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_under_build
│ │ │ +Vbin/libtbx.analyse_code_comments
│ │ │  p1275
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1276
│ │ │  Rp1277
│ │ │  (dp1278
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_under_build.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/analyse_code_comments.py
│ │ │  p1279
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1280
│ │ │  Rp1281
│ │ │  (dp1282
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_reserved_names
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_pdb_mmcif_problems
│ │ │  p1283
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1284
│ │ │  Rp1285
│ │ │  (dp1286
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_reserved_names.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_pdb_mmcif_problems.py
│ │ │  p1287
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1288
│ │ │  Rp1289
│ │ │  (dp1290
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_pdb_mmcif_problems
│ │ │ +Vbin/libtbx.install
│ │ │  p1291
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1292
│ │ │  Rp1293
│ │ │  (dp1294
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_pdb_mmcif_problems.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/install.py
│ │ │  p1295
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1296
│ │ │  Rp1297
│ │ │  (dp1298
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_old_style_classes
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_pythonpath
│ │ │  p1299
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1300
│ │ │  Rp1301
│ │ │  (dp1302
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_old_style_classes.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_pythonpath.py
│ │ │  p1303
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1304
│ │ │  Rp1305
│ │ │  (dp1306
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_in_repositories
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_old_style_classes
│ │ │  p1307
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1308
│ │ │  Rp1309
│ │ │  (dp1310
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_in_repositories.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_old_style_classes.py
│ │ │  p1311
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1312
│ │ │  Rp1313
│ │ │  (dp1314
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_files
│ │ │ +Vbin/sphinx.build
│ │ │  p1315
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1316
│ │ │  Rp1317
│ │ │  (dp1318
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_files.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/sphinx_build.py
│ │ │  p1319
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1320
│ │ │  Rp1321
│ │ │  (dp1322
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_clutter
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_python_sys_executable
│ │ │  p1323
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1324
│ │ │  Rp1325
│ │ │  (dp1326
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_clutter.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_python_sys_executable.py
│ │ │  p1327
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1328
│ │ │  Rp1329
│ │ │  (dp1330
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.extract_code_from_txt
│ │ │ +Vbin/libtbx.epydoc_run
│ │ │  p1331
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1332
│ │ │  Rp1333
│ │ │  (dp1334
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/extract_code_from_txt.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/epydoc_run.py
│ │ │  p1335
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1336
│ │ │  Rp1337
│ │ │  (dp1338
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.exec
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_numpy_version
│ │ │  p1339
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1340
│ │ │  Rp1341
│ │ │  (dp1342
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/exec.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_numpy_version.py
│ │ │  p1343
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1344
│ │ │  Rp1345
│ │ │  (dp1346
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.epydoc_run
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_unused_imports_crude
│ │ │  p1347
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1348
│ │ │  Rp1349
│ │ │  (dp1350
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/epydoc_run.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_unused_imports_crude.py
│ │ │  p1351
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1352
│ │ │  Rp1353
│ │ │  (dp1354
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.env_run
│ │ │ +Vbin/libtbx.run_pickled_function
│ │ │  p1355
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1356
│ │ │  Rp1357
│ │ │  (dp1358
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/env_run.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/run_pickled_function.py
│ │ │  p1359
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1360
│ │ │  Rp1361
│ │ │  (dp1362
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.easy_qsub
│ │ │ +Vbin/libtbx.scons
│ │ │  p1363
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1364
│ │ │  Rp1365
│ │ │  (dp1366
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/easy_qsub.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/scons.py
│ │ │  p1367
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1368
│ │ │  Rp1369
│ │ │  (dp1370
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.dtrace
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_tests
│ │ │  p1371
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1372
│ │ │  Rp1373
│ │ │  (dp1374
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/dtrace.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_tests.py
│ │ │  p1375
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1376
│ │ │  Rp1377
│ │ │  (dp1378
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.csh
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_bin_path
│ │ │  p1379
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1380
│ │ │  Rp1381
│ │ │  (dp1382
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/csh.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_bin_path.py
│ │ │  p1383
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1384
│ │ │  Rp1385
│ │ │  (dp1386
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.create_windows_exe
│ │ │ +Vbin/libtbx.raise_exception_for_testing
│ │ │  p1387
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1388
│ │ │  Rp1389
│ │ │  (dp1390
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_windows_exe.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/raise_exception_for_testing.py
│ │ │  p1391
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1392
│ │ │  Rp1393
│ │ │  (dp1394
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.create_unzipsfx
│ │ │ +Vbin/libtbx.unpack_in_sources
│ │ │  p1395
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1396
│ │ │  Rp1397
│ │ │  (dp1398
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_unzipsfx.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/unpack_in_sources.csh
│ │ │  p1399
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1400
│ │ │  Rp1401
│ │ │  (dp1402
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.create_selfx
│ │ │ +Vbin/libtbx.remove_tree
│ │ │  p1403
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1404
│ │ │  Rp1405
│ │ │  (dp1406
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_selfx.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/remove_tree.py
│ │ │  p1407
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1408
│ │ │  Rp1409
│ │ │  (dp1410
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.create_mac_app
│ │ │ +Vbin/libtbx.py_compile_all
│ │ │  p1411
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1412
│ │ │  Rp1413
│ │ │  (dp1414
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_mac_app.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/py_compile_all.py
│ │ │  p1415
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1416
│ │ │  Rp1417
│ │ │  (dp1418
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.create_installer
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_variable_names
│ │ │  p1419
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1420
│ │ │  Rp1421
│ │ │  (dp1422
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_installer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_variable_names.py
│ │ │  p1423
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1424
│ │ │  Rp1425
│ │ │  (dp1426
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.create_install_script_bat
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_files
│ │ │  p1427
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1428
│ │ │  Rp1429
│ │ │  (dp1430
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_install_script_bat.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_files.py
│ │ │  p1431
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1432
│ │ │  Rp1433
│ │ │  (dp1434
│ │ │ @@ -3883,92 +3883,92 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1440
│ │ │  Rp1441
│ │ │  (dp1442
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.configure
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_environ_usage
│ │ │  p1443
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1444
│ │ │  Rp1445
│ │ │  (dp1446
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/configure.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_environ_usage.py
│ │ │  p1447
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1448
│ │ │  Rp1449
│ │ │  (dp1450
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.clear_paths
│ │ │ +Vbin/libtbx.create_unzipsfx
│ │ │  p1451
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1452
│ │ │  Rp1453
│ │ │  (dp1454
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/clear_paths.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_unzipsfx.py
│ │ │  p1455
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1456
│ │ │  Rp1457
│ │ │  (dp1458
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.clean_clutter
│ │ │ +Vbin/libtbx.make_sphinx_html
│ │ │  p1459
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1460
│ │ │  Rp1461
│ │ │  (dp1462
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/clean_clutter.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/make_sphinx_html.py
│ │ │  p1463
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1464
│ │ │  Rp1465
│ │ │  (dp1466
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.check_libcpp
│ │ │ +Vbin/libtbx.git_avoid_merges
│ │ │  p1467
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1468
│ │ │  Rp1469
│ │ │  (dp1470
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/check_libcpp.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/git_avoid_merges.py
│ │ │  p1471
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1472
│ │ │  Rp1473
│ │ │  (dp1474
│ │ │ @@ -3993,312 +3993,312 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1480
│ │ │  Rp1481
│ │ │  (dp1482
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.bundle_as_selfx
│ │ │ +Vbin/libtbx.create_selfx
│ │ │  p1483
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1484
│ │ │  Rp1485
│ │ │  (dp1486
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bundle_as_selfx.csh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_selfx.py
│ │ │  p1487
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1488
│ │ │  Rp1489
│ │ │  (dp1490
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.bundle_as_exe
│ │ │ +Vbin/libtbx.valgrind
│ │ │  p1491
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1492
│ │ │  Rp1493
│ │ │  (dp1494
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bundle_as_exe.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/valgrind.sh
│ │ │  p1495
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1496
│ │ │  Rp1497
│ │ │  (dp1498
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.bootstrap
│ │ │ +Vbin/libtbx.latex
│ │ │  p1499
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1500
│ │ │  Rp1501
│ │ │  (dp1502
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bootstrap.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/latex.sh
│ │ │  p1503
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1504
│ │ │  Rp1505
│ │ │  (dp1506
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.bibtex
│ │ │ +Vbin/libtbx.make_dist
│ │ │  p1507
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1508
│ │ │  Rp1509
│ │ │  (dp1510
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bibtex.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/make_dist.py
│ │ │  p1511
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1512
│ │ │  Rp1513
│ │ │  (dp1514
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.bash
│ │ │ +Vbin/libtbx.extract_code_from_txt
│ │ │  p1515
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1516
│ │ │  Rp1517
│ │ │  (dp1518
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bash.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/extract_code_from_txt.py
│ │ │  p1519
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1520
│ │ │  Rp1521
│ │ │  (dp1522
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.assert_stdin_ends_with
│ │ │ +Vbin/libtbx.bundle_as_selfx
│ │ │  p1523
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1524
│ │ │  Rp1525
│ │ │  (dp1526
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_stdin_ends_with.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bundle_as_selfx.csh
│ │ │  p1527
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1528
│ │ │  Rp1529
│ │ │  (dp1530
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.assert_stdin_contains_strings
│ │ │ +Vbin/libtbx.install_conda
│ │ │  p1531
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1532
│ │ │  Rp1533
│ │ │  (dp1534
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_stdin_contains_strings.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/install_conda.py
│ │ │  p1535
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1536
│ │ │  Rp1537
│ │ │  (dp1538
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.assert_stdin_does_not_contain_strings
│ │ │ +Vbin/libtbx.prime_factors_of
│ │ │  p1539
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1540
│ │ │  Rp1541
│ │ │  (dp1542
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_stdin_contains_strings.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/prime_factors_of.py
│ │ │  p1543
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1544
│ │ │  Rp1545
│ │ │  (dp1546
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.assert_stdin
│ │ │ +Vbin/libtbx.list_files
│ │ │  p1547
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1548
│ │ │  Rp1549
│ │ │  (dp1550
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_stdin.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/list_files.py
│ │ │  p1551
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1552
│ │ │  Rp1553
│ │ │  (dp1554
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.assert_not_show_diff
│ │ │ +Vbin/libtbx.sh
│ │ │  p1555
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1556
│ │ │  Rp1557
│ │ │  (dp1558
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_not_show_diff.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/sh.sh
│ │ │  p1559
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1560
│ │ │  Rp1561
│ │ │  (dp1562
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.assert_line_count
│ │ │ +Vbin/libtbx.path_utility
│ │ │  p1563
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1564
│ │ │  Rp1565
│ │ │  (dp1566
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_line_count.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/path_utility.py
│ │ │  p1567
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1568
│ │ │  Rp1569
│ │ │  (dp1570
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.any2unix
│ │ │ +Vbin/libtbx.import_all_ext
│ │ │  p1571
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1572
│ │ │  Rp1573
│ │ │  (dp1574
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/any2unix.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/import_all_ext.py
│ │ │  p1575
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1576
│ │ │  Rp1577
│ │ │  (dp1578
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.analyse_code_comments
│ │ │ +Vbin/libtbx.bash
│ │ │  p1579
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1580
│ │ │  Rp1581
│ │ │  (dp1582
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/analyse_code_comments.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bash.sh
│ │ │  p1583
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1584
│ │ │  Rp1585
│ │ │  (dp1586
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.add_docstrings_with_ai
│ │ │ +Vbin/libtbx.sge_qstat_counts
│ │ │  p1587
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1588
│ │ │  Rp1589
│ │ │  (dp1590
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/add_docstrings_with_ai.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/sge_qstat_counts.py
│ │ │  p1591
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1592
│ │ │  Rp1593
│ │ │  (dp1594
│ │ │ @@ -4323,466 +4323,466 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1600
│ │ │  Rp1601
│ │ │  (dp1602
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost_adaptbx.show_environ_usage
│ │ │ +Vbin/boost_adaptbx.double_overflow
│ │ │  p1603
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1604
│ │ │  Rp1605
│ │ │  (dp1606
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/show_environ_usage.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/double_overflow.py
│ │ │  p1607
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1608
│ │ │  Rp1609
│ │ │  (dp1610
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost_adaptbx.segmentation_fault
│ │ │ +Vbin/boost.gcd
│ │ │  p1611
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1612
│ │ │  Rp1613
│ │ │  (dp1614
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/segmentation_fault.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/gcd.py
│ │ │  p1615
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1616
│ │ │  Rp1617
│ │ │  (dp1618
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost_adaptbx.nested_cpp_loops_with_check_signals
│ │ │ +Vbin/boost.lcm
│ │ │  p1619
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1620
│ │ │  Rp1621
│ │ │  (dp1622
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/nested_cpp_loops_with_check_signals.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/lcm.py
│ │ │  p1623
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1624
│ │ │  Rp1625
│ │ │  (dp1626
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost.lcm
│ │ │ +Vbin/boost_adaptbx.nested_cpp_loops_with_check_signals
│ │ │  p1627
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1628
│ │ │  Rp1629
│ │ │  (dp1630
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/lcm.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/nested_cpp_loops_with_check_signals.py
│ │ │  p1631
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1632
│ │ │  Rp1633
│ │ │  (dp1634
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost_adaptbx.int_overflow
│ │ │ +Vbin/boost_adaptbx.divide_by_zero
│ │ │  p1635
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1636
│ │ │  Rp1637
│ │ │  (dp1638
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/int_overflow.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/divide_by_zero.py
│ │ │  p1639
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1640
│ │ │  Rp1641
│ │ │  (dp1642
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost_adaptbx.inexact
│ │ │ +Vbin/boost_adaptbx.int_overflow
│ │ │  p1643
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1644
│ │ │  Rp1645
│ │ │  (dp1646
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/inexact.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/int_overflow.py
│ │ │  p1647
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1648
│ │ │  Rp1649
│ │ │  (dp1650
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost.gcd
│ │ │ +Vbin/boost_adaptbx.inexact
│ │ │  p1651
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1652
│ │ │  Rp1653
│ │ │  (dp1654
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/gcd.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/inexact.py
│ │ │  p1655
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1656
│ │ │  Rp1657
│ │ │  (dp1658
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost_adaptbx.double_overflow
│ │ │ +Vbin/boost_adaptbx.segmentation_fault
│ │ │  p1659
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1660
│ │ │  Rp1661
│ │ │  (dp1662
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/double_overflow.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/segmentation_fault.py
│ │ │  p1663
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1664
│ │ │  Rp1665
│ │ │  (dp1666
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost_adaptbx.divide_by_zero
│ │ │ +Vbin/boost_adaptbx.show_environ_usage
│ │ │  p1667
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1668
│ │ │  Rp1669
│ │ │  (dp1670
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/divide_by_zero.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/show_environ_usage.py
│ │ │  p1671
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1672
│ │ │  Rp1673
│ │ │  (dp1674
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/fable.split
│ │ │ +Vbin/fable.show_calls
│ │ │  p1675
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1676
│ │ │  Rp1677
│ │ │  (dp1678
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/split.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/show_calls.py
│ │ │  p1679
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1680
│ │ │  Rp1681
│ │ │  (dp1682
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/fable.show_calls
│ │ │ +Vbin/fable.split
│ │ │  p1683
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1684
│ │ │  Rp1685
│ │ │  (dp1686
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/show_calls.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/split.py
│ │ │  p1687
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1688
│ │ │  Rp1689
│ │ │  (dp1690
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/fable.read
│ │ │ +Vbin/fable.cout
│ │ │  p1691
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1692
│ │ │  Rp1693
│ │ │  (dp1694
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/read.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/cout.py
│ │ │  p1695
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1696
│ │ │  Rp1697
│ │ │  (dp1698
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/fable.insert_write_at_start_of_each_procedure
│ │ │ +Vbin/fable.read
│ │ │  p1699
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1700
│ │ │  Rp1701
│ │ │  (dp1702
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/insert_write_at_start_of_each_procedure.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/read.py
│ │ │  p1703
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1704
│ │ │  Rp1705
│ │ │  (dp1706
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/fable.fem_include_search_paths
│ │ │ +Vbin/fable.insert_write_at_start_of_each_procedure
│ │ │  p1707
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1708
│ │ │  Rp1709
│ │ │  (dp1710
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/fem_include_search_paths.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/insert_write_at_start_of_each_procedure.py
│ │ │  p1711
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1712
│ │ │  Rp1713
│ │ │  (dp1714
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/fable.cout
│ │ │ +Vbin/fable.fem_include_search_paths
│ │ │  p1715
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1716
│ │ │  Rp1717
│ │ │  (dp1718
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/cout.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/fem_include_search_paths.py
│ │ │  p1719
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1720
│ │ │  Rp1721
│ │ │  (dp1722
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/scitbx.unicode_examples
│ │ │ +Vbin/scitbx.show_sizes
│ │ │  p1723
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1724
│ │ │  Rp1725
│ │ │  (dp1726
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/unicode_examples.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/show_sizes.py
│ │ │  p1727
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1728
│ │ │  Rp1729
│ │ │  (dp1730
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/scitbx.show_sizes
│ │ │ +Vbin/scitbx.histogram
│ │ │  p1731
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1732
│ │ │  Rp1733
│ │ │  (dp1734
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/show_sizes.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/histogram.py
│ │ │  p1735
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1736
│ │ │  Rp1737
│ │ │  (dp1738
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/scitbx.show_exp_times
│ │ │ +Vbin/scitbx.generate_error_h
│ │ │  p1739
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1740
│ │ │  Rp1741
│ │ │  (dp1742
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/show_exp_times.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/generate_error_h.py
│ │ │  p1743
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1744
│ │ │  Rp1745
│ │ │  (dp1746
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/scitbx.histogram
│ │ │ +Vbin/scitbx.show_exp_times
│ │ │  p1747
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1748
│ │ │  Rp1749
│ │ │  (dp1750
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/histogram.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/show_exp_times.py
│ │ │  p1751
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1752
│ │ │  Rp1753
│ │ │  (dp1754
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/scitbx.generate_error_h
│ │ │ +Vbin/scitbx.apply_tapenade_hints
│ │ │  p1755
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1756
│ │ │  Rp1757
│ │ │  (dp1758
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/generate_error_h.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/apply_tapenade_hints.py
│ │ │  p1759
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1760
│ │ │  Rp1761
│ │ │  (dp1762
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/scitbx.apply_tapenade_hints
│ │ │ +Vbin/scitbx.unicode_examples
│ │ │  p1763
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1764
│ │ │  Rp1765
│ │ │  (dp1766
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/apply_tapenade_hints.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/unicode_examples.py
│ │ │  p1767
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1768
│ │ │  Rp1769
│ │ │  (dp1770
│ │ │ @@ -4807,928 +4807,928 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1776
│ │ │  Rp1777
│ │ │  (dp1778
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.web.install
│ │ │ +Vbin/phenix.form_factor_query
│ │ │  p1779
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1780
│ │ │  Rp1781
│ │ │  (dp1782
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/web.install.csh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/form_factor_query.py
│ │ │  p1783
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1784
│ │ │  Rp1785
│ │ │  (dp1786
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.wavelength_units
│ │ │ +Vbin/cctbx_regression.test_nightly
│ │ │  p1787
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1788
│ │ │  Rp1789
│ │ │  (dp1790
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/wavelength_units.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/cctbx_test_nightly.py
│ │ │  p1791
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1792
│ │ │  Rp1793
│ │ │  (dp1794
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.version
│ │ │ +Vbin/cctbx.cod_select_and_pickle
│ │ │  p1795
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1796
│ │ │  Rp1797
│ │ │  (dp1798
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/version.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/cod_select_and_pickle.py
│ │ │  p1799
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1800
│ │ │  Rp1801
│ │ │  (dp1802
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.subgroups
│ │ │ +Vbin/samosa.join
│ │ │  p1803
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1804
│ │ │  Rp1805
│ │ │  (dp1806
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/subgroups.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/samosa_join.py
│ │ │  p1807
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1808
│ │ │  Rp1809
│ │ │  (dp1810
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.structure_factor_timings
│ │ │ +Vbin/samosa.scale
│ │ │  p1811
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1812
│ │ │  Rp1813
│ │ │  (dp1814
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/structure_factor_timings.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/samosa_scale.py
│ │ │  p1815
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1816
│ │ │  Rp1817
│ │ │  (dp1818
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.space_group_info
│ │ │ +Vbin/cctbx.euclidean_model_matching
│ │ │  p1819
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1820
│ │ │  Rp1821
│ │ │  (dp1822
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/space_group_info.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/euclidean_model_matching.py
│ │ │  p1823
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1824
│ │ │  Rp1825
│ │ │  (dp1826
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.segment_and_split_map
│ │ │ +Vbin/cctbx.eltbx.show_fp_fdp
│ │ │  p1827
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1828
│ │ │  Rp1829
│ │ │  (dp1830
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/segment_and_split_map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/eltbx.show_fp_fdp.py
│ │ │  p1831
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1832
│ │ │  Rp1833
│ │ │  (dp1834
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/samosa.scale
│ │ │ +Vbin/phenix.diffuse
│ │ │  p1835
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1836
│ │ │  Rp1837
│ │ │  (dp1838
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/samosa_scale.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/diffuse.py
│ │ │  p1839
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1840
│ │ │  Rp1841
│ │ │  (dp1842
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/samosa.join
│ │ │ +Vbin/cctbx.brehm_diederichs
│ │ │  p1843
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1844
│ │ │  Rp1845
│ │ │  (dp1846
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/samosa_join.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/brehm_diederichs.py
│ │ │  p1847
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1848
│ │ │  Rp1849
│ │ │  (dp1850
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.development.qscore
│ │ │ +Vbin/cctbx.precession_view
│ │ │  p1851
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1852
│ │ │  Rp1853
│ │ │  (dp1854
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/qscore.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/precession_view.py
│ │ │  p1855
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1856
│ │ │  Rp1857
│ │ │  (dp1858
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.precession_view
│ │ │ +Vbin/cctbx.space_group_info
│ │ │  p1859
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1860
│ │ │  Rp1861
│ │ │  (dp1862
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/precession_view.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/space_group_info.py
│ │ │  p1863
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1864
│ │ │  Rp1865
│ │ │  (dp1866
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.form_factor_query
│ │ │ +Vbin/mmtbx.development.qscore
│ │ │  p1867
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1868
│ │ │  Rp1869
│ │ │  (dp1870
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/form_factor_query.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/qscore.py
│ │ │  p1871
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1872
│ │ │  Rp1873
│ │ │  (dp1874
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.find_reticular_twin_laws
│ │ │ +Vbin/phenix.segment_and_split_map
│ │ │  p1875
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1876
│ │ │  Rp1877
│ │ │  (dp1878
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/find_reticular_twin_laws.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/segment_and_split_map.py
│ │ │  p1879
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1880
│ │ │  Rp1881
│ │ │  (dp1882
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.euclidean_model_matching
│ │ │ +Vbin/phenix.auto_sharpen
│ │ │  p1883
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1884
│ │ │  Rp1885
│ │ │  (dp1886
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/euclidean_model_matching.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/auto_sharpen.py
│ │ │  p1887
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1888
│ │ │  Rp1889
│ │ │  (dp1890
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.eltbx.show_fp_fdp
│ │ │ +Vbin/cctbx.subgroups
│ │ │  p1891
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1892
│ │ │  Rp1893
│ │ │  (dp1894
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/eltbx.show_fp_fdp.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/subgroups.py
│ │ │  p1895
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1896
│ │ │  Rp1897
│ │ │  (dp1898
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│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.diffuse
│ │ │ +Vbin/phenix.find_reticular_twin_laws
│ │ │  p1899
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1900
│ │ │  Rp1901
│ │ │  (dp1902
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/diffuse.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/find_reticular_twin_laws.py
│ │ │  p1903
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1904
│ │ │  Rp1905
│ │ │  (dp1906
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│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.cod_select_and_pickle
│ │ │ +Vbin/cctbx.structure_factor_timings
│ │ │  p1907
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1908
│ │ │  Rp1909
│ │ │  (dp1910
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/cod_select_and_pickle.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/structure_factor_timings.py
│ │ │  p1911
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1912
│ │ │  Rp1913
│ │ │  (dp1914
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│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx_regression.test_nightly
│ │ │ +Vbin/cctbx.wavelength_units
│ │ │  p1915
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
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│ │ │  Ntp1916
│ │ │  Rp1917
│ │ │  (dp1918
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/cctbx_test_nightly.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/wavelength_units.py
│ │ │  p1919
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
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│ │ │  Ntp1920
│ │ │  Rp1921
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│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.brehm_diederichs
│ │ │ +Vbin/cctbx.web.install
│ │ │  p1923
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
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│ │ │  Ntp1924
│ │ │  Rp1925
│ │ │  (dp1926
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/brehm_diederichs.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/web.install.csh
│ │ │  p1927
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
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│ │ │  Ntp1928
│ │ │  Rp1929
│ │ │  (dp1930
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│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.auto_sharpen
│ │ │ +Vbin/cctbx.version
│ │ │  p1931
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
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│ │ │  Ntp1932
│ │ │  Rp1933
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│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/auto_sharpen.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/version.py
│ │ │  p1935
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
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│ │ │  Ntp1936
│ │ │  Rp1937
│ │ │  (dp1938
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│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.visualize_r_factors
│ │ │ +Vbin/cctbx.multiplicity_viewer
│ │ │  p1939
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1940
│ │ │  Rp1941
│ │ │  (dp1942
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/visualize_r_factors.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/multiplicity_viewer.py
│ │ │  p1943
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1944
│ │ │  Rp1945
│ │ │  (dp1946
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│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/crys3d.qttbx.view_structure
│ │ │ +Vbin/phenix.data_viewer
│ │ │  p1947
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
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│ │ │  Ntp1948
│ │ │  Rp1949
│ │ │  (dp1950
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│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/qttbx.view_structure.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/hklview.py
│ │ │  p1951
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
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│ │ │  Ntp1952
│ │ │  Rp1953
│ │ │  (dp1954
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│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.multiplicity_viewer
│ │ │ +Vbin/cctbx.data_viewer
│ │ │  p1955
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
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│ │ │  Ntp1956
│ │ │  Rp1957
│ │ │  (dp1958
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│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/multiplicity_viewer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/hklview.py
│ │ │  p1959
│ │ │  sbsg0
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│ │ │  Ntp1960
│ │ │  Rp1961
│ │ │  (dp1962
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│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/crys3d.model_viewer
│ │ │ +Vbin/cctbx.visualize_r_factors
│ │ │  p1963
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
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│ │ │  Ntp1964
│ │ │  Rp1965
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│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/model_viewer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/visualize_r_factors.py
│ │ │  p1967
│ │ │  sbsg0
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│ │ │  Ntp1968
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│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.make_install_HKLviewer_ChimeraX
│ │ │ +Vbin/phenix.HKLviewer
│ │ │  p1971
│ │ │  sbg0
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│ │ │  Rp1973
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│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/make_install_HKLviewer_ChimeraX.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLviewer.py
│ │ │  p1975
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
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│ │ │  Ntp1976
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│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.data_viewer
│ │ │ +Vbin/cctbx.HKLviewer
│ │ │  p1979
│ │ │  sbg0
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│ │ │  Ntp1980
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│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/hklview.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLviewer.py
│ │ │  p1983
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1984
│ │ │  Rp1985
│ │ │  (dp1986
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.data_viewer
│ │ │ +Vbin/phasertng.HKLviewer
│ │ │  p1987
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1988
│ │ │  Rp1989
│ │ │  (dp1990
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/hklview.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLviewer.py
│ │ │  p1991
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1992
│ │ │  Rp1993
│ │ │  (dp1994
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│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.compare_datasets
│ │ │ +Vbin/crys3d.qttbx.view_structure
│ │ │  p1995
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1996
│ │ │  Rp1997
│ │ │  (dp1998
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/compare_datasets.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/qttbx.view_structure.py
│ │ │  p1999
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2000
│ │ │  Rp2001
│ │ │  (dp2002
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.HKLviewer
│ │ │ +Vbin/phenix.HKLinfo
│ │ │  p2003
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2004
│ │ │  Rp2005
│ │ │  (dp2006
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLviewer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLinfo.py
│ │ │  p2007
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2008
│ │ │  Rp2009
│ │ │  (dp2010
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.HKLviewer
│ │ │ +Vbin/cctbx.HKLinfo
│ │ │  p2011
│ │ │  sbg0
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│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2012
│ │ │  Rp2013
│ │ │  (dp2014
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLviewer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLinfo.py
│ │ │  p2015
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2016
│ │ │  Rp2017
│ │ │  (dp2018
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phasertng.HKLviewer
│ │ │ +Vbin/cctbx.make_install_HKLviewer_ChimeraX
│ │ │  p2019
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
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│ │ │  Ntp2020
│ │ │  Rp2021
│ │ │  (dp2022
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLviewer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/make_install_HKLviewer_ChimeraX.py
│ │ │  p2023
│ │ │  sbsg0
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│ │ │  g2
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│ │ │  Rp2025
│ │ │  (dp2026
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.HKLinfo
│ │ │ +Vbin/phenix.compare_datasets
│ │ │  p2027
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2028
│ │ │  Rp2029
│ │ │  (dp2030
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLinfo.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/compare_datasets.py
│ │ │  p2031
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2032
│ │ │  Rp2033
│ │ │  (dp2034
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.HKLinfo
│ │ │ +Vbin/crys3d.model_viewer
│ │ │  p2035
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2036
│ │ │  Rp2037
│ │ │  (dp2038
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLinfo.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/model_viewer.py
│ │ │  p2039
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2040
│ │ │  Rp2041
│ │ │  (dp2042
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/smtbx.refine
│ │ │ +Vbin/smtbx.absolute_structure
│ │ │  p2043
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2044
│ │ │  Rp2045
│ │ │  (dp2046
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/refine.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/absolute_structure.py
│ │ │  p2047
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2048
│ │ │  Rp2049
│ │ │  (dp2050
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/smtbx.masks
│ │ │ +Vbin/smtbx.refine
│ │ │  p2051
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2052
│ │ │  Rp2053
│ │ │  (dp2054
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/masks.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/refine.py
│ │ │  p2055
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2056
│ │ │  Rp2057
│ │ │  (dp2058
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/smtbx.benchmark_refinement
│ │ │ +Vbin/smtbx.anom_refine
│ │ │  p2059
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2060
│ │ │  Rp2061
│ │ │  (dp2062
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/benchmark_refinement.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/anom_refine.py
│ │ │  p2063
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2064
│ │ │  Rp2065
│ │ │  (dp2066
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/smtbx.anom_refine
│ │ │ +Vbin/smtbx.masks
│ │ │  p2067
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2068
│ │ │  Rp2069
│ │ │  (dp2070
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/anom_refine.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/masks.py
│ │ │  p2071
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2072
│ │ │  Rp2073
│ │ │  (dp2074
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/smtbx.absolute_structure
│ │ │ +Vbin/smtbx.benchmark_refinement
│ │ │  p2075
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2076
│ │ │  Rp2077
│ │ │  (dp2078
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/absolute_structure.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/benchmark_refinement.py
│ │ │  p2079
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2080
│ │ │  Rp2081
│ │ │  (dp2082
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.xplor.map.show_summary
│ │ │ +Vbin/iotbx.shelx.as_xray_structure
│ │ │  p2083
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2084
│ │ │  Rp2085
│ │ │  (dp2086
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/xplor.map.show_summary.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/shelx.as_xray_structure.py
│ │ │  p2087
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2088
│ │ │  Rp2089
│ │ │  (dp2090
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.unique_with_biomt
│ │ │ +Vbin/iotbx.cif.as_miller_arrays
│ │ │  p2091
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2092
│ │ │  Rp2093
│ │ │  (dp2094
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/unique_with_biomt.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif.as_miller_arrays.py
│ │ │  p2095
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2096
│ │ │  Rp2097
│ │ │  (dp2098
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.unique_with_biomt
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb_remediator
│ │ │  p2099
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2100
│ │ │  Rp2101
│ │ │  (dp2102
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/unique_with_biomt.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_remediator.py
│ │ │  p2103
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2104
│ │ │  Rp2105
│ │ │  (dp2106
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.symmetry_search
│ │ │ +Vbin/iotbx.simple_map_coefficients
│ │ │  p2107
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2108
│ │ │  Rp2109
│ │ │  (dp2110
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/symmetry_search.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/simple_map_coefficients.py
│ │ │  p2111
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2112
│ │ │  Rp2113
│ │ │  (dp2114
│ │ │ @@ -5775,268 +5775,268 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2128
│ │ │  Rp2129
│ │ │  (dp2130
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.simple_map_coefficients
│ │ │ +Vbin/phenix.french_wilson
│ │ │  p2131
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2132
│ │ │  Rp2133
│ │ │  (dp2134
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/simple_map_coefficients.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/french_wilson.py
│ │ │  p2135
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2136
│ │ │  Rp2137
│ │ │  (dp2138
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.show_systematic_absences
│ │ │ +Vbin/iotbx.french_wilson
│ │ │  p2139
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2140
│ │ │  Rp2141
│ │ │  (dp2142
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/show_systematic_absences.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/french_wilson.py
│ │ │  p2143
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2144
│ │ │  Rp2145
│ │ │  (dp2146
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.show_distances
│ │ │ +Vbin/iotbx.build_phil_cache
│ │ │  p2147
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2148
│ │ │  Rp2149
│ │ │  (dp2150
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/show_distances.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/build_phil_cache.py
│ │ │  p2151
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2152
│ │ │  Rp2153
│ │ │  (dp2154
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.shelx.dump_as_python
│ │ │ +Vbin/iotbx.phil
│ │ │  p2155
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2156
│ │ │  Rp2157
│ │ │  (dp2158
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/shelx.dump_as_python.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/phil.py
│ │ │  p2159
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2160
│ │ │  Rp2161
│ │ │  (dp2162
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.shelx.as_xray_structure
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb_as_cif
│ │ │  p2163
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2164
│ │ │  Rp2165
│ │ │  (dp2166
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/shelx.as_xray_structure.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_as_cif.py
│ │ │  p2167
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2168
│ │ │  Rp2169
│ │ │  (dp2170
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.shelx.as_cif
│ │ │ +Vbin/iotbx.show_distances
│ │ │  p2171
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2172
│ │ │  Rp2173
│ │ │  (dp2174
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/shelx.as_cif.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/show_distances.py
│ │ │  p2175
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2176
│ │ │  Rp2177
│ │ │  (dp2178
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.reindex
│ │ │ +Vbin/labelit.png
│ │ │  p2179
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2180
│ │ │  Rp2181
│ │ │  (dp2182
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reindex.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/detector_image_as_png.py
│ │ │  p2183
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2184
│ │ │  Rp2185
│ │ │  (dp2186
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.reflection_statistics
│ │ │ +Vbin/phenix.explore_metric_symmetry
│ │ │  p2187
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2188
│ │ │  Rp2189
│ │ │  (dp2190
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_statistics.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/explore_metric_symmetry.py
│ │ │  p2191
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2192
│ │ │  Rp2193
│ │ │  (dp2194
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.reflection_file_reader
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.superpose_centers_of_mass
│ │ │  p2195
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2196
│ │ │  Rp2197
│ │ │  (dp2198
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_file_reader.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.superpose_centers_of_mass.py
│ │ │  p2199
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2200
│ │ │  Rp2201
│ │ │  (dp2202
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.reflection_file_editor
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.flip_symmetric_amino_acids
│ │ │  p2203
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2204
│ │ │  Rp2205
│ │ │  (dp2206
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_file_editor.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/flip_symmetric_amino_acids.py
│ │ │  p2207
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2208
│ │ │  Rp2209
│ │ │  (dp2210
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.reflection_file_converter
│ │ │ +Vbin/iotbx.unique_with_biomt
│ │ │  p2211
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2212
│ │ │  Rp2213
│ │ │  (dp2214
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_file_converter.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/unique_with_biomt.py
│ │ │  p2215
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2216
│ │ │  Rp2217
│ │ │  (dp2218
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.reflection_file_converter
│ │ │ +Vbin/phenix.unique_with_biomt
│ │ │  p2219
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2220
│ │ │  Rp2221
│ │ │  (dp2222
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_file_converter.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/unique_with_biomt.py
│ │ │  p2223
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2224
│ │ │  Rp2225
│ │ │  (dp2226
│ │ │ @@ -6061,246 +6061,246 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2232
│ │ │  Rp2233
│ │ │  (dp2234
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.r_free_flags_as_cns
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb_cif_conversion
│ │ │  p2235
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2236
│ │ │  Rp2237
│ │ │  (dp2238
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/r_free_flags_as_cns.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_cif_conversion.py
│ │ │  p2239
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2240
│ │ │  Rp2241
│ │ │  (dp2242
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.r_free_flags_accumulation
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.link_as_geometry_restraints_edits
│ │ │  p2243
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2244
│ │ │  Rp2245
│ │ │  (dp2246
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/r_free_flags_accumulation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.link_as_geometry_restraints_edits.py
│ │ │  p2247
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2248
│ │ │  Rp2249
│ │ │  (dp2250
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.poscar_as_xray_structure
│ │ │ +Vbin/phenix.reflection_file_converter
│ │ │  p2251
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2252
│ │ │  Rp2253
│ │ │  (dp2254
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/poscar_as_xray_structure.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_file_converter.py
│ │ │  p2255
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2256
│ │ │  Rp2257
│ │ │  (dp2258
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.phil
│ │ │ +Vbin/iotbx.reflection_file_converter
│ │ │  p2259
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2260
│ │ │  Rp2261
│ │ │  (dp2262
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/phil.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_file_converter.py
│ │ │  p2263
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2264
│ │ │  Rp2265
│ │ │  (dp2266
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.split_models
│ │ │ +Vbin/iotbx.blast_pdb
│ │ │  p2267
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2268
│ │ │  Rp2269
│ │ │  (dp2270
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_split_models.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/blast_pdb.py
│ │ │  p2271
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2272
│ │ │  Rp2273
│ │ │  (dp2274
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.show_connectivity
│ │ │ +Vbin/iotbx.get_pubmed_citation
│ │ │  p2275
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2276
│ │ │  Rp2277
│ │ │  (dp2278
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_show_connectivity.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/get_pubmed_citation.py
│ │ │  p2279
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2280
│ │ │  Rp2281
│ │ │  (dp2282
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb_remediator
│ │ │ +Vbin/iotbx.lattice_symmetry
│ │ │  p2283
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2284
│ │ │  Rp2285
│ │ │  (dp2286
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_remediator.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/lattice_symmetry.py
│ │ │  p2287
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2288
│ │ │  Rp2289
│ │ │  (dp2290
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb_labels_diff
│ │ │ +Vbin/iotbx.cns.sdb_reader
│ │ │  p2291
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2292
│ │ │  Rp2293
│ │ │  (dp2294
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_labels_diff.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cns.sdb_reader.py
│ │ │  p2295
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2296
│ │ │  Rp2297
│ │ │  (dp2298
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb_labels_comparison
│ │ │ +Vbin/iotbx.cns.transfer_crystal_symmetry
│ │ │  p2299
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2300
│ │ │  Rp2301
│ │ │  (dp2302
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_labels_comparison.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cns.transfer_crystal_symmetry.py
│ │ │  p2303
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2304
│ │ │  Rp2305
│ │ │  (dp2306
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.get_citation
│ │ │ +Vbin/phenix.reflection_statistics
│ │ │  p2307
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2308
│ │ │  Rp2309
│ │ │  (dp2310
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_get_citation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_statistics.py
│ │ │  p2311
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2312
│ │ │  Rp2313
│ │ │  (dp2314
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb_cif_conversion
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb_labels_comparison
│ │ │  p2315
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2316
│ │ │  Rp2317
│ │ │  (dp2318
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_cif_conversion.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_labels_comparison.py
│ │ │  p2319
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2320
│ │ │  Rp2321
│ │ │  (dp2322
│ │ │ @@ -6325,1082 +6325,1082 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2328
│ │ │  Rp2329
│ │ │  (dp2330
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb_as_cif
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb_labels_diff
│ │ │  p2331
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2332
│ │ │  Rp2333
│ │ │  (dp2334
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_as_cif.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_labels_diff.py
│ │ │  p2335
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2336
│ │ │  Rp2337
│ │ │  (dp2338
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.add_conformations
│ │ │ +Vbin/iotbx.cif.as_xray_structure
│ │ │  p2339
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2340
│ │ │  Rp2341
│ │ │  (dp2342
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_add_conformations.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif.as_xray_structure.py
│ │ │  p2343
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2344
│ │ │  Rp2345
│ │ │  (dp2346
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.superpose_centers_of_mass
│ │ │ +Vbin/phenix.reindex
│ │ │  p2347
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2348
│ │ │  Rp2349
│ │ │  (dp2350
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.superpose_centers_of_mass.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reindex.py
│ │ │  p2351
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2352
│ │ │  Rp2353
│ │ │  (dp2354
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.superpose_atoms_by_name
│ │ │ +Vbin/cctbx.patterson_map
│ │ │  p2355
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2356
│ │ │  Rp2357
│ │ │  (dp2358
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.superpose_atoms_by_name.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/patterson_map.py
│ │ │  p2359
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2360
│ │ │  Rp2361
│ │ │  (dp2362
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.print_sequence
│ │ │ +Vbin/phenix.cif_as_pdb
│ │ │  p2363
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2364
│ │ │  Rp2365
│ │ │  (dp2366
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.print_sequence.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif_as_pdb.py
│ │ │  p2367
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2368
│ │ │  Rp2369
│ │ │  (dp2370
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.link_as_geometry_restraints_edits
│ │ │ +Vbin/iotbx.cif_as_pdb
│ │ │  p2371
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2372
│ │ │  Rp2373
│ │ │  (dp2374
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.link_as_geometry_restraints_edits.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif_as_pdb.py
│ │ │  p2375
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2376
│ │ │  Rp2377
│ │ │  (dp2378
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.join_fragment_files
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.get_citation
│ │ │  p2379
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2380
│ │ │  Rp2381
│ │ │  (dp2382
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.join_fragment_files.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_get_citation.py
│ │ │  p2383
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2384
│ │ │  Rp2385
│ │ │  (dp2386
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.insert_scale_records
│ │ │ +Vbin/iotbx.r_free_flags_accumulation
│ │ │  p2387
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2388
│ │ │  Rp2389
│ │ │  (dp2390
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.insert_scale_records.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/r_free_flags_accumulation.py
│ │ │  p2391
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2392
│ │ │  Rp2393
│ │ │  (dp2394
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb.hierarchy
│ │ │ +Vbin/iotbx.reflection_file_reader
│ │ │  p2395
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2396
│ │ │  Rp2397
│ │ │  (dp2398
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.hierarchy.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_file_reader.py
│ │ │  p2399
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2400
│ │ │  Rp2401
│ │ │  (dp2402
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.box_around_molecule
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.print_sequence
│ │ │  p2403
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2404
│ │ │  Rp2405
│ │ │  (dp2406
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.box_around_molecule.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.print_sequence.py
│ │ │  p2407
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2408
│ │ │  Rp2409
│ │ │  (dp2410
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb.b_factor_stats
│ │ │ +Vbin/iotbx.dano_as_amplitudes
│ │ │  p2411
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2412
│ │ │  Rp2413
│ │ │  (dp2414
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.b_factor_stats.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/dano_as_amplitudes.py
│ │ │  p2415
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2416
│ │ │  Rp2417
│ │ │  (dp2418
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.as_xray_structure
│ │ │ +Vbin/iotbx.poscar_as_xray_structure
│ │ │  p2419
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2420
│ │ │  Rp2421
│ │ │  (dp2422
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.as_xray_structure.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/poscar_as_xray_structure.py
│ │ │  p2423
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2424
│ │ │  Rp2425
│ │ │  (dp2426
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.patterson_map
│ │ │ +Vbin/phenix.cns_as_mtz
│ │ │  p2427
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2428
│ │ │  Rp2429
│ │ │  (dp2430
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/patterson_map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cns_as_mtz.py
│ │ │  p2431
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2432
│ │ │  Rp2433
│ │ │  (dp2434
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.mtz_as_cif
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.add_conformations
│ │ │  p2435
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2436
│ │ │  Rp2437
│ │ │  (dp2438
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/mtz_as_cif.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_add_conformations.py
│ │ │  p2439
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2440
│ │ │  Rp2441
│ │ │  (dp2442
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.mtz.dump
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.box_around_molecule
│ │ │  p2443
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2444
│ │ │  Rp2445
│ │ │  (dp2446
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/mtz.dump.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.box_around_molecule.py
│ │ │  p2447
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2448
│ │ │  Rp2449
│ │ │  (dp2450
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.mtz.dump
│ │ │ +Vbin/iotbx.dtrek.to_cns
│ │ │  p2451
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2452
│ │ │  Rp2453
│ │ │  (dp2454
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/mtz.dump.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/dtrek.to_cns.py
│ │ │  p2455
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2456
│ │ │  Rp2457
│ │ │  (dp2458
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb.mtrix_reconstruction
│ │ │ +Vbin/phenix.mtz_as_cif
│ │ │  p2459
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2460
│ │ │  Rp2461
│ │ │  (dp2462
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/mtrix_reconstruction.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/mtz_as_cif.py
│ │ │  p2463
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2464
│ │ │  Rp2465
│ │ │  (dp2466
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.merging_statistics
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.join_fragment_files
│ │ │  p2467
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2468
│ │ │  Rp2469
│ │ │  (dp2470
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/merging_statistics.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.join_fragment_files.py
│ │ │  p2471
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2472
│ │ │  Rp2473
│ │ │  (dp2474
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.merging_statistics
│ │ │ +Vbin/cctbx.show_systematic_absences
│ │ │  p2475
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2476
│ │ │  Rp2477
│ │ │  (dp2478
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/merging_statistics.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/show_systematic_absences.py
│ │ │  p2479
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2480
│ │ │  Rp2481
│ │ │  (dp2482
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.lattice_symmetry
│ │ │ +Vbin/phenix.mtz.dump
│ │ │  p2483
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2484
│ │ │  Rp2485
│ │ │  (dp2486
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/lattice_symmetry.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/mtz.dump.py
│ │ │  p2487
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2488
│ │ │  Rp2489
│ │ │  (dp2490
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.get_pubmed_citation
│ │ │ +Vbin/iotbx.mtz.dump
│ │ │  p2491
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2492
│ │ │  Rp2493
│ │ │  (dp2494
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/get_pubmed_citation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/mtz.dump.py
│ │ │  p2495
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2496
│ │ │  Rp2497
│ │ │  (dp2498
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.french_wilson
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.superpose_atoms_by_name
│ │ │  p2499
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2500
│ │ │  Rp2501
│ │ │  (dp2502
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/french_wilson.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.superpose_atoms_by_name.py
│ │ │  p2503
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2504
│ │ │  Rp2505
│ │ │  (dp2506
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.french_wilson
│ │ │ +Vbin/iotbx.r_free_flags_as_cns
│ │ │  p2507
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2508
│ │ │  Rp2509
│ │ │  (dp2510
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/french_wilson.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/r_free_flags_as_cns.py
│ │ │  p2511
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2512
│ │ │  Rp2513
│ │ │  (dp2514
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.flip_symmetric_amino_acids
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb.mtrix_reconstruction
│ │ │  p2515
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2516
│ │ │  Rp2517
│ │ │  (dp2518
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/flip_symmetric_amino_acids.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/mtrix_reconstruction.py
│ │ │  p2519
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2520
│ │ │  Rp2521
│ │ │  (dp2522
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.file_reader
│ │ │ +Vbin/phenix.resolution
│ │ │  p2523
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2524
│ │ │  Rp2525
│ │ │  (dp2526
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/file_reader.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/effective_resolution.py
│ │ │  p2527
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2528
│ │ │  Rp2529
│ │ │  (dp2530
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.export_scalepack_unmerged
│ │ │ +Vbin/iotbx.reflection_file_editor
│ │ │  p2531
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2532
│ │ │  Rp2533
│ │ │  (dp2534
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/export_scalepack_unmerged.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_file_editor.py
│ │ │  p2535
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2536
│ │ │  Rp2537
│ │ │  (dp2538
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.explore_metric_symmetry
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb.b_factor_stats
│ │ │  p2539
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2540
│ │ │  Rp2541
│ │ │  (dp2542
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/explore_metric_symmetry.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.b_factor_stats.py
│ │ │  p2543
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2544
│ │ │  Rp2545
│ │ │  (dp2546
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.emma
│ │ │ +Vbin/iotbx.cif.validate
│ │ │  p2547
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2548
│ │ │  Rp2549
│ │ │  (dp2550
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/emma.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif.validate.py
│ │ │  p2551
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2552
│ │ │  Rp2553
│ │ │  (dp2554
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.emma
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.as_xray_structure
│ │ │  p2555
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2556
│ │ │  Rp2557
│ │ │  (dp2558
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/emma.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.as_xray_structure.py
│ │ │  p2559
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2560
│ │ │  Rp2561
│ │ │  (dp2562
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.resolution
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb.biomt_reconstruction
│ │ │  p2563
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2564
│ │ │  Rp2565
│ │ │  (dp2566
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/effective_resolution.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/biomt_reconstruction.py
│ │ │  p2567
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2568
│ │ │  Rp2569
│ │ │  (dp2570
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.dtrek.to_cns
│ │ │ +Vbin/iotbx.cns.reflection_reader
│ │ │  p2571
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2572
│ │ │  Rp2573
│ │ │  (dp2574
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/dtrek.to_cns.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cns.reflection_reader.py
│ │ │  p2575
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2576
│ │ │  Rp2577
│ │ │  (dp2578
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.distance_least_squares
│ │ │ +Vbin/iotbx.cbf_read
│ │ │  p2579
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2580
│ │ │  Rp2581
│ │ │  (dp2582
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/distance_least_squares.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cbf_read.py
│ │ │  p2583
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2584
│ │ │  Rp2585
│ │ │  (dp2586
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/labelit.png
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.insert_scale_records
│ │ │  p2587
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2588
│ │ │  Rp2589
│ │ │  (dp2590
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/detector_image_as_png.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.insert_scale_records.py
│ │ │  p2591
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2592
│ │ │  Rp2593
│ │ │  (dp2594
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.dano_as_amplitudes
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.show_connectivity
│ │ │  p2595
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2596
│ │ │  Rp2597
│ │ │  (dp2598
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/dano_as_amplitudes.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_show_connectivity.py
│ │ │  p2599
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2600
│ │ │  Rp2601
│ │ │  (dp2602
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.csv_as_mtz
│ │ │ +Vbin/iotbx.shelx.dump_as_python
│ │ │  p2603
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2604
│ │ │  Rp2605
│ │ │  (dp2606
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/csv_as_mtz.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/shelx.dump_as_python.py
│ │ │  p2607
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2608
│ │ │  Rp2609
│ │ │  (dp2610
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.crystal_symmetry_from_any
│ │ │ +Vbin/phenix.emma
│ │ │  p2611
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2612
│ │ │  Rp2613
│ │ │  (dp2614
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/crystal_symmetry_from_any.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/emma.py
│ │ │  p2615
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2616
│ │ │  Rp2617
│ │ │  (dp2618
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.cns_as_mtz
│ │ │ +Vbin/iotbx.emma
│ │ │  p2619
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2620
│ │ │  Rp2621
│ │ │  (dp2622
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cns_as_mtz.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/emma.py
│ │ │  p2623
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2624
│ │ │  Rp2625
│ │ │  (dp2626
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cns.transfer_crystal_symmetry
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.split_models
│ │ │  p2627
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2628
│ │ │  Rp2629
│ │ │  (dp2630
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cns.transfer_crystal_symmetry.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_split_models.py
│ │ │  p2631
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2632
│ │ │  Rp2633
│ │ │  (dp2634
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cns.sdb_reader
│ │ │ +Vbin/iotbx.file_reader
│ │ │  p2635
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2636
│ │ │  Rp2637
│ │ │  (dp2638
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cns.sdb_reader.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/file_reader.py
│ │ │  p2639
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2640
│ │ │  Rp2641
│ │ │  (dp2642
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cns.reflection_reader
│ │ │ +Vbin/phenix.merging_statistics
│ │ │  p2643
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2644
│ │ │  Rp2645
│ │ │  (dp2646
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cns.reflection_reader.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/merging_statistics.py
│ │ │  p2647
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2648
│ │ │  Rp2649
│ │ │  (dp2650
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.cif_as_pdb
│ │ │ +Vbin/iotbx.merging_statistics
│ │ │  p2651
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2652
│ │ │  Rp2653
│ │ │  (dp2654
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif_as_pdb.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/merging_statistics.py
│ │ │  p2655
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2656
│ │ │  Rp2657
│ │ │  (dp2658
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cif_as_pdb
│ │ │ +Vbin/iotbx.export_scalepack_unmerged
│ │ │  p2659
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2660
│ │ │  Rp2661
│ │ │  (dp2662
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif_as_pdb.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/export_scalepack_unmerged.py
│ │ │  p2663
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2664
│ │ │  Rp2665
│ │ │  (dp2666
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cif.validate
│ │ │ +Vbin/phenix.csv_as_mtz
│ │ │  p2667
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2668
│ │ │  Rp2669
│ │ │  (dp2670
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif.validate.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/csv_as_mtz.py
│ │ │  p2671
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2672
│ │ │  Rp2673
│ │ │  (dp2674
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cif.as_xray_structure
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb.hierarchy
│ │ │  p2675
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2676
│ │ │  Rp2677
│ │ │  (dp2678
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif.as_xray_structure.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.hierarchy.py
│ │ │  p2679
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2680
│ │ │  Rp2681
│ │ │  (dp2682
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cif.as_miller_arrays
│ │ │ +Vbin/iotbx.crystal_symmetry_from_any
│ │ │  p2683
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2684
│ │ │  Rp2685
│ │ │  (dp2686
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif.as_miller_arrays.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/crystal_symmetry_from_any.py
│ │ │  p2687
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2688
│ │ │  Rp2689
│ │ │  (dp2690
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cbf_read
│ │ │ +Vbin/iotbx.xplor.map.show_summary
│ │ │  p2691
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2692
│ │ │  Rp2693
│ │ │  (dp2694
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cbf_read.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/xplor.map.show_summary.py
│ │ │  p2695
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2696
│ │ │  Rp2697
│ │ │  (dp2698
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.build_phil_cache
│ │ │ +Vbin/iotbx.shelx.as_cif
│ │ │  p2699
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2700
│ │ │  Rp2701
│ │ │  (dp2702
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/build_phil_cache.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/shelx.as_cif.py
│ │ │  p2703
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2704
│ │ │  Rp2705
│ │ │  (dp2706
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.blast_pdb
│ │ │ +Vbin/iotbx.distance_least_squares
│ │ │  p2707
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2708
│ │ │  Rp2709
│ │ │  (dp2710
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/blast_pdb.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/distance_least_squares.py
│ │ │  p2711
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2712
│ │ │  Rp2713
│ │ │  (dp2714
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb.biomt_reconstruction
│ │ │ +Vbin/iotbx.symmetry_search
│ │ │  p2715
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2716
│ │ │  Rp2717
│ │ │  (dp2718
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/biomt_reconstruction.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/symmetry_search.py
│ │ │  p2719
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2720
│ │ │  Rp2721
│ │ │  (dp2722
│ │ │ @@ -7425,2732 +7425,2732 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2728
│ │ │  Rp2729
│ │ │  (dp2730
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.xtriage
│ │ │ +Vbin/phenix.rna_validate_bonds
│ │ │  p2731
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2732
│ │ │  Rp2733
│ │ │  (dp2734
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/xtriage.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_bonds.py
│ │ │  p2735
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2736
│ │ │  Rp2737
│ │ │  (dp2738
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.xtriage
│ │ │ +Vbin/molprobity.rna_validate_bonds
│ │ │  p2739
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2740
│ │ │  Rp2741
│ │ │  (dp2742
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/xtriage.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_bonds.py
│ │ │  p2743
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2744
│ │ │  Rp2745
│ │ │  (dp2746
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.development.xtrapol8
│ │ │ +Vbin/phenix.model_vs_map
│ │ │  p2747
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2748
│ │ │  Rp2749
│ │ │  (dp2750
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/xtrapol8.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_vs_map.py
│ │ │  p2751
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2752
│ │ │  Rp2753
│ │ │  (dp2754
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.xmanip
│ │ │ +Vbin/phenix.fmodel
│ │ │  p2755
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2756
│ │ │  Rp2757
│ │ │  (dp2758
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/xmanip.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fmodel.py
│ │ │  p2759
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2760
│ │ │  Rp2761
│ │ │  (dp2762
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.where_is_that_cif_file
│ │ │ +Vbin/phenix.remove_outliers
│ │ │  p2763
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2764
│ │ │  Rp2765
│ │ │  (dp2766
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/where_is_that_cif_file.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/remove_outliers.py
│ │ │  p2767
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2768
│ │ │  Rp2769
│ │ │  (dp2770
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.development.water_b_factors
│ │ │ +Vbin/phenix.rotalyze
│ │ │  p2771
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2772
│ │ │  Rp2773
│ │ │  (dp2774
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/water_b_factors.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rotalyze.py
│ │ │  p2775
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2776
│ │ │  Rp2777
│ │ │  (dp2778
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.verify_mon_lib_data
│ │ │ +Vbin/molprobity.rotalyze
│ │ │  p2779
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2780
│ │ │  Rp2781
│ │ │  (dp2782
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/verify_mon_lib_data.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rotalyze.py
│ │ │  p2783
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2784
│ │ │  Rp2785
│ │ │  (dp2786
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.validation_summary
│ │ │ +Vbin/phenix.model_model_distances
│ │ │  p2787
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2788
│ │ │  Rp2789
│ │ │  (dp2790
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/validation_summary.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_model_distances.py
│ │ │  p2791
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2792
│ │ │  Rp2793
│ │ │  (dp2794
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.validate_ligands
│ │ │ +Vbin/phenix.pdbtools
│ │ │  p2795
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2796
│ │ │  Rp2797
│ │ │  (dp2798
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/validate_ligands.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/pdbtools.py
│ │ │  p2799
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2800
│ │ │  Rp2801
│ │ │  (dp2802
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.validate_ligands
│ │ │ +Vbin/mmtbx.distance_difference
│ │ │  p2803
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2804
│ │ │  Rp2805
│ │ │  (dp2806
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/validate_ligands.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/distance_difference.py
│ │ │  p2807
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2808
│ │ │  Rp2809
│ │ │  (dp2810
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.validate_H
│ │ │ +Vbin/mmtbx.density_modification
│ │ │  p2811
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2812
│ │ │  Rp2813
│ │ │  (dp2814
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/validate_H_cl_app.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/density_modification.py
│ │ │  p2815
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2816
│ │ │  Rp2817
│ │ │  (dp2818
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.undowser2_validation
│ │ │ +Vbin/phenix.models_as_chains
│ │ │  p2819
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2820
│ │ │  Rp2821
│ │ │  (dp2822
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser2.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/models_as_chains.py
│ │ │  p2823
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2824
│ │ │  Rp2825
│ │ │  (dp2826
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.undowser2_validation
│ │ │ +Vbin/mmtbx.super
│ │ │  p2827
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2828
│ │ │  Rp2829
│ │ │  (dp2830
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser2.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/super.py
│ │ │  p2831
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2832
│ │ │  Rp2833
│ │ │  (dp2834
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.undowser2_validation
│ │ │ +Vbin/phenix.barbed_wire_analysis
│ │ │  p2835
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2836
│ │ │  Rp2837
│ │ │  (dp2838
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser2.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/barbed_wire_analysis.py
│ │ │  p2839
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2840
│ │ │  Rp2841
│ │ │  (dp2842
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.undowser_validation
│ │ │ +Vbin/molprobity.barbed_wire_analysis
│ │ │  p2843
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2844
│ │ │  Rp2845
│ │ │  (dp2846
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/barbed_wire_analysis.py
│ │ │  p2847
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2848
│ │ │  Rp2849
│ │ │  (dp2850
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.undowser_validation
│ │ │ +Vbin/mmtbx.arginine_geometry
│ │ │  p2851
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2852
│ │ │  Rp2853
│ │ │  (dp2854
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/arginine_geometry.py
│ │ │  p2855
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2856
│ │ │  Rp2857
│ │ │  (dp2858
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.tls_as_xyz
│ │ │ +Vbin/mmtbx.rama_z
│ │ │  p2859
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2860
│ │ │  Rp2861
│ │ │  (dp2862
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/tls_as_xyz.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rama_z.py
│ │ │  p2863
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2864
│ │ │  Rp2865
│ │ │  (dp2866
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.tls_analysis
│ │ │ +Vbin/phenix.rama_z
│ │ │  p2867
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2868
│ │ │  Rp2869
│ │ │  (dp2870
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/tls_analysis.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rama_z.py
│ │ │  p2871
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2872
│ │ │  Rp2873
│ │ │  (dp2874
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.tls
│ │ │ +Vbin/phenix.suitename
│ │ │  p2875
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2876
│ │ │  Rp2877
│ │ │  (dp2878
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/tls.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename.py
│ │ │  p2879
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2880
│ │ │  Rp2881
│ │ │  (dp2882
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.table_one
│ │ │ +Vbin/molprobity.suitename
│ │ │  p2883
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2884
│ │ │  Rp2885
│ │ │  (dp2886
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/table_one.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename.py
│ │ │  p2887
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2888
│ │ │  Rp2889
│ │ │  (dp2890
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.TAAM_minus_IAM
│ │ │ +Vbin/cctbx.suitename
│ │ │  p2891
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2892
│ │ │  Rp2893
│ │ │  (dp2894
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/taam_minus_iam.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename.py
│ │ │  p2895
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2896
│ │ │  Rp2897
│ │ │  (dp2898
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.TAAM_minus_IAM
│ │ │ +Vbin/phenix.polder
│ │ │  p2899
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2900
│ │ │  Rp2901
│ │ │  (dp2902
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/taam_minus_iam.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/polder.py
│ │ │  p2903
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2904
│ │ │  Rp2905
│ │ │  (dp2906
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.superpose
│ │ │ +Vbin/mmtbx.model_vs_sequence
│ │ │  p2907
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2908
│ │ │  Rp2909
│ │ │  (dp2910
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/superpose.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_vs_sequence.py
│ │ │  p2911
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2912
│ │ │  Rp2913
│ │ │  (dp2914
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.super
│ │ │ +Vbin/phenix.model_vs_sequence
│ │ │  p2915
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2916
│ │ │  Rp2917
│ │ │  (dp2918
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/super.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_vs_sequence.py
│ │ │  p2919
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2920
│ │ │  Rp2921
│ │ │  (dp2922
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.suitename_old
│ │ │ +Vbin/phenix.reciprocal_space_arrays
│ │ │  p2923
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2924
│ │ │  Rp2925
│ │ │  (dp2926
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename_old.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/reciprocal_space_arrays.py
│ │ │  p2927
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2928
│ │ │  Rp2929
│ │ │  (dp2930
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.suitename_old
│ │ │ +Vbin/phenix.cif_as_mtz
│ │ │  p2931
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2932
│ │ │  Rp2933
│ │ │  (dp2934
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename_old.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cif_as_mtz.py
│ │ │  p2935
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2936
│ │ │  Rp2937
│ │ │  (dp2938
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.suitename_old
│ │ │ +Vbin/iotbx.cif_as_mtz
│ │ │  p2939
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2940
│ │ │  Rp2941
│ │ │  (dp2942
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename_old.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cif_as_mtz.py
│ │ │  p2943
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2944
│ │ │  Rp2945
│ │ │  (dp2946
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.suitename
│ │ │ +Vbin/phenix.reduce_cryoem_resolution
│ │ │  p2947
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2948
│ │ │  Rp2949
│ │ │  (dp2950
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/reduce_cryoem_resolution.py
│ │ │  p2951
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2952
│ │ │  Rp2953
│ │ │  (dp2954
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.suitename
│ │ │ +Vbin/mmtbx.reduce_cryoem_resolution
│ │ │  p2955
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2956
│ │ │  Rp2957
│ │ │  (dp2958
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/reduce_cryoem_resolution.py
│ │ │  p2959
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2960
│ │ │  Rp2961
│ │ │  (dp2962
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.suitename
│ │ │ +Vbin/mmtbx.plan_sad_experiment
│ │ │  p2963
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2964
│ │ │  Rp2965
│ │ │  (dp2966
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/plan_sad_experiment.py
│ │ │  p2967
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2968
│ │ │  Rp2969
│ │ │  (dp2970
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.ss_idealization
│ │ │ +Vbin/mmtbx.rebuild_rotarama_cache
│ │ │  p2971
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2972
│ │ │  Rp2973
│ │ │  (dp2974
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ss_idealization.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rebuild_rotarama_cache.py
│ │ │  p2975
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2976
│ │ │  Rp2977
│ │ │  (dp2978
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.sort_hetatms
│ │ │ +Vbin/phenix.comparama
│ │ │  p2979
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2980
│ │ │  Rp2981
│ │ │  (dp2982
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/sort_hetatms.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/comparama.py
│ │ │  p2983
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2984
│ │ │  Rp2985
│ │ │  (dp2986
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.sisa
│ │ │ +Vbin/mmtbx.ringer
│ │ │  p2987
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2988
│ │ │  Rp2989
│ │ │  (dp2990
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/sisa.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ringer.py
│ │ │  p2991
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2992
│ │ │  Rp2993
│ │ │  (dp2994
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.show_r_factors_by_shell
│ │ │ +Vbin/phenix.mask
│ │ │  p2995
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2996
│ │ │  Rp2997
│ │ │  (dp2998
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/show_r_factors_by_shell.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mask.py
│ │ │  p2999
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3000
│ │ │  Rp3001
│ │ │  (dp3002
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.select_best_starting_model
│ │ │ +Vbin/phenix.hbond
│ │ │  p3003
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3004
│ │ │  Rp3005
│ │ │  (dp3006
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/select_best_starting_model.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/hbond.py
│ │ │  p3007
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3008
│ │ │  Rp3009
│ │ │  (dp3010
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.secondary_structure_validation
│ │ │ +Vbin/phenix.xmanip
│ │ │  p3011
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3012
│ │ │  Rp3013
│ │ │  (dp3014
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/secondary_structure_validation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/xmanip.py
│ │ │  p3015
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3016
│ │ │  Rp3017
│ │ │  (dp3018
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.secondary_structure_restraints
│ │ │ +Vbin/phenix.sisa
│ │ │  p3019
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3020
│ │ │  Rp3021
│ │ │  (dp3022
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/secondary_structure_restraints.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/sisa.py
│ │ │  p3023
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3024
│ │ │  Rp3025
│ │ │  (dp3026
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.search_pdb_symmetry
│ │ │ +Vbin/phenix.fetch_pdb
│ │ │  p3027
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3028
│ │ │  Rp3029
│ │ │  (dp3030
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/search_pdb_symmetry.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fetch_pdb.py
│ │ │  p3031
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3032
│ │ │  Rp3033
│ │ │  (dp3034
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.rotalyze
│ │ │ +Vbin/iotbx.fetch_pdb
│ │ │  p3035
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3036
│ │ │  Rp3037
│ │ │  (dp3038
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rotalyze.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fetch_pdb.py
│ │ │  p3039
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3040
│ │ │  Rp3041
│ │ │  (dp3042
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.rotalyze
│ │ │ +Vbin/phenix.chiral_validation
│ │ │  p3043
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3044
│ │ │  Rp3045
│ │ │  (dp3046
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rotalyze.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/chiral_validation.py
│ │ │  p3047
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3048
│ │ │  Rp3049
│ │ │  (dp3050
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.rna_validate_suites
│ │ │ +Vbin/molprobity.chiral_validation
│ │ │  p3051
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3052
│ │ │  Rp3053
│ │ │  (dp3054
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_suites.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/chiral_validation.py
│ │ │  p3055
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3056
│ │ │  Rp3057
│ │ │  (dp3058
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.rna_validate_suites
│ │ │ +Vbin/mmtbx.verify_mon_lib_data
│ │ │  p3059
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3060
│ │ │  Rp3061
│ │ │  (dp3062
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_suites.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/verify_mon_lib_data.py
│ │ │  p3063
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3064
│ │ │  Rp3065
│ │ │  (dp3066
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.rna_validate_puckers
│ │ │ +Vbin/mmtbx.mon_lib_cif_triage
│ │ │  p3067
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3068
│ │ │  Rp3069
│ │ │  (dp3070
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_puckers.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mon_lib_cif_triage.py
│ │ │  p3071
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3072
│ │ │  Rp3073
│ │ │  (dp3074
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.rna_validate_puckers
│ │ │ +Vbin/phenix.cbetadev
│ │ │  p3075
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3076
│ │ │  Rp3077
│ │ │  (dp3078
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_puckers.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cbetadev.py
│ │ │  p3079
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3080
│ │ │  Rp3081
│ │ │  (dp3082
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.rna_validate_bonds
│ │ │ +Vbin/molprobity.cbetadev
│ │ │  p3083
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3084
│ │ │  Rp3085
│ │ │  (dp3086
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_bonds.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cbetadev.py
│ │ │  p3087
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3088
│ │ │  Rp3089
│ │ │  (dp3090
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.rna_validate_bonds
│ │ │ +Vbin/phenix.map_to_model_histogram
│ │ │  p3091
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3092
│ │ │  Rp3093
│ │ │  (dp3094
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_bonds.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/map_to_model_histogram.py
│ │ │  p3095
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3096
│ │ │  Rp3097
│ │ │  (dp3098
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.rna_validate
│ │ │ +Vbin/phenix.development.xtrapol8
│ │ │  p3099
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3100
│ │ │  Rp3101
│ │ │  (dp3102
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/xtrapol8.py
│ │ │  p3103
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3104
│ │ │  Rp3105
│ │ │  (dp3106
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.rna_validate
│ │ │ +Vbin/mmtbx.search_pdb_symmetry
│ │ │  p3107
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3108
│ │ │  Rp3109
│ │ │  (dp3110
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/search_pdb_symmetry.py
│ │ │  p3111
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3112
│ │ │  Rp3113
│ │ │  (dp3114
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.ringer
│ │ │ +Vbin/phenix.TAAM_minus_IAM
│ │ │  p3115
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3116
│ │ │  Rp3117
│ │ │  (dp3118
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ringer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/taam_minus_iam.py
│ │ │  p3119
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3120
│ │ │  Rp3121
│ │ │  (dp3122
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.rigid_bond_test
│ │ │ +Vbin/mmtbx.TAAM_minus_IAM
│ │ │  p3123
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3124
│ │ │  Rp3125
│ │ │  (dp3126
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rigid_bond_test.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/taam_minus_iam.py
│ │ │  p3127
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3128
│ │ │  Rp3129
│ │ │  (dp3130
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.ribbons
│ │ │ +Vbin/phenix.cablam
│ │ │  p3131
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3132
│ │ │  Rp3133
│ │ │  (dp3134
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ribbons.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cablam.py
│ │ │  p3135
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3136
│ │ │  Rp3137
│ │ │  (dp3138
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.remove_outliers
│ │ │ +Vbin/molprobity.cablam
│ │ │  p3139
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3140
│ │ │  Rp3141
│ │ │  (dp3142
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/remove_outliers.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cablam.py
│ │ │  p3143
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3144
│ │ │  Rp3145
│ │ │  (dp3146
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.refine_anomalous_substructure
│ │ │ +Vbin/phenix.xtriage
│ │ │  p3147
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3148
│ │ │  Rp3149
│ │ │  (dp3150
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/refine_anomalous_substructure.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/xtriage.py
│ │ │  p3151
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3152
│ │ │  Rp3153
│ │ │  (dp3154
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.reduce_cryoem_resolution
│ │ │ +Vbin/mmtbx.xtriage
│ │ │  p3155
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3156
│ │ │  Rp3157
│ │ │  (dp3158
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/reduce_cryoem_resolution.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/xtriage.py
│ │ │  p3159
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3160
│ │ │  Rp3161
│ │ │  (dp3162
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.reduce_cryoem_resolution
│ │ │ +Vbin/phenix.model_idealization
│ │ │  p3163
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3164
│ │ │  Rp3165
│ │ │  (dp3166
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/reduce_cryoem_resolution.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_idealization.py
│ │ │  p3167
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3168
│ │ │  Rp3169
│ │ │  (dp3170
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.reduce2
│ │ │ +Vbin/phenix.mtz2map
│ │ │  p3171
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3172
│ │ │  Rp3173
│ │ │  (dp3174
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/reduce2.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mtz2map.py
│ │ │  p3175
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3176
│ │ │  Rp3177
│ │ │  (dp3178
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.reciprocal_space_arrays
│ │ │ +Vbin/phenix.fft
│ │ │  p3179
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3180
│ │ │  Rp3181
│ │ │  (dp3182
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/reciprocal_space_arrays.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mtz2map.py
│ │ │  p3183
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3184
│ │ │  Rp3185
│ │ │  (dp3186
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.rebuild_rotarama_cache
│ │ │ +Vbin/mmtbx.fft
│ │ │  p3187
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3188
│ │ │  Rp3189
│ │ │  (dp3190
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rebuild_rotarama_cache.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mtz2map.py
│ │ │  p3191
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3192
│ │ │  Rp3193
│ │ │  (dp3194
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.rebuild_cablam_cache
│ │ │ +Vbin/phenix.undowser2_validation
│ │ │  p3195
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3196
│ │ │  Rp3197
│ │ │  (dp3198
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rebuild_cablam_cache.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser2.py
│ │ │  p3199
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3200
│ │ │  Rp3201
│ │ │  (dp3202
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.real_space_diff_map
│ │ │ +Vbin/mmtbx.undowser2_validation
│ │ │  p3203
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3204
│ │ │  Rp3205
│ │ │  (dp3206
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/real_space_diff_map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser2.py
│ │ │  p3207
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3208
│ │ │  Rp3209
│ │ │  (dp3210
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.real_space_correlation
│ │ │ +Vbin/molprobity.undowser2_validation
│ │ │  p3211
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3212
│ │ │  Rp3213
│ │ │  (dp3214
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/real_space_correlation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser2.py
│ │ │  p3215
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3216
│ │ │  Rp3217
│ │ │  (dp3218
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.rank_scale_map
│ │ │ +Vbin/mmtbx.prune_model
│ │ │  p3219
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3220
│ │ │  Rp3221
│ │ │  (dp3222
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rank_scale_map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/prune_model.py
│ │ │  p3223
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3224
│ │ │  Rp3225
│ │ │  (dp3226
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.ramalyze
│ │ │ +Vbin/mmtbx.model_vs_data
│ │ │  p3227
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3228
│ │ │  Rp3229
│ │ │  (dp3230
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ramalyze.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_vs_data.py
│ │ │  p3231
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3232
│ │ │  Rp3233
│ │ │  (dp3234
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.ramalyze
│ │ │ +Vbin/phenix.mp_validate_bonds
│ │ │  p3235
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3236
│ │ │  Rp3237
│ │ │  (dp3238
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ramalyze.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mp_validate_bonds.py
│ │ │  p3239
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3240
│ │ │  Rp3241
│ │ │  (dp3242
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.rama_z
│ │ │ +Vbin/molprobity.mp_validate_bonds
│ │ │  p3243
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3244
│ │ │  Rp3245
│ │ │  (dp3246
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rama_z.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mp_validate_bonds.py
│ │ │  p3247
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3248
│ │ │  Rp3249
│ │ │  (dp3250
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.rama_z
│ │ │ +Vbin/mmtbx.table_one
│ │ │  p3251
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3252
│ │ │  Rp3253
│ │ │  (dp3254
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rama_z.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/table_one.py
│ │ │  p3255
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3256
│ │ │  Rp3257
│ │ │  (dp3258
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.r_factor_statistics
│ │ │ +Vbin/mmtbx.select_best_starting_model
│ │ │  p3259
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3260
│ │ │  Rp3261
│ │ │  (dp3262
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/r_factor_statistics.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/select_best_starting_model.py
│ │ │  p3263
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3264
│ │ │  Rp3265
│ │ │  (dp3266
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.quantum_interface
│ │ │ +Vbin/phenix.tls_analysis
│ │ │  p3267
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3268
│ │ │  Rp3269
│ │ │  (dp3270
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/quantum_interface.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/tls_analysis.py
│ │ │  p3271
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3272
│ │ │  Rp3273
│ │ │  (dp3274
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.prune_model
│ │ │ +Vbin/phenix.development.valence_simple
│ │ │  p3275
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3276
│ │ │  Rp3277
│ │ │  (dp3278
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/prune_model.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/atom_valence_simple.py
│ │ │  p3279
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3280
│ │ │  Rp3281
│ │ │  (dp3282
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.process_predicted_model
│ │ │ +Vbin/phenix.dynamics
│ │ │  p3283
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3284
│ │ │  Rp3285
│ │ │  (dp3286
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/process_predicted_model.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/dynamics.py
│ │ │  p3287
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3288
│ │ │  Rp3289
│ │ │  (dp3290
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.process_predicted_model
│ │ │ +Vbin/phenix.maximum_entropy_map
│ │ │  p3291
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3292
│ │ │  Rp3293
│ │ │  (dp3294
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/process_predicted_model.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/maximum_entropy_map.py
│ │ │  p3295
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3296
│ │ │  Rp3297
│ │ │  (dp3298
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.probescore_ligand
│ │ │ +Vbin/phenix.validate_H
│ │ │  p3299
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3300
│ │ │  Rp3301
│ │ │  (dp3302
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/probescore_ligand.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/validate_H_cl_app.py
│ │ │  p3303
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3304
│ │ │  Rp3305
│ │ │  (dp3306
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.probe2
│ │ │ +Vbin/phenix.helix_sheet_recs_as_pdb_files
│ │ │  p3307
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3308
│ │ │  Rp3309
│ │ │  (dp3310
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/probe2.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/helix_sheet_recs_as_pdb_files.py
│ │ │  p3311
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3312
│ │ │  Rp3313
│ │ │  (dp3314
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.prepare_pdb_deposition
│ │ │ +Vbin/mmtbx.development.ligand_restraints_validation
│ │ │  p3315
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3316
│ │ │  Rp3317
│ │ │  (dp3318
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/prepare_pdb_deposition.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ligand_restraints_validation.py
│ │ │  p3319
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3320
│ │ │  Rp3321
│ │ │  (dp3322
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.polder
│ │ │ +Vbin/phenix.clashscore
│ │ │  p3323
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3324
│ │ │  Rp3325
│ │ │  (dp3326
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/polder.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore.py
│ │ │  p3327
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3328
│ │ │  Rp3329
│ │ │  (dp3330
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.plan_sad_experiment
│ │ │ +Vbin/molprobity.clashscore
│ │ │  p3331
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3332
│ │ │  Rp3333
│ │ │  (dp3334
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/plan_sad_experiment.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore.py
│ │ │  p3335
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3336
│ │ │  Rp3337
│ │ │  (dp3338
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.perigee
│ │ │ +Vbin/phenix.suitename_old
│ │ │  p3339
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3340
│ │ │  Rp3341
│ │ │  (dp3342
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/perigee.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename_old.py
│ │ │  p3343
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3344
│ │ │  Rp3345
│ │ │  (dp3346
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdbtools
│ │ │ +Vbin/molprobity.suitename_old
│ │ │  p3347
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3348
│ │ │  Rp3349
│ │ │  (dp3350
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/pdbtools.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename_old.py
│ │ │  p3351
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3352
│ │ │  Rp3353
│ │ │  (dp3354
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb_interpretation
│ │ │ +Vbin/cctbx.suitename_old
│ │ │  p3355
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3356
│ │ │  Rp3357
│ │ │  (dp3358
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/pdb_interpretation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename_old.py
│ │ │  p3359
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3360
│ │ │  Rp3361
│ │ │  (dp3362
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.pdb_interpretation
│ │ │ +Vbin/phenix.development.the_run_down
│ │ │  p3363
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3364
│ │ │  Rp3365
│ │ │  (dp3366
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/pdb_interpretation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/next_gen_residue_typing.py
│ │ │  p3367
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3368
│ │ │  Rp3369
│ │ │  (dp3370
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb_atom_selection
│ │ │ +Vbin/phenix.fobs_minus_fobs_map
│ │ │  p3371
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3372
│ │ │  Rp3373
│ │ │  (dp3374
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/pdb_atom_selection.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fobs_minus_fobs_map.py
│ │ │  p3375
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3376
│ │ │  Rp3377
│ │ │  (dp3378
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.omegalyze
│ │ │ +Vbin/phenix.find_peaks_holes
│ │ │  p3379
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3380
│ │ │  Rp3381
│ │ │  (dp3382
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/omegalyze.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/find_peaks_holes.py
│ │ │  p3383
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3384
│ │ │  Rp3385
│ │ │  (dp3386
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.omegalyze
│ │ │ +Vbin/mmtbx.find_peaks_holes
│ │ │  p3387
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3388
│ │ │  Rp3389
│ │ │  (dp3390
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/omegalyze.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/find_peaks_holes.py
│ │ │  p3391
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3392
│ │ │  Rp3393
│ │ │  (dp3394
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.nonbonded_overlaps
│ │ │ +Vbin/phenix.secondary_structure_restraints
│ │ │  p3395
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3396
│ │ │  Rp3397
│ │ │  (dp3398
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/nonbonded_overlaps.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/secondary_structure_restraints.py
│ │ │  p3399
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3400
│ │ │  Rp3401
│ │ │  (dp3402
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.development.the_run_down
│ │ │ +Vbin/phenix.ramalyze
│ │ │  p3403
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3404
│ │ │  Rp3405
│ │ │  (dp3406
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/next_gen_residue_typing.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ramalyze.py
│ │ │  p3407
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3408
│ │ │  Rp3409
│ │ │  (dp3410
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.development.next_gen_atom_typing
│ │ │ +Vbin/molprobity.ramalyze
│ │ │  p3411
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3412
│ │ │  Rp3413
│ │ │  (dp3414
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/next_gen_atom_typing.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ramalyze.py
│ │ │  p3415
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3416
│ │ │  Rp3417
│ │ │  (dp3418
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.mtz2map
│ │ │ +Vbin/phenix.cc_star
│ │ │  p3419
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3420
│ │ │  Rp3421
│ │ │  (dp3422
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mtz2map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cc_star.py
│ │ │  p3423
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3424
│ │ │  Rp3425
│ │ │  (dp3426
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.fft
│ │ │ +Vbin/phenix.sort_hetatms
│ │ │  p3427
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3428
│ │ │  Rp3429
│ │ │  (dp3430
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mtz2map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/sort_hetatms.py
│ │ │  p3431
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3432
│ │ │  Rp3433
│ │ │  (dp3434
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.fft
│ │ │ +Vbin/phenix.geometry_minimization
│ │ │  p3435
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3436
│ │ │  Rp3437
│ │ │  (dp3438
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mtz2map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/geometry_minimization.py
│ │ │  p3439
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3440
│ │ │  Rp3441
│ │ │  (dp3442
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.mp_validate_bonds
│ │ │ +Vbin/mmtbx.development.water_b_factors
│ │ │  p3443
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3444
│ │ │  Rp3445
│ │ │  (dp3446
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mp_validate_bonds.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/water_b_factors.py
│ │ │  p3447
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3448
│ │ │  Rp3449
│ │ │  (dp3450
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.mp_validate_bonds
│ │ │ +Vbin/mmtbx.emringer_score
│ │ │  p3451
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3452
│ │ │  Rp3453
│ │ │  (dp3454
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mp_validate_bonds.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/emringer_score.py
│ │ │  p3455
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3456
│ │ │  Rp3457
│ │ │  (dp3458
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.mp_geo
│ │ │ +Vbin/mmtbx.debugging.riding
│ │ │  p3459
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3460
│ │ │  Rp3461
│ │ │  (dp3462
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mp_geo.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/debug_riding.py
│ │ │  p3463
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3464
│ │ │  Rp3465
│ │ │  (dp3466
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.mon_lib_cif_triage
│ │ │ +Vbin/phenix.holton_geometry_validation
│ │ │  p3467
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3468
│ │ │  Rp3469
│ │ │  (dp3470
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mon_lib_cif_triage.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/holton_geometry_validation.py
│ │ │  p3471
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3472
│ │ │  Rp3473
│ │ │  (dp3474
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.molprobity
│ │ │ +Vbin/mmtbx.holton_geometry_validation
│ │ │  p3475
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3476
│ │ │  Rp3477
│ │ │  (dp3478
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/molprobity.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/holton_geometry_validation.py
│ │ │  p3479
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3480
│ │ │  Rp3481
│ │ │  (dp3482
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.molprobity
│ │ │ +Vbin/mmtbx.apply_ncs_to_ligand
│ │ │  p3483
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3484
│ │ │  Rp3485
│ │ │  (dp3486
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/molprobity.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/apply_ncs_to_ligand.py
│ │ │  p3487
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3488
│ │ │  Rp3489
│ │ │  (dp3490
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.models_as_chains
│ │ │ +Vbin/mmtbx.rebuild_cablam_cache
│ │ │  p3491
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3492
│ │ │  Rp3493
│ │ │  (dp3494
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/models_as_chains.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rebuild_cablam_cache.py
│ │ │  p3495
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3496
│ │ │  Rp3497
│ │ │  (dp3498
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.model_vs_sequence
│ │ │ +Vbin/phenix.development.next_gen_atom_typing
│ │ │  p3499
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3500
│ │ │  Rp3501
│ │ │  (dp3502
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_vs_sequence.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/next_gen_atom_typing.py
│ │ │  p3503
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3504
│ │ │  Rp3505
│ │ │  (dp3506
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.model_vs_sequence
│ │ │ +Vbin/phenix.maps
│ │ │  p3507
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3508
│ │ │  Rp3509
│ │ │  (dp3510
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_vs_sequence.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/maps.py
│ │ │  p3511
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3512
│ │ │  Rp3513
│ │ │  (dp3514
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.model_vs_map
│ │ │ +Vbin/mmtbx.ss_idealization
│ │ │  p3515
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3516
│ │ │  Rp3517
│ │ │  (dp3518
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_vs_map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ss_idealization.py
│ │ │  p3519
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3520
│ │ │  Rp3521
│ │ │  (dp3522
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.model_vs_data
│ │ │ +Vbin/mmtbx.where_is_that_cif_file
│ │ │  p3523
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3524
│ │ │  Rp3525
│ │ │  (dp3526
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_vs_data.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/where_is_that_cif_file.py
│ │ │  p3527
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3528
│ │ │  Rp3529
│ │ │  (dp3530
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.model_model_distances
│ │ │ +Vbin/mmtbx.process_predicted_model
│ │ │  p3531
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3532
│ │ │  Rp3533
│ │ │  (dp3534
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_model_distances.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/process_predicted_model.py
│ │ │  p3535
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3536
│ │ │  Rp3537
│ │ │  (dp3538
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.model_map
│ │ │ +Vbin/phenix.process_predicted_model
│ │ │  p3539
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3540
│ │ │  Rp3541
│ │ │  (dp3542
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/process_predicted_model.py
│ │ │  p3543
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3544
│ │ │  Rp3545
│ │ │  (dp3546
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.model_idealization
│ │ │ +Vbin/phenix.angle
│ │ │  p3547
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3548
│ │ │  Rp3549
│ │ │  (dp3550
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_idealization.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/angle.py
│ │ │  p3551
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3552
│ │ │  Rp3553
│ │ │  (dp3554
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.maximum_entropy_map
│ │ │ +Vbin/mmtbx.probe2
│ │ │  p3555
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3556
│ │ │  Rp3557
│ │ │  (dp3558
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/maximum_entropy_map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/probe2.py
│ │ │  p3559
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3560
│ │ │  Rp3561
│ │ │  (dp3562
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.matthews
│ │ │ +Vbin/mmtbx.ribbons
│ │ │  p3563
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3564
│ │ │  Rp3565
│ │ │  (dp3566
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/matthews.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ribbons.py
│ │ │  p3567
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3568
│ │ │  Rp3569
│ │ │  (dp3570
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.massage_data
│ │ │ +Vbin/phenix.perigee
│ │ │  p3571
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3572
│ │ │  Rp3573
│ │ │  (dp3574
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/massage_data.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/perigee.py
│ │ │  p3575
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3576
│ │ │  Rp3577
│ │ │  (dp3578
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.mask
│ │ │ +Vbin/mmtbx.altloc_remediate
│ │ │  p3579
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3580
│ │ │  Rp3581
│ │ │  (dp3582
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mask.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/altloc_remediate.py
│ │ │  p3583
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3584
│ │ │  Rp3585
│ │ │  (dp3586
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.maps
│ │ │ +Vbin/phenix.f000
│ │ │  p3587
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3588
│ │ │  Rp3589
│ │ │  (dp3590
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/maps.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/f000.py
│ │ │  p3591
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3592
│ │ │  Rp3593
│ │ │  (dp3594
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.map_to_structure_factors
│ │ │ +Vbin/mmtbx.development.electrons
│ │ │  p3595
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3596
│ │ │  Rp3597
│ │ │  (dp3598
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/map_to_structure_factors.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/electrons.py
│ │ │  p3599
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3600
│ │ │  Rp3601
│ │ │  (dp3602
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.map_to_model_histogram
│ │ │ +Vbin/mmtbx.reduce2
│ │ │  p3603
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3604
│ │ │  Rp3605
│ │ │  (dp3606
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/map_to_model_histogram.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/reduce2.py
│ │ │  p3607
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3608
│ │ │  Rp3609
│ │ │  (dp3610
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.map_comparison
│ │ │ +Vbin/mmtbx.development.aev
│ │ │  p3611
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3612
│ │ │  Rp3613
│ │ │  (dp3614
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/map_comparison.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/development_aev.py
│ │ │  p3615
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3616
│ │ │  Rp3617
│ │ │  (dp3618
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.map_box
│ │ │ +Vbin/mmtbx.rigid_bond_test
│ │ │  p3619
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3620
│ │ │  Rp3621
│ │ │  (dp3622
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/map_box.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rigid_bond_test.py
│ │ │  p3623
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3624
│ │ │  Rp3625
│ │ │  (dp3626
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.development.ligand_restraints_validation
│ │ │ +Vbin/mmtbx.massage_data
│ │ │  p3627
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3628
│ │ │  Rp3629
│ │ │  (dp3630
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ligand_restraints_validation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/massage_data.py
│ │ │  p3631
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3632
│ │ │  Rp3633
│ │ │  (dp3634
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.kinemage
│ │ │ +Vbin/phenix.fab_elbow_angle
│ │ │  p3635
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3636
│ │ │  Rp3637
│ │ │  (dp3638
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/kinemage.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fab_elbow_angle.py
│ │ │  p3639
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3640
│ │ │  Rp3641
│ │ │  (dp3642
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.kinemage
│ │ │ +Vbin/phenix.undowser_validation
│ │ │  p3643
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3644
│ │ │  Rp3645
│ │ │  (dp3646
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/kinemage.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser.py
│ │ │  p3647
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3648
│ │ │  Rp3649
│ │ │  (dp3650
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.debugging.hydrogenate
│ │ │ +Vbin/molprobity.undowser_validation
│ │ │  p3651
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3652
│ │ │  Rp3653
│ │ │  (dp3654
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/hydrogenate.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser.py
│ │ │  p3655
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3656
│ │ │  Rp3657
│ │ │  (dp3658
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.holton_geometry_validation
│ │ │ +Vbin/phenix.rna_validate_suites
│ │ │  p3659
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3660
│ │ │  Rp3661
│ │ │  (dp3662
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/holton_geometry_validation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_suites.py
│ │ │  p3663
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3664
│ │ │  Rp3665
│ │ │  (dp3666
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.holton_geometry_validation
│ │ │ +Vbin/molprobity.rna_validate_suites
│ │ │  p3667
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3668
│ │ │  Rp3669
│ │ │  (dp3670
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/holton_geometry_validation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_suites.py
│ │ │  p3671
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3672
│ │ │  Rp3673
│ │ │  (dp3674
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.helix_sheet_recs_as_pdb_files
│ │ │ +Vbin/phenix.grow_density
│ │ │  p3675
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3676
│ │ │  Rp3677
│ │ │  (dp3678
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/helix_sheet_recs_as_pdb_files.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/grow_density.py
│ │ │  p3679
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3680
│ │ │  Rp3681
│ │ │  (dp3682
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.hbond
│ │ │ +Vbin/mmtbx.debugging.hydrogenate
│ │ │  p3683
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3684
│ │ │  Rp3685
│ │ │  (dp3686
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/hbond.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/hydrogenate.py
│ │ │  p3687
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3688
│ │ │  Rp3689
│ │ │  (dp3690
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.grow_density
│ │ │ +Vbin/molprobity.probescore_ligand
│ │ │  p3691
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3692
│ │ │  Rp3693
│ │ │  (dp3694
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/grow_density.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/probescore_ligand.py
│ │ │  p3695
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3696
│ │ │  Rp3697
│ │ │  (dp3698
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.geometry_minimization
│ │ │ +Vbin/phenix.real_space_diff_map
│ │ │  p3699
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3700
│ │ │  Rp3701
│ │ │  (dp3702
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/geometry_minimization.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/real_space_diff_map.py
│ │ │  p3703
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3704
│ │ │  Rp3705
│ │ │  (dp3706
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.fobs_minus_fobs_map
│ │ │ +Vbin/mmtbx.quantum_interface
│ │ │  p3707
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3708
│ │ │  Rp3709
│ │ │  (dp3710
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fobs_minus_fobs_map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/quantum_interface.py
│ │ │  p3711
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3712
│ │ │  Rp3713
│ │ │  (dp3714
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.fmodel
│ │ │ +Vbin/phenix.map_comparison
│ │ │  p3715
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3716
│ │ │  Rp3717
│ │ │  (dp3718
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fmodel.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/map_comparison.py
│ │ │  p3719
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3720
│ │ │  Rp3721
│ │ │  (dp3722
│ │ │ @@ -10175,972 +10175,972 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3728
│ │ │  Rp3729
│ │ │  (dp3730
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.find_residue_in_pdb
│ │ │ +Vbin/mmtbx.matthews
│ │ │  p3731
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3732
│ │ │  Rp3733
│ │ │  (dp3734
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/find_residue_in_pdb.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/matthews.py
│ │ │  p3735
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3736
│ │ │  Rp3737
│ │ │  (dp3738
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.find_peaks_holes
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb_interpretation
│ │ │  p3739
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3740
│ │ │  Rp3741
│ │ │  (dp3742
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/find_peaks_holes.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/pdb_interpretation.py
│ │ │  p3743
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3744
│ │ │  Rp3745
│ │ │  (dp3746
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.find_peaks_holes
│ │ │ +Vbin/mmtbx.pdb_interpretation
│ │ │  p3747
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3748
│ │ │  Rp3749
│ │ │  (dp3750
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/find_peaks_holes.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/pdb_interpretation.py
│ │ │  p3751
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3752
│ │ │  Rp3753
│ │ │  (dp3754
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.fetch_pdb
│ │ │ +Vbin/phenix.fake_f_obs
│ │ │  p3755
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3756
│ │ │  Rp3757
│ │ │  (dp3758
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fetch_pdb.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fake_f_obs.py
│ │ │  p3759
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3760
│ │ │  Rp3761
│ │ │  (dp3762
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.fetch_pdb
│ │ │ +Vbin/phenix.rank_scale_map
│ │ │  p3763
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3764
│ │ │  Rp3765
│ │ │  (dp3766
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fetch_pdb.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rank_scale_map.py
│ │ │  p3767
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3768
│ │ │  Rp3769
│ │ │  (dp3770
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.fake_f_obs
│ │ │ +Vbin/mmtbx.estimate_bijvoet_ratio
│ │ │  p3771
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3772
│ │ │  Rp3773
│ │ │  (dp3774
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fake_f_obs.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/estimate_bijvoet_ratio.py
│ │ │  p3775
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3776
│ │ │  Rp3777
│ │ │  (dp3778
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.fab_elbow_angle
│ │ │ +Vbin/phenix.tls_as_xyz
│ │ │  p3779
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3780
│ │ │  Rp3781
│ │ │  (dp3782
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fab_elbow_angle.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/tls_as_xyz.py
│ │ │  p3783
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3784
│ │ │  Rp3785
│ │ │  (dp3786
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.f000
│ │ │ +Vbin/phenix.real_space_correlation
│ │ │  p3787
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3788
│ │ │  Rp3789
│ │ │  (dp3790
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/f000.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/real_space_correlation.py
│ │ │  p3791
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3792
│ │ │  Rp3793
│ │ │  (dp3794
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.estimate_bijvoet_ratio
│ │ │ +Vbin/mmtbx.superpose
│ │ │  p3795
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3796
│ │ │  Rp3797
│ │ │  (dp3798
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/estimate_bijvoet_ratio.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/superpose.py
│ │ │  p3799
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3800
│ │ │  Rp3801
│ │ │  (dp3802
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.emringer_score
│ │ │ +Vbin/phenix.cablam_idealization
│ │ │  p3803
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3804
│ │ │  Rp3805
│ │ │  (dp3806
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/emringer_score.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cablam_idealization.py
│ │ │  p3807
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3808
│ │ │  Rp3809
│ │ │  (dp3810
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.emringer
│ │ │ +Vbin/mmtbx.refine_anomalous_substructure
│ │ │  p3811
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3812
│ │ │  Rp3813
│ │ │  (dp3814
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/emringer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/refine_anomalous_substructure.py
│ │ │  p3815
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3816
│ │ │  Rp3817
│ │ │  (dp3818
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.development.electrons
│ │ │ +Vbin/mmtbx.show_r_factors_by_shell
│ │ │  p3819
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3820
│ │ │  Rp3821
│ │ │  (dp3822
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/electrons.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/show_r_factors_by_shell.py
│ │ │  p3823
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3824
│ │ │  Rp3825
│ │ │  (dp3826
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.dynamics
│ │ │ +Vbin/phenix.rna_validate_puckers
│ │ │  p3827
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3828
│ │ │  Rp3829
│ │ │  (dp3830
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/dynamics.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_puckers.py
│ │ │  p3831
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3832
│ │ │  Rp3833
│ │ │  (dp3834
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.distance_difference
│ │ │ +Vbin/molprobity.rna_validate_puckers
│ │ │  p3835
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3836
│ │ │  Rp3837
│ │ │  (dp3838
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/distance_difference.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_puckers.py
│ │ │  p3839
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3840
│ │ │  Rp3841
│ │ │  (dp3842
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.fem
│ │ │ +Vbin/phenix.molprobity
│ │ │  p3843
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3844
│ │ │  Rp3845
│ │ │  (dp3846
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/development_fem.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/molprobity.py
│ │ │  p3847
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3848
│ │ │  Rp3849
│ │ │  (dp3850
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.feature_enhanced_map
│ │ │ +Vbin/molprobity.molprobity
│ │ │  p3851
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3852
│ │ │  Rp3853
│ │ │  (dp3854
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/development_fem.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/molprobity.py
│ │ │  p3855
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3856
│ │ │  Rp3857
│ │ │  (dp3858
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.development.aev
│ │ │ +Vbin/phenix.clashscore2
│ │ │  p3859
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3860
│ │ │  Rp3861
│ │ │  (dp3862
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/development_aev.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore2.py
│ │ │  p3863
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3864
│ │ │  Rp3865
│ │ │  (dp3866
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.density_modification
│ │ │ +Vbin/molprobity.clashscore2
│ │ │  p3867
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3868
│ │ │  Rp3869
│ │ │  (dp3870
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/density_modification.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore2.py
│ │ │  p3871
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3872
│ │ │  Rp3873
│ │ │  (dp3874
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.debugging.riding
│ │ │ +Vbin/mmtbx.clashscore2
│ │ │  p3875
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3876
│ │ │  Rp3877
│ │ │  (dp3878
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/debug_riding.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore2.py
│ │ │  p3879
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3880
│ │ │  Rp3881
│ │ │  (dp3882
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.comparama
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb_atom_selection
│ │ │  p3883
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3884
│ │ │  Rp3885
│ │ │  (dp3886
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/comparama.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/pdb_atom_selection.py
│ │ │  p3887
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3888
│ │ │  Rp3889
│ │ │  (dp3890
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.clashscore2
│ │ │ +Vbin/mmtbx.mp_geo
│ │ │  p3891
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3892
│ │ │  Rp3893
│ │ │  (dp3894
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore2.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mp_geo.py
│ │ │  p3895
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3896
│ │ │  Rp3897
│ │ │  (dp3898
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.clashscore2
│ │ │ +Vbin/phenix.kinemage
│ │ │  p3899
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3900
│ │ │  Rp3901
│ │ │  (dp3902
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore2.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/kinemage.py
│ │ │  p3903
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3904
│ │ │  Rp3905
│ │ │  (dp3906
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.clashscore2
│ │ │ +Vbin/molprobity.kinemage
│ │ │  p3907
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3908
│ │ │  Rp3909
│ │ │  (dp3910
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore2.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/kinemage.py
│ │ │  p3911
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3912
│ │ │  Rp3913
│ │ │  (dp3914
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.clashscore
│ │ │ +Vbin/phenix.fem
│ │ │  p3915
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3916
│ │ │  Rp3917
│ │ │  (dp3918
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/development_fem.py
│ │ │  p3919
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3920
│ │ │  Rp3921
│ │ │  (dp3922
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.clashscore
│ │ │ +Vbin/phenix.feature_enhanced_map
│ │ │  p3923
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3924
│ │ │  Rp3925
│ │ │  (dp3926
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/development_fem.py
│ │ │  p3927
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3928
│ │ │  Rp3929
│ │ │  (dp3930
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.cif_as_mtz
│ │ │ +Vbin/phenix.map_box
│ │ │  p3931
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3932
│ │ │  Rp3933
│ │ │  (dp3934
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cif_as_mtz.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/map_box.py
│ │ │  p3935
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3936
│ │ │  Rp3937
│ │ │  (dp3938
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cif_as_mtz
│ │ │ +Vbin/phenix.validate_ligands
│ │ │  p3939
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3940
│ │ │  Rp3941
│ │ │  (dp3942
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cif_as_mtz.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/validate_ligands.py
│ │ │  p3943
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3944
│ │ │  Rp3945
│ │ │  (dp3946
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.chiral_validation
│ │ │ +Vbin/mmtbx.validate_ligands
│ │ │  p3947
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3948
│ │ │  Rp3949
│ │ │  (dp3950
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/chiral_validation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/validate_ligands.py
│ │ │  p3951
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3952
│ │ │  Rp3953
│ │ │  (dp3954
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.chiral_validation
│ │ │ +Vbin/phenix.r_factor_statistics
│ │ │  p3955
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3956
│ │ │  Rp3957
│ │ │  (dp3958
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/chiral_validation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/r_factor_statistics.py
│ │ │  p3959
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3960
│ │ │  Rp3961
│ │ │  (dp3962
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.cc_star
│ │ │ +Vbin/phenix.secondary_structure_validation
│ │ │  p3963
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3964
│ │ │  Rp3965
│ │ │  (dp3966
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cc_star.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/secondary_structure_validation.py
│ │ │  p3967
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3968
│ │ │  Rp3969
│ │ │  (dp3970
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.cbetadev
│ │ │ +Vbin/mmtbx.find_residue_in_pdb
│ │ │  p3971
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3972
│ │ │  Rp3973
│ │ │  (dp3974
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cbetadev.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/find_residue_in_pdb.py
│ │ │  p3975
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3976
│ │ │  Rp3977
│ │ │  (dp3978
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.cbetadev
│ │ │ +Vbin/phenix.rna_validate
│ │ │  p3979
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3980
│ │ │  Rp3981
│ │ │  (dp3982
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cbetadev.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate.py
│ │ │  p3983
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3984
│ │ │  Rp3985
│ │ │  (dp3986
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.cablam_idealization
│ │ │ +Vbin/molprobity.rna_validate
│ │ │  p3987
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3988
│ │ │  Rp3989
│ │ │  (dp3990
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cablam_idealization.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate.py
│ │ │  p3991
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3992
│ │ │  Rp3993
│ │ │  (dp3994
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.cablam
│ │ │ +Vbin/mmtbx.validation_summary
│ │ │  p3995
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3996
│ │ │  Rp3997
│ │ │  (dp3998
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cablam.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/validation_summary.py
│ │ │  p3999
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4000
│ │ │  Rp4001
│ │ │  (dp4002
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.cablam
│ │ │ +Vbin/phenix.model_map
│ │ │  p4003
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4004
│ │ │  Rp4005
│ │ │  (dp4006
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cablam.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_map.py
│ │ │  p4007
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4008
│ │ │  Rp4009
│ │ │  (dp4010
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.barbed_wire_analysis
│ │ │ +Vbin/mmtbx.prepare_pdb_deposition
│ │ │  p4011
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4012
│ │ │  Rp4013
│ │ │  (dp4014
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/barbed_wire_analysis.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/prepare_pdb_deposition.py
│ │ │  p4015
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4016
│ │ │  Rp4017
│ │ │  (dp4018
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.barbed_wire_analysis
│ │ │ +Vbin/phenix.tls
│ │ │  p4019
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4020
│ │ │  Rp4021
│ │ │  (dp4022
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/barbed_wire_analysis.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/tls.py
│ │ │  p4023
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4024
│ │ │  Rp4025
│ │ │  (dp4026
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.development.valence_simple
│ │ │ +Vbin/mmtbx.nonbonded_overlaps
│ │ │  p4027
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4028
│ │ │  Rp4029
│ │ │  (dp4030
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/atom_valence_simple.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/nonbonded_overlaps.py
│ │ │  p4031
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4032
│ │ │  Rp4033
│ │ │  (dp4034
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.arginine_geometry
│ │ │ +Vbin/phenix.map_to_structure_factors
│ │ │  p4035
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4036
│ │ │  Rp4037
│ │ │  (dp4038
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/arginine_geometry.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/map_to_structure_factors.py
│ │ │  p4039
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4040
│ │ │  Rp4041
│ │ │  (dp4042
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.apply_ncs_to_ligand
│ │ │ +Vbin/phenix.emringer
│ │ │  p4043
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4044
│ │ │  Rp4045
│ │ │  (dp4046
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/apply_ncs_to_ligand.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/emringer.py
│ │ │  p4047
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4048
│ │ │  Rp4049
│ │ │  (dp4050
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.angle
│ │ │ +Vbin/phenix.omegalyze
│ │ │  p4051
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4052
│ │ │  Rp4053
│ │ │  (dp4054
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/angle.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/omegalyze.py
│ │ │  p4055
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4056
│ │ │  Rp4057
│ │ │  (dp4058
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.altloc_remediate
│ │ │ +Vbin/molprobity.omegalyze
│ │ │  p4059
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4060
│ │ │  Rp4061
│ │ │  (dp4062
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/altloc_remediate.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/omegalyze.py
│ │ │  p4063
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4064
│ │ │  Rp4065
│ │ │  (dp4066
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/distl.thin_client
│ │ │ +Vbin/distl.image_viewer
│ │ │  p4067
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4068
│ │ │  Rp4069
│ │ │  (dp4070
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/thin_client.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/image_viewer.py
│ │ │  p4071
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4072
│ │ │  Rp4073
│ │ │  (dp4074
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/distl.sweep_strength
│ │ │ +Vbin/distl.thin_client
│ │ │  p4075
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4076
│ │ │  Rp4077
│ │ │  (dp4078
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/sweep_strength.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/thin_client.py
│ │ │  p4079
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4080
│ │ │  Rp4081
│ │ │  (dp4082
│ │ │ @@ -11165,202 +11165,202 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4088
│ │ │  Rp4089
│ │ │  (dp4090
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/distl.mp_spotfinder_server_read_file
│ │ │ +Vbin/distl.sweep_strength
│ │ │  p4091
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4092
│ │ │  Rp4093
│ │ │  (dp4094
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/mp_spotfinder_server_read_file.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/sweep_strength.py
│ │ │  p4095
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4096
│ │ │  Rp4097
│ │ │  (dp4098
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/distl.image_viewer
│ │ │ +Vbin/distl.find_active_area
│ │ │  p4099
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4100
│ │ │  Rp4101
│ │ │  (dp4102
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/image_viewer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/find_active_area.py
│ │ │  p4103
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4104
│ │ │  Rp4105
│ │ │  (dp4106
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/distl.find_active_area
│ │ │ +Vbin/distl.mp_spotfinder_server_read_file
│ │ │  p4107
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4108
│ │ │  Rp4109
│ │ │  (dp4110
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/find_active_area.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/mp_spotfinder_server_read_file.py
│ │ │  p4111
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4112
│ │ │  Rp4113
│ │ │  (dp4114
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.image_viewer
│ │ │ +Vbin/rstbx.simage.solver
│ │ │  p4115
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4116
│ │ │  Rp4117
│ │ │  (dp4118
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/viewer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/simage.solver.py
│ │ │  p4119
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4120
│ │ │  Rp4121
│ │ │  (dp4122
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.image_viewer
│ │ │ +Vbin/rstbx.simage.explore_completeness
│ │ │  p4123
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4124
│ │ │  Rp4125
│ │ │  (dp4126
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/slip_viewer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/simage.explore_completeness.py
│ │ │  p4127
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4128
│ │ │  Rp4129
│ │ │  (dp4130
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/rstbx.simage.wx_display
│ │ │ +Vbin/phenix.image_viewer
│ │ │  p4131
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4132
│ │ │  Rp4133
│ │ │  (dp4134
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/simage.wx_display.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/viewer.py
│ │ │  p4135
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4136
│ │ │  Rp4137
│ │ │  (dp4138
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/rstbx.simage.solver
│ │ │ +Vbin/cctbx.image_viewer
│ │ │  p4139
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4140
│ │ │  Rp4141
│ │ │  (dp4142
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/simage.solver.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/slip_viewer.py
│ │ │  p4143
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4144
│ │ │  Rp4145
│ │ │  (dp4146
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/rstbx.simage.explore_completeness
│ │ │ +Vbin/rstbx.simage.create
│ │ │  p4147
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4148
│ │ │  Rp4149
│ │ │  (dp4150
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/simage.explore_completeness.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/simage.create.py
│ │ │  p4151
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4152
│ │ │  Rp4153
│ │ │  (dp4154
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/rstbx.simage.create
│ │ │ +Vbin/rstbx.simage.wx_display
│ │ │  p4155
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4156
│ │ │  Rp4157
│ │ │  (dp4158
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/simage.create.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/simage.wx_display.py
│ │ │  p4159
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4160
│ │ │  Rp4161
│ │ │  (dp4162
│ │ │ @@ -11407,37 +11407,37 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4176
│ │ │  Rp4177
│ │ │  (dp4178
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/wxtbx.xtriage
│ │ │ +Vbin/wxtbx.plan_sad_experiment
│ │ │  p4179
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4180
│ │ │  Rp4181
│ │ │  (dp4182
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/xtriage.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/plan_sad_experiment.py
│ │ │  p4183
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4184
│ │ │  Rp4185
│ │ │  (dp4186
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.xtriage_gui
│ │ │ +Vbin/wxtbx.xtriage
│ │ │  p4187
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4188
│ │ │  Rp4189
│ │ │  (dp4190
│ │ │ @@ -11451,92 +11451,92 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4192
│ │ │  Rp4193
│ │ │  (dp4194
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.wxpython
│ │ │ +Vbin/mmtbx.xtriage_gui
│ │ │  p4195
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4196
│ │ │  Rp4197
│ │ │  (dp4198
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/wxpython.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/xtriage.py
│ │ │  p4199
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4200
│ │ │  Rp4201
│ │ │  (dp4202
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/wxtbx.show_file_info
│ │ │ +Vbin/cctbx.plot_anomalous_scattering
│ │ │  p4203
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4204
│ │ │  Rp4205
│ │ │  (dp4206
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/show_file_info.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/plot_anomalous_scattering.py
│ │ │  p4207
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4208
│ │ │  Rp4209
│ │ │  (dp4210
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.plot_anomalous_scattering
│ │ │ +Vbin/wxtbx.anomalous_differences_histogram
│ │ │  p4211
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4212
│ │ │  Rp4213
│ │ │  (dp4214
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/plot_anomalous_scattering.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/anomalous_differences_histogram.py
│ │ │  p4215
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4216
│ │ │  Rp4217
│ │ │  (dp4218
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/wxtbx.plan_sad_experiment
│ │ │ +Vbin/wxtbx.show_file_info
│ │ │  p4219
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4220
│ │ │  Rp4221
│ │ │  (dp4222
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/plan_sad_experiment.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/show_file_info.py
│ │ │  p4223
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4224
│ │ │  Rp4225
│ │ │  (dp4226
│ │ │ @@ -11561,620 +11561,620 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4232
│ │ │  Rp4233
│ │ │  (dp4234
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb_editor
│ │ │ +Vbin/cctbx.loggraph
│ │ │  p4235
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4236
│ │ │  Rp4237
│ │ │  (dp4238
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/pdb_editor.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/loggraph.py
│ │ │  p4239
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4240
│ │ │  Rp4241
│ │ │  (dp4242
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.loggraph
│ │ │ +Vbin/mmtbx.bfactor_plot
│ │ │  p4243
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4244
│ │ │  Rp4245
│ │ │  (dp4246
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/loggraph.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/b_plot.py
│ │ │  p4247
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4248
│ │ │  Rp4249
│ │ │  (dp4250
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/wxtbx.inspect_r_free_flags
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb_editor
│ │ │  p4251
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4252
│ │ │  Rp4253
│ │ │  (dp4254
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/inspect_r_free_flags.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/pdb_editor.py
│ │ │  p4255
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4256
│ │ │  Rp4257
│ │ │  (dp4258
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.bfactor_plot
│ │ │ +Vbin/cctbx.wxpython
│ │ │  p4259
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4260
│ │ │  Rp4261
│ │ │  (dp4262
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/b_plot.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/wxpython.py
│ │ │  p4263
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4264
│ │ │  Rp4265
│ │ │  (dp4266
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/wxtbx.anomalous_differences_histogram
│ │ │ +Vbin/wxtbx.inspect_r_free_flags
│ │ │  p4267
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4268
│ │ │  Rp4269
│ │ │  (dp4270
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/anomalous_differences_histogram.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/inspect_r_free_flags.py
│ │ │  p4271
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4272
│ │ │  Rp4273
│ │ │  (dp4274
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dev.dxtbx.simulate_collection
│ │ │ +Vbin/dxtbx.show_matching_formats
│ │ │  p4275
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4276
│ │ │  Rp4277
│ │ │  (dp4278
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/simulate_collection.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/show_matching_formats.py
│ │ │  p4279
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4280
│ │ │  Rp4281
│ │ │  (dp4282
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.show_registry
│ │ │ +Vbin/dxtbx.overload
│ │ │  p4283
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4284
│ │ │  Rp4285
│ │ │  (dp4286
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/show_registry.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/overload.py
│ │ │  p4287
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4288
│ │ │  Rp4289
│ │ │  (dp4290
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.show_matching_formats
│ │ │ +Vbin/dev.dxtbx.image_availability
│ │ │  p4291
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4292
│ │ │  Rp4293
│ │ │  (dp4294
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/show_matching_formats.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image_availability.py
│ │ │  p4295
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4296
│ │ │  Rp4297
│ │ │  (dp4298
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.show_mask_info
│ │ │ +Vbin/dev.dxtbx.read_sequence
│ │ │  p4299
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4300
│ │ │  Rp4301
│ │ │  (dp4302
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/show_mask_info.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/read_sequence.py
│ │ │  p4303
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4304
│ │ │  Rp4305
│ │ │  (dp4306
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.saturation
│ │ │ +Vbin/dxtbx.detector_superpose
│ │ │  p4307
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4308
│ │ │  Rp4309
│ │ │  (dp4310
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/saturation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/detector_superpose.py
│ │ │  p4311
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4312
│ │ │  Rp4313
│ │ │  (dp4314
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dev.dxtbx.read_sequence
│ │ │ +Vbin/dxtbx.dlsnxs2cbf
│ │ │  p4315
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4316
│ │ │  Rp4317
│ │ │  (dp4318
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/read_sequence.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/dlsnxs2cbf.py
│ │ │  p4319
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4320
│ │ │  Rp4321
│ │ │  (dp4322
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.radial_average
│ │ │ +Vbin/dxtbx.print_header
│ │ │  p4323
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4324
│ │ │  Rp4325
│ │ │  (dp4326
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/radial_average.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/print_header.py
│ │ │  p4327
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4328
│ │ │  Rp4329
│ │ │  (dp4330
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.print_matching_images
│ │ │ +Vbin/dxtbx.show_mask_info
│ │ │  p4331
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4332
│ │ │  Rp4333
│ │ │  (dp4334
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/print_matching_images.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/show_mask_info.py
│ │ │  p4335
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4336
│ │ │  Rp4337
│ │ │  (dp4338
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.print_header
│ │ │ +Vbin/dxtbx.plot_detector_models
│ │ │  p4339
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4340
│ │ │  Rp4341
│ │ │  (dp4342
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/print_header.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/plot_detector_models.py
│ │ │  p4343
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4344
│ │ │  Rp4345
│ │ │  (dp4346
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.plot_detector_models
│ │ │ +Vbin/dxtbx.print_matching_images
│ │ │  p4347
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4348
│ │ │  Rp4349
│ │ │  (dp4350
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/plot_detector_models.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/print_matching_images.py
│ │ │  p4351
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4352
│ │ │  Rp4353
│ │ │  (dp4354
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.overload
│ │ │ +Vbin/dxtbx.depends_on
│ │ │  p4355
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4356
│ │ │  Rp4357
│ │ │  (dp4358
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/overload.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/depends_on.py
│ │ │  p4359
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4360
│ │ │  Rp4361
│ │ │  (dp4362
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.install_format
│ │ │ +Vbin/dxtbx.show_registry
│ │ │  p4363
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4364
│ │ │  Rp4365
│ │ │  (dp4366
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/install_format.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/show_registry.py
│ │ │  p4367
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4368
│ │ │  Rp4369
│ │ │  (dp4370
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.image_average
│ │ │ +Vbin/dxtbx.saturation
│ │ │  p4371
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4372
│ │ │  Rp4373
│ │ │  (dp4374
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image_average.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/saturation.py
│ │ │  p4375
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4376
│ │ │  Rp4377
│ │ │  (dp4378
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cxi.image_average
│ │ │ +Vbin/dxtbx.any2nexus
│ │ │  p4379
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4380
│ │ │  Rp4381
│ │ │  (dp4382
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image_average.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/any2nexus.py
│ │ │  p4383
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4384
│ │ │  Rp4385
│ │ │  (dp4386
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dev.dxtbx.image_availability
│ │ │ +Vbin/dev.dxtbx.simulate_collection
│ │ │  p4387
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4388
│ │ │  Rp4389
│ │ │  (dp4390
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image_availability.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/simulate_collection.py
│ │ │  p4391
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4392
│ │ │  Rp4393
│ │ │  (dp4394
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.image2pickle
│ │ │ +Vbin/dxtbx.install_format
│ │ │  p4395
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4396
│ │ │  Rp4397
│ │ │  (dp4398
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image2pickle.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/install_format.py
│ │ │  p4399
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4400
│ │ │  Rp4401
│ │ │  (dp4402
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cxi.image2pickle
│ │ │ +Vbin/dxtbx.display_parallax_correction
│ │ │  p4403
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4404
│ │ │  Rp4405
│ │ │  (dp4406
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image2pickle.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/display_parallax_correction.py
│ │ │  p4407
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4408
│ │ │  Rp4409
│ │ │  (dp4410
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.dlsnxs2cbf
│ │ │ +Vbin/dxtbx.radial_average
│ │ │  p4411
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4412
│ │ │  Rp4413
│ │ │  (dp4414
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/dlsnxs2cbf.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/radial_average.py
│ │ │  p4415
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4416
│ │ │  Rp4417
│ │ │  (dp4418
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.display_parallax_correction
│ │ │ +Vbin/dev.dxtbx.debug_memory
│ │ │  p4419
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4420
│ │ │  Rp4421
│ │ │  (dp4422
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/display_parallax_correction.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/debug_memory.py
│ │ │  p4423
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4424
│ │ │  Rp4425
│ │ │  (dp4426
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.detector_superpose
│ │ │ +Vbin/dxtbx.image2pickle
│ │ │  p4427
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4428
│ │ │  Rp4429
│ │ │  (dp4430
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/detector_superpose.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image2pickle.py
│ │ │  p4431
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4432
│ │ │  Rp4433
│ │ │  (dp4434
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.depends_on
│ │ │ +Vbin/cxi.image2pickle
│ │ │  p4435
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4436
│ │ │  Rp4437
│ │ │  (dp4438
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/depends_on.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image2pickle.py
│ │ │  p4439
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4440
│ │ │  Rp4441
│ │ │  (dp4442
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dev.dxtbx.debug_memory
│ │ │ +Vbin/dxtbx.image_average
│ │ │  p4443
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4444
│ │ │  Rp4445
│ │ │  (dp4446
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/debug_memory.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image_average.py
│ │ │  p4447
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4448
│ │ │  Rp4449
│ │ │  (dp4450
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.any2nexus
│ │ │ +Vbin/cxi.image_average
│ │ │  p4451
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4452
│ │ │  Rp4453
│ │ │  (dp4454
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/any2nexus.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image_average.py
│ │ │  p4455
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4456
│ │ │  Rp4457
│ │ │  (dp4458
│ │ ├── ./usr/lib/cctbx/python3.14/libtbx_env
│ │ │ @@ -111,61 +111,61 @@
│ │ │  p49
│ │ │  NsVexplicitly_requested_modules
│ │ │  p50
│ │ │  c__builtin__
│ │ │  set
│ │ │  p51
│ │ │  ((lp52
│ │ │ -Vgltbx
│ │ │ +Vmmtbx
│ │ │  p53
│ │ │ -aVwxtbx
│ │ │ +aVccp4io
│ │ │  p54
│ │ │ -aVboost_adaptbx
│ │ │ +aVrstbx
│ │ │  p55
│ │ │ -aVdxtbx
│ │ │ +aVomptbx
│ │ │  p56
│ │ │ -aViotbx
│ │ │ +aVcctbx
│ │ │  p57
│ │ │ -aVccp4io_adaptbx
│ │ │ +aVcma_es
│ │ │  p58
│ │ │ -aVcrys3d
│ │ │ +aVfable
│ │ │  p59
│ │ │ -aVserialtbx
│ │ │ +aVsmtbx
│ │ │  p60
│ │ │ -aVomptbx
│ │ │ -p61
│ │ │  aVxcif
│ │ │ +p61
│ │ │ +aVcbflib_adaptbx
│ │ │  p62
│ │ │ -aVspotfinder
│ │ │ +aVscitbx
│ │ │  p63
│ │ │  aVlibtbx
│ │ │  p64
│ │ │ -aVcma_es
│ │ │ +aVspotfinder
│ │ │  p65
│ │ │ -aVsmtbx
│ │ │ +aVtbxx
│ │ │  p66
│ │ │ -aVcbflib_adaptbx
│ │ │ +aViotbx
│ │ │  p67
│ │ │ -aVannlib_adaptbx
│ │ │ +aVwxtbx
│ │ │  p68
│ │ │ -aVmmtbx
│ │ │ +aVannlib
│ │ │  p69
│ │ │ -aVcctbx
│ │ │ +aVannlib_adaptbx
│ │ │  p70
│ │ │ -aVrstbx
│ │ │ +aVgltbx
│ │ │  p71
│ │ │ -aVscitbx
│ │ │ +aVccp4io_adaptbx
│ │ │  p72
│ │ │ -aVfable
│ │ │ +aVboost_adaptbx
│ │ │  p73
│ │ │ -aVtbxx
│ │ │ +aVserialtbx
│ │ │  p74
│ │ │ -aVccp4io
│ │ │ +aVcrys3d
│ │ │  p75
│ │ │ -aVannlib
│ │ │ +aVdxtbx
│ │ │  p76
│ │ │  atp77
│ │ │  Rp78
│ │ │  sVbuild_options
│ │ │  p79
│ │ │  g0
│ │ │  (clibtbx.env_config
│ │ │ @@ -644,15 +644,15 @@
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │  Vannlib
│ │ │  p272
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp273
│ │ │  g272
│ │ │ -ag68
│ │ │ +ag70
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp274
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp275
│ │ │  Rp276
│ │ │ @@ -698,15 +698,15 @@
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │  Vcbflib
│ │ │  p292
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp293
│ │ │  g292
│ │ │ -ag67
│ │ │ +ag62
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp294
│ │ │  Nag0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp295
│ │ │  Rp296
│ │ │ @@ -741,15 +741,15 @@
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │  Vccp4io
│ │ │  p308
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp309
│ │ │  g308
│ │ │ -ag58
│ │ │ +ag72
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp310
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp311
│ │ │  Rp312
│ │ │ @@ -833,18 +833,18 @@
│ │ │  Rp343
│ │ │  (dp344
│ │ │  g135
│ │ │  g4
│ │ │  sg136
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │ -g70
│ │ │ +g57
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp345
│ │ │ -g70
│ │ │ +g57
│ │ │  aVcctbx_adaptbx
│ │ │  p346
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp347
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -881,18 +881,18 @@
│ │ │  Rp361
│ │ │  (dp362
│ │ │  g135
│ │ │  g4
│ │ │  sg136
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │ -g59
│ │ │ +g75
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp363
│ │ │ -g59
│ │ │ +g75
│ │ │  aVcrys3d_adaptbx
│ │ │  p364
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp365
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -1065,18 +1065,18 @@
│ │ │  Rp432
│ │ │  (dp433
│ │ │  g135
│ │ │  g4
│ │ │  sg136
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │ -g56
│ │ │ +g76
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp434
│ │ │ -g56
│ │ │ +g76
│ │ │  aVdxtbx_adaptbx
│ │ │  p435
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp436
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -1110,18 +1110,18 @@
│ │ │  Rp449
│ │ │  (dp450
│ │ │  g135
│ │ │  g4
│ │ │  sg136
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │ -g53
│ │ │ +g71
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp451
│ │ │ -g53
│ │ │ +g71
│ │ │  aVgltbx_adaptbx
│ │ │  p452
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp453
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -1153,18 +1153,18 @@
│ │ │  Rp465
│ │ │  (dp466
│ │ │  g135
│ │ │  g4
│ │ │  sg136
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │ -g69
│ │ │ +g53
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp467
│ │ │ -g69
│ │ │ +g53
│ │ │  aVmmtbx_adaptbx
│ │ │  p468
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp469
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -1250,18 +1250,18 @@
│ │ │  Rp502
│ │ │  (dp503
│ │ │  g135
│ │ │  g4
│ │ │  sg136
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │ -g71
│ │ │ +g55
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp504
│ │ │ -g71
│ │ │ +g55
│ │ │  aVrstbx_adaptbx
│ │ │  p505
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp506
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -1297,18 +1297,18 @@
│ │ │  Rp518
│ │ │  (dp519
│ │ │  g135
│ │ │  g4
│ │ │  sg136
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │ -g60
│ │ │ +g74
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp520
│ │ │ -g60
│ │ │ +g74
│ │ │  aVserialtbx_adaptbx
│ │ │  p521
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp522
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -1339,18 +1339,18 @@
│ │ │  Rp534
│ │ │  (dp535
│ │ │  g135
│ │ │  g4
│ │ │  sg136
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │ -g54
│ │ │ +g68
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp536
│ │ │ -g54
│ │ │ +g68
│ │ │  aVwxtbx_adaptbx
│ │ │  p537
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp538
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -1381,18 +1381,18 @@
│ │ │  Rp550
│ │ │  (dp551
│ │ │  g135
│ │ │  g4
│ │ │  sg136
│ │ │  g137
│ │ │  sg138
│ │ │ -g62
│ │ │ +g61
│ │ │  sg140
│ │ │  (lp552
│ │ │ -g62
│ │ │ +g61
│ │ │  aVxcif_adaptbx
│ │ │  p553
│ │ │  asg143
│ │ │  (lp554
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -1435,41 +1435,41 @@
│ │ │  g218
│ │ │  sg238
│ │ │  g236
│ │ │  sg292
│ │ │  g290
│ │ │  sg308
│ │ │  g306
│ │ │ -sg70
│ │ │ +sg57
│ │ │  g343
│ │ │  sg328
│ │ │  g326
│ │ │ -sg59
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│ │ │  g361
│ │ │ -sg56
│ │ │ +sg76
│ │ │  g432
│ │ │  sg414
│ │ │  g412
│ │ │  sg379
│ │ │  g377
│ │ │  sg396
│ │ │  g394
│ │ │ -sg53
│ │ │ +sg71
│ │ │  g449
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│ │ │ +sg53
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│ │ │ -sg71
│ │ │ +sg55
│ │ │  g502
│ │ │  sg486
│ │ │  g484
│ │ │ -sg60
│ │ │ +sg74
│ │ │  g518
│ │ │ -sg54
│ │ │ +sg68
│ │ │  g534
│ │ │ -sg62
│ │ │ +sg61
│ │ │  g550
│ │ │  ssVmodule_dist_paths
│ │ │  p567
│ │ │  (dp568
│ │ │  g139
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │ @@ -1490,15 +1490,15 @@
│ │ │  Rp574
│ │ │  (dp575
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/annlib
│ │ │  p576
│ │ │ -sbsg68
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│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp577
│ │ │  Rp578
│ │ │  (dp579
│ │ │  g21
│ │ │ @@ -1586,15 +1586,15 @@
│ │ │  Rp606
│ │ │  (dp607
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/fable
│ │ │  p608
│ │ │ -sbsg67
│ │ │ +sbsg62
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp609
│ │ │  Rp610
│ │ │  (dp611
│ │ │  g21
│ │ │ @@ -1610,27 +1610,27 @@
│ │ │  Rp614
│ │ │  (dp615
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/ccp4io
│ │ │  p616
│ │ │ -sbsg58
│ │ │ +sbsg72
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp617
│ │ │  Rp618
│ │ │  (dp619
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/ccp4io_adaptbx
│ │ │  p620
│ │ │ -sbsg70
│ │ │ +sbsg57
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp621
│ │ │  Rp622
│ │ │  (dp623
│ │ │  g21
│ │ │ @@ -1646,27 +1646,27 @@
│ │ │  Rp626
│ │ │  (dp627
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/chiltbx
│ │ │  p628
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│ │ │ +sbsg75
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp629
│ │ │  Rp630
│ │ │  (dp631
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/crys3d
│ │ │  p632
│ │ │ -sbsg56
│ │ │ +sbsg76
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp633
│ │ │  Rp634
│ │ │  (dp635
│ │ │  g21
│ │ │ @@ -1706,39 +1706,39 @@
│ │ │  Rp646
│ │ │  (dp647
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/smtbx
│ │ │  p648
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│ │ │  (g17
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│ │ │  (dp651
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│ │ │  p652
│ │ │ -sbsg69
│ │ │ +sbsg53
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│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp653
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│ │ │  (dp655
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/mmtbx
│ │ │  p656
│ │ │ -sbsg71
│ │ │ +sbsg55
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│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp657
│ │ │  Rp658
│ │ │  (dp659
│ │ │  g21
│ │ │ @@ -1754,39 +1754,39 @@
│ │ │  Rp662
│ │ │  (dp663
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/spotfinder
│ │ │  p664
│ │ │ -sbsg60
│ │ │ +sbsg74
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp665
│ │ │  Rp666
│ │ │  (dp667
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/serialtbx
│ │ │  p668
│ │ │ -sbsg54
│ │ │ +sbsg68
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
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│ │ │  Ntp669
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│ │ │  g21
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│ │ │  sg26
│ │ │  Vlib/python3/dist-packages/wxtbx
│ │ │  p672
│ │ │ -sbsg62
│ │ │ +sbsg61
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp673
│ │ │  Rp674
│ │ │  (dp675
│ │ │  g21
│ │ │ @@ -1806,19 +1806,19 @@
│ │ │  ((lp682
│ │ │  tp683
│ │ │  Rp684
│ │ │  sVmissing_optional
│ │ │  p685
│ │ │  g51
│ │ │  ((lp686
│ │ │ -g427
│ │ │ -ag250
│ │ │ -ag480
│ │ │ -ag478
│ │ │ +g250
│ │ │  ag479
│ │ │ +ag478
│ │ │ +ag427
│ │ │ +ag480
│ │ │  atp687
│ │ │  Rp688
│ │ │  sVscons_dist_path
│ │ │  p689
│ │ │  g0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │ @@ -1881,1984 +1881,1984 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp712
│ │ │  Rp713
│ │ │  (dp714
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.wait_for_file
│ │ │ +Vbin/libtbx.exec
│ │ │  p715
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp716
│ │ │  Rp717
│ │ │  (dp718
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/wait_for_file.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/exec.sh
│ │ │  p719
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp720
│ │ │  Rp721
│ │ │  (dp722
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.valgrind
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_untested
│ │ │  p723
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp724
│ │ │  Rp725
│ │ │  (dp726
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/valgrind.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_untested.py
│ │ │  p727
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp728
│ │ │  Rp729
│ │ │  (dp730
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.unpack_in_sources
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_full_command_path
│ │ │  p731
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp732
│ │ │  Rp733
│ │ │  (dp734
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/unpack_in_sources.csh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_full_command_path.py
│ │ │  p735
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp736
│ │ │  Rp737
│ │ │  (dp738
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.tcsh
│ │ │ +Vbin/libtbx.refresh
│ │ │  p739
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp740
│ │ │  Rp741
│ │ │  (dp742
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/tcsh.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/refresh.sh
│ │ │  p743
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp744
│ │ │  Rp745
│ │ │  (dp746
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.start_process
│ │ │ +Vbin/libtbx.printenv
│ │ │  p747
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp748
│ │ │  Rp749
│ │ │  (dp750
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/start_process.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/printenv.py
│ │ │  p751
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp752
│ │ │  Rp753
│ │ │  (dp754
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.start_binary_bundle
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_dist_paths
│ │ │  p755
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp756
│ │ │  Rp757
│ │ │  (dp758
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/start_binary_bundle.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_dist_paths.py
│ │ │  p759
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp760
│ │ │  Rp761
│ │ │  (dp762
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/sphinx.build
│ │ │ +Vbin/libtbx.gdb
│ │ │  p763
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp764
│ │ │  Rp765
│ │ │  (dp766
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/sphinx_build.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/gdb.sh
│ │ │  p767
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp768
│ │ │  Rp769
│ │ │  (dp770
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_variable_names
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_reserved_names
│ │ │  p771
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp772
│ │ │  Rp773
│ │ │  (dp774
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_variable_names.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_reserved_names.py
│ │ │  p775
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp776
│ │ │  Rp777
│ │ │  (dp778
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_tests
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_but_no_repr
│ │ │  p779
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp780
│ │ │  Rp781
│ │ │  (dp782
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_tests.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_but_no_repr.py
│ │ │  p783
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp784
│ │ │  Rp785
│ │ │  (dp786
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_repository_paths
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_in_repositories
│ │ │  p787
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp788
│ │ │  Rp789
│ │ │  (dp790
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_repository_paths.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_in_repositories.py
│ │ │  p791
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp792
│ │ │  Rp793
│ │ │  (dp794
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_pythonpath
│ │ │ +Vbin/libtbx.create_installer
│ │ │  p795
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp796
│ │ │  Rp797
│ │ │  (dp798
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_pythonpath.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_installer.py
│ │ │  p799
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp800
│ │ │  Rp801
│ │ │  (dp802
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_python_sys_executable
│ │ │ +Vbin/libtbx.assert_stdin
│ │ │  p803
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp804
│ │ │  Rp805
│ │ │  (dp806
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_python_sys_executable.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_stdin.py
│ │ │  p807
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp808
│ │ │  Rp809
│ │ │  (dp810
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_python_dependencies
│ │ │ +Vbin/libtbx.clean_clutter
│ │ │  p811
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp812
│ │ │  Rp813
│ │ │  (dp814
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_python_dependencies.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/clean_clutter.py
│ │ │  p815
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp816
│ │ │  Rp817
│ │ │  (dp818
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_numpy_version
│ │ │ +Vbin/libtbx.create_install_script_bat
│ │ │  p819
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp820
│ │ │  Rp821
│ │ │  (dp822
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_numpy_version.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_install_script_bat.py
│ │ │  p823
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp824
│ │ │  Rp825
│ │ │  (dp826
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_numeric_version
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_env
│ │ │  p827
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp828
│ │ │  Rp829
│ │ │  (dp830
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_numeric_version.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_env.py
│ │ │  p831
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp832
│ │ │  Rp833
│ │ │  (dp834
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_number_of_processors
│ │ │ +Vbin/libtbx.run_tests_parallel
│ │ │  p835
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp836
│ │ │  Rp837
│ │ │  (dp838
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_number_of_processors.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/run_tests_parallel.py
│ │ │  p839
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp840
│ │ │  Rp841
│ │ │  (dp842
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_module_dependencies
│ │ │ +Vbin/libtbx.phil
│ │ │  p843
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp844
│ │ │  Rp845
│ │ │  (dp846
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_module_dependencies.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/phil.py
│ │ │  p847
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp848
│ │ │  Rp849
│ │ │  (dp850
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_lib_path
│ │ │ +Vbin/libtbx.resource_monitor_plot
│ │ │  p851
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp852
│ │ │  Rp853
│ │ │  (dp854
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_lib_path.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/resource_monitor_plot.py
│ │ │  p855
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp856
│ │ │  Rp857
│ │ │  (dp858
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_include_paths
│ │ │ +Vbin/libtbx.assert_stdin_ends_with
│ │ │  p859
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp860
│ │ │  Rp861
│ │ │  (dp862
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_include_paths.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_stdin_ends_with.py
│ │ │  p863
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp864
│ │ │  Rp865
│ │ │  (dp866
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_host_and_user
│ │ │ +Vbin/libtbx.bootstrap
│ │ │  p867
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp868
│ │ │  Rp869
│ │ │  (dp870
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_host_and_user.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bootstrap.py
│ │ │  p871
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp872
│ │ │  Rp873
│ │ │  (dp874
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_full_command_path
│ │ │ +Vbin/libtbx.sge_available_slots
│ │ │  p875
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp876
│ │ │  Rp877
│ │ │  (dp878
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_full_command_path.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/sge_available_slots.py
│ │ │  p879
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp880
│ │ │  Rp881
│ │ │  (dp882
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_environ_usage
│ │ │ +Vbin/libtbx.configure
│ │ │  p883
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp884
│ │ │  Rp885
│ │ │  (dp886
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_environ_usage.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/configure.sh
│ │ │  p887
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp888
│ │ │  Rp889
│ │ │  (dp890
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_env
│ │ │ +Vbin/libtbx.dtrace
│ │ │  p891
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp892
│ │ │  Rp893
│ │ │  (dp894
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_env.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/dtrace.py
│ │ │  p895
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp896
│ │ │  Rp897
│ │ │  (dp898
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_dist_paths
│ │ │ +Vbin/libtbx.wait_for_file
│ │ │  p899
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp900
│ │ │  Rp901
│ │ │  (dp902
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_dist_paths.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/wait_for_file.py
│ │ │  p903
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp904
│ │ │  Rp905
│ │ │  (dp906
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_date_and_time
│ │ │ +Vbin/libtbx.remove_unused_imports
│ │ │  p907
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp908
│ │ │  Rp909
│ │ │  (dp910
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_date_and_time.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/remove_unused_imports.py
│ │ │  p911
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp912
│ │ │  Rp913
│ │ │  (dp914
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_commands
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_module_dependencies
│ │ │  p915
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp916
│ │ │  Rp917
│ │ │  (dp918
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_commands.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_module_dependencies.py
│ │ │  p919
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp920
│ │ │  Rp921
│ │ │  (dp922
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_but_no_repr
│ │ │ +Vbin/libtbx.check_libcpp
│ │ │  p923
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp924
│ │ │  Rp925
│ │ │  (dp926
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_but_no_repr.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/check_libcpp.py
│ │ │  p927
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp928
│ │ │  Rp929
│ │ │  (dp930
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_build_path
│ │ │ +Vbin/libtbx.seconds_since_the_epoch
│ │ │  p931
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp932
│ │ │  Rp933
│ │ │  (dp934
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_build_path.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/seconds_since_the_epoch.py
│ │ │  p935
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp936
│ │ │  Rp937
│ │ │  (dp938
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_build_options
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_host_and_user
│ │ │  p939
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp940
│ │ │  Rp941
│ │ │  (dp942
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_build_options.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_host_and_user.py
│ │ │  p943
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp944
│ │ │  Rp945
│ │ │  (dp946
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_bin_path
│ │ │ +Vbin/libtbx.list_modules
│ │ │  p947
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp948
│ │ │  Rp949
│ │ │  (dp950
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_bin_path.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/list_modules.py
│ │ │  p951
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp952
│ │ │  Rp953
│ │ │  (dp954
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.show_all_on_path
│ │ │ +Vbin/libtbx.line_count
│ │ │  p955
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp956
│ │ │  Rp957
│ │ │  (dp958
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_all_on_path.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/line_count.py
│ │ │  p959
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp960
│ │ │  Rp961
│ │ │  (dp962
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.sh
│ │ │ +Vbin/libtbx.easy_qsub
│ │ │  p963
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp964
│ │ │  Rp965
│ │ │  (dp966
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/sh.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/easy_qsub.py
│ │ │  p967
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp968
│ │ │  Rp969
│ │ │  (dp970
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.sge_qstat_counts
│ │ │ +Vbin/libtbx.assert_line_count
│ │ │  p971
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp972
│ │ │  Rp973
│ │ │  (dp974
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/sge_qstat_counts.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_line_count.py
│ │ │  p975
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp976
│ │ │  Rp977
│ │ │  (dp978
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.sge_available_slots
│ │ │ +Vbin/libtbx.tcsh
│ │ │  p979
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp980
│ │ │  Rp981
│ │ │  (dp982
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/sge_available_slots.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/tcsh.sh
│ │ │  p983
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp984
│ │ │  Rp985
│ │ │  (dp986
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.seconds_since_the_epoch
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_lib_path
│ │ │  p987
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp988
│ │ │  Rp989
│ │ │  (dp990
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/seconds_since_the_epoch.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_lib_path.py
│ │ │  p991
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp992
│ │ │  Rp993
│ │ │  (dp994
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.scons
│ │ │ +Vbin/libtbx.list_source_files_sorted_by_size
│ │ │  p995
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp996
│ │ │  Rp997
│ │ │  (dp998
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/scons.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/list_source_files_sorted_by_size.py
│ │ │  p999
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1000
│ │ │  Rp1001
│ │ │  (dp1002
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.run_tests_parallel
│ │ │ +Vbin/libtbx.assert_stdin_contains_strings
│ │ │  p1003
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1004
│ │ │  Rp1005
│ │ │  (dp1006
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/run_tests_parallel.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_stdin_contains_strings.py
│ │ │  p1007
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1008
│ │ │  Rp1009
│ │ │  (dp1010
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.run_pickled_function
│ │ │ +Vbin/libtbx.assert_stdin_does_not_contain_strings
│ │ │  p1011
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1012
│ │ │  Rp1013
│ │ │  (dp1014
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/run_pickled_function.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_stdin_contains_strings.py
│ │ │  p1015
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1016
│ │ │  Rp1017
│ │ │  (dp1018
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.resource_monitor_plot
│ │ │ +Vbin/libtbx.add_docstrings_with_ai
│ │ │  p1019
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1020
│ │ │  Rp1021
│ │ │  (dp1022
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/resource_monitor_plot.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/add_docstrings_with_ai.py
│ │ │  p1023
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1024
│ │ │  Rp1025
│ │ │  (dp1026
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.remove_unused_imports
│ │ │ +Vbin/libtbx.reindent
│ │ │  p1027
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1028
│ │ │  Rp1029
│ │ │  (dp1030
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/remove_unused_imports.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/reindent.py
│ │ │  p1031
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1032
│ │ │  Rp1033
│ │ │  (dp1034
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.remove_tree
│ │ │ +Vbin/libtbx.any2unix
│ │ │  p1035
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1036
│ │ │  Rp1037
│ │ │  (dp1038
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/remove_tree.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/any2unix.py
│ │ │  p1039
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1040
│ │ │  Rp1041
│ │ │  (dp1042
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.remote_processing
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_date_and_time
│ │ │  p1043
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1044
│ │ │  Rp1045
│ │ │  (dp1046
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/remote_processing.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_date_and_time.py
│ │ │  p1047
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1048
│ │ │  Rp1049
│ │ │  (dp1050
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.reindent
│ │ │ +Vbin/libtbx.clear_paths
│ │ │  p1051
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1052
│ │ │  Rp1053
│ │ │  (dp1054
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/reindent.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/clear_paths.py
│ │ │  p1055
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1056
│ │ │  Rp1057
│ │ │  (dp1058
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.refresh
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_clutter
│ │ │  p1059
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1060
│ │ │  Rp1061
│ │ │  (dp1062
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/refresh.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_clutter.py
│ │ │  p1063
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1064
│ │ │  Rp1065
│ │ │  (dp1066
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.raise_exception_for_testing
│ │ │ +Vbin/libtbx.bibtex
│ │ │  p1067
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1068
│ │ │  Rp1069
│ │ │  (dp1070
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/raise_exception_for_testing.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bibtex.sh
│ │ │  p1071
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1072
│ │ │  Rp1073
│ │ │  (dp1074
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.py_compile_all
│ │ │ +Vbin/libtbx.bundle_as_exe
│ │ │  p1075
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1076
│ │ │  Rp1077
│ │ │  (dp1078
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/py_compile_all.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bundle_as_exe.py
│ │ │  p1079
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1080
│ │ │  Rp1081
│ │ │  (dp1082
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.printenv
│ │ │ +Vbin/libtbx.assert_not_show_diff
│ │ │  p1083
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1084
│ │ │  Rp1085
│ │ │  (dp1086
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/printenv.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_not_show_diff.py
│ │ │  p1087
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1088
│ │ │  Rp1089
│ │ │  (dp1090
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.prime_factors_of
│ │ │ +Vbin/libtbx.start_binary_bundle
│ │ │  p1091
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1092
│ │ │  Rp1093
│ │ │  (dp1094
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/prime_factors_of.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/start_binary_bundle.py
│ │ │  p1095
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1096
│ │ │  Rp1097
│ │ │  (dp1098
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.phil
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_under_build
│ │ │  p1099
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1100
│ │ │  Rp1101
│ │ │  (dp1102
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/phil.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_under_build.py
│ │ │  p1103
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1104
│ │ │  Rp1105
│ │ │  (dp1106
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.pdflatex
│ │ │ +Vbin/libtbx.start_process
│ │ │  p1107
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1108
│ │ │  Rp1109
│ │ │  (dp1110
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/pdflatex.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/start_process.py
│ │ │  p1111
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1112
│ │ │  Rp1113
│ │ │  (dp1114
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.path_utility
│ │ │ +Vbin/libtbx.create_mac_app
│ │ │  p1115
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1116
│ │ │  Rp1117
│ │ │  (dp1118
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/path_utility.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_mac_app.py
│ │ │  p1119
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1120
│ │ │  Rp1121
│ │ │  (dp1122
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.parallel_simple
│ │ │ +Vbin/libtbx.import_all_python
│ │ │  p1123
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1124
│ │ │  Rp1125
│ │ │  (dp1126
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/parallel_simple.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/import_all_python.py
│ │ │  p1127
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1128
│ │ │  Rp1129
│ │ │  (dp1130
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.nequal
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_number_of_processors
│ │ │  p1131
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1132
│ │ │  Rp1133
│ │ │  (dp1134
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/nequal.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_number_of_processors.py
│ │ │  p1135
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1136
│ │ │  Rp1137
│ │ │  (dp1138
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.make_sphinx_html
│ │ │ +Vbin/libtbx.pdflatex
│ │ │  p1139
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1140
│ │ │  Rp1141
│ │ │  (dp1142
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/make_sphinx_html.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/pdflatex.sh
│ │ │  p1143
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1144
│ │ │  Rp1145
│ │ │  (dp1146
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.make_dist
│ │ │ +Vbin/libtbx.remote_processing
│ │ │  p1147
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1148
│ │ │  Rp1149
│ │ │  (dp1150
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/make_dist.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/remote_processing.py
│ │ │  p1151
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1152
│ │ │  Rp1153
│ │ │  (dp1154
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.list_source_files_sorted_by_size
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_repository_paths
│ │ │  p1155
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1156
│ │ │  Rp1157
│ │ │  (dp1158
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/list_source_files_sorted_by_size.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_repository_paths.py
│ │ │  p1159
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1160
│ │ │  Rp1161
│ │ │  (dp1162
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.list_modules
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_numeric_version
│ │ │  p1163
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1164
│ │ │  Rp1165
│ │ │  (dp1166
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/list_modules.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_numeric_version.py
│ │ │  p1167
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1168
│ │ │  Rp1169
│ │ │  (dp1170
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.list_files
│ │ │ +Vbin/libtbx.help
│ │ │  p1171
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1172
│ │ │  Rp1173
│ │ │  (dp1174
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/list_files.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/help.py
│ │ │  p1175
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1176
│ │ │  Rp1177
│ │ │  (dp1178
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.line_count
│ │ │ +Vbin/libtbx.csh
│ │ │  p1179
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1180
│ │ │  Rp1181
│ │ │  (dp1182
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/line_count.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/csh.sh
│ │ │  p1183
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1184
│ │ │  Rp1185
│ │ │  (dp1186
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.latex
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_include_paths
│ │ │  p1187
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1188
│ │ │  Rp1189
│ │ │  (dp1190
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/latex.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_include_paths.py
│ │ │  p1191
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1192
│ │ │  Rp1193
│ │ │  (dp1194
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.install_conda
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_build_path
│ │ │  p1195
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1196
│ │ │  Rp1197
│ │ │  (dp1198
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/install_conda.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_build_path.py
│ │ │  p1199
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1200
│ │ │  Rp1201
│ │ │  (dp1202
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.install
│ │ │ +Vbin/libtbx.parallel_simple
│ │ │  p1203
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1204
│ │ │  Rp1205
│ │ │  (dp1206
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/install.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/parallel_simple.py
│ │ │  p1207
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1208
│ │ │  Rp1209
│ │ │  (dp1210
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.import_all_python
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_unused_imports
│ │ │  p1211
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1212
│ │ │  Rp1213
│ │ │  (dp1214
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/import_all_python.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_unused_imports.py
│ │ │  p1215
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1216
│ │ │  Rp1217
│ │ │  (dp1218
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.import_all_ext
│ │ │ +Vbin/libtbx.create_windows_exe
│ │ │  p1219
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1220
│ │ │  Rp1221
│ │ │  (dp1222
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/import_all_ext.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_windows_exe.py
│ │ │  p1223
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1224
│ │ │  Rp1225
│ │ │  (dp1226
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.help
│ │ │ +Vbin/libtbx.env_run
│ │ │  p1227
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1228
│ │ │  Rp1229
│ │ │  (dp1230
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/help.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/env_run.py
│ │ │  p1231
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1232
│ │ │  Rp1233
│ │ │  (dp1234
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.git_avoid_merges
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_python_dependencies
│ │ │  p1235
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1236
│ │ │  Rp1237
│ │ │  (dp1238
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/git_avoid_merges.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_python_dependencies.py
│ │ │  p1239
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1240
│ │ │  Rp1241
│ │ │  (dp1242
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.gdb
│ │ │ +Vbin/libtbx.nequal
│ │ │  p1243
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1244
│ │ │  Rp1245
│ │ │  (dp1246
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/gdb.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/nequal.py
│ │ │  p1247
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1248
│ │ │  Rp1249
│ │ │  (dp1250
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_unused_imports_crude
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_commands
│ │ │  p1251
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1252
│ │ │  Rp1253
│ │ │  (dp1254
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_unused_imports_crude.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_commands.py
│ │ │  p1255
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1256
│ │ │  Rp1257
│ │ │  (dp1258
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_unused_imports
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_build_options
│ │ │  p1259
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1260
│ │ │  Rp1261
│ │ │  (dp1262
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_unused_imports.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_build_options.py
│ │ │  p1263
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1264
│ │ │  Rp1265
│ │ │  (dp1266
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_untested
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_all_on_path
│ │ │  p1267
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1268
│ │ │  Rp1269
│ │ │  (dp1270
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_untested.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_all_on_path.py
│ │ │  p1271
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1272
│ │ │  Rp1273
│ │ │  (dp1274
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_under_build
│ │ │ +Vbin/libtbx.analyse_code_comments
│ │ │  p1275
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1276
│ │ │  Rp1277
│ │ │  (dp1278
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_under_build.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/analyse_code_comments.py
│ │ │  p1279
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1280
│ │ │  Rp1281
│ │ │  (dp1282
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_reserved_names
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_pdb_mmcif_problems
│ │ │  p1283
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1284
│ │ │  Rp1285
│ │ │  (dp1286
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_reserved_names.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_pdb_mmcif_problems.py
│ │ │  p1287
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1288
│ │ │  Rp1289
│ │ │  (dp1290
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_pdb_mmcif_problems
│ │ │ +Vbin/libtbx.install
│ │ │  p1291
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1292
│ │ │  Rp1293
│ │ │  (dp1294
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_pdb_mmcif_problems.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/install.py
│ │ │  p1295
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1296
│ │ │  Rp1297
│ │ │  (dp1298
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_old_style_classes
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_pythonpath
│ │ │  p1299
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1300
│ │ │  Rp1301
│ │ │  (dp1302
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_old_style_classes.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_pythonpath.py
│ │ │  p1303
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1304
│ │ │  Rp1305
│ │ │  (dp1306
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_in_repositories
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_old_style_classes
│ │ │  p1307
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1308
│ │ │  Rp1309
│ │ │  (dp1310
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_in_repositories.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_old_style_classes.py
│ │ │  p1311
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1312
│ │ │  Rp1313
│ │ │  (dp1314
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_files
│ │ │ +Vbin/sphinx.build
│ │ │  p1315
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1316
│ │ │  Rp1317
│ │ │  (dp1318
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_files.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/sphinx_build.py
│ │ │  p1319
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1320
│ │ │  Rp1321
│ │ │  (dp1322
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.find_clutter
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_python_sys_executable
│ │ │  p1323
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1324
│ │ │  Rp1325
│ │ │  (dp1326
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_clutter.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_python_sys_executable.py
│ │ │  p1327
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1328
│ │ │  Rp1329
│ │ │  (dp1330
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.extract_code_from_txt
│ │ │ +Vbin/libtbx.epydoc_run
│ │ │  p1331
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1332
│ │ │  Rp1333
│ │ │  (dp1334
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/extract_code_from_txt.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/epydoc_run.py
│ │ │  p1335
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1336
│ │ │  Rp1337
│ │ │  (dp1338
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.exec
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_numpy_version
│ │ │  p1339
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1340
│ │ │  Rp1341
│ │ │  (dp1342
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/exec.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_numpy_version.py
│ │ │  p1343
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1344
│ │ │  Rp1345
│ │ │  (dp1346
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.epydoc_run
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_unused_imports_crude
│ │ │  p1347
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1348
│ │ │  Rp1349
│ │ │  (dp1350
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/epydoc_run.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_unused_imports_crude.py
│ │ │  p1351
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1352
│ │ │  Rp1353
│ │ │  (dp1354
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.env_run
│ │ │ +Vbin/libtbx.run_pickled_function
│ │ │  p1355
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1356
│ │ │  Rp1357
│ │ │  (dp1358
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/env_run.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/run_pickled_function.py
│ │ │  p1359
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1360
│ │ │  Rp1361
│ │ │  (dp1362
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.easy_qsub
│ │ │ +Vbin/libtbx.scons
│ │ │  p1363
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1364
│ │ │  Rp1365
│ │ │  (dp1366
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/easy_qsub.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/scons.py
│ │ │  p1367
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1368
│ │ │  Rp1369
│ │ │  (dp1370
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.dtrace
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_tests
│ │ │  p1371
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1372
│ │ │  Rp1373
│ │ │  (dp1374
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/dtrace.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_tests.py
│ │ │  p1375
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1376
│ │ │  Rp1377
│ │ │  (dp1378
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.csh
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_bin_path
│ │ │  p1379
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1380
│ │ │  Rp1381
│ │ │  (dp1382
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/csh.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_bin_path.py
│ │ │  p1383
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1384
│ │ │  Rp1385
│ │ │  (dp1386
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.create_windows_exe
│ │ │ +Vbin/libtbx.raise_exception_for_testing
│ │ │  p1387
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1388
│ │ │  Rp1389
│ │ │  (dp1390
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_windows_exe.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/raise_exception_for_testing.py
│ │ │  p1391
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1392
│ │ │  Rp1393
│ │ │  (dp1394
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.create_unzipsfx
│ │ │ +Vbin/libtbx.unpack_in_sources
│ │ │  p1395
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1396
│ │ │  Rp1397
│ │ │  (dp1398
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_unzipsfx.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/unpack_in_sources.csh
│ │ │  p1399
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1400
│ │ │  Rp1401
│ │ │  (dp1402
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.create_selfx
│ │ │ +Vbin/libtbx.remove_tree
│ │ │  p1403
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1404
│ │ │  Rp1405
│ │ │  (dp1406
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_selfx.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/remove_tree.py
│ │ │  p1407
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1408
│ │ │  Rp1409
│ │ │  (dp1410
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.create_mac_app
│ │ │ +Vbin/libtbx.py_compile_all
│ │ │  p1411
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1412
│ │ │  Rp1413
│ │ │  (dp1414
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_mac_app.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/py_compile_all.py
│ │ │  p1415
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1416
│ │ │  Rp1417
│ │ │  (dp1418
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.create_installer
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_variable_names
│ │ │  p1419
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1420
│ │ │  Rp1421
│ │ │  (dp1422
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_installer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_variable_names.py
│ │ │  p1423
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1424
│ │ │  Rp1425
│ │ │  (dp1426
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.create_install_script_bat
│ │ │ +Vbin/libtbx.find_files
│ │ │  p1427
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1428
│ │ │  Rp1429
│ │ │  (dp1430
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_install_script_bat.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/find_files.py
│ │ │  p1431
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1432
│ │ │  Rp1433
│ │ │  (dp1434
│ │ │ @@ -3883,92 +3883,92 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1440
│ │ │  Rp1441
│ │ │  (dp1442
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.configure
│ │ │ +Vbin/libtbx.show_environ_usage
│ │ │  p1443
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1444
│ │ │  Rp1445
│ │ │  (dp1446
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/configure.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/show_environ_usage.py
│ │ │  p1447
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1448
│ │ │  Rp1449
│ │ │  (dp1450
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.clear_paths
│ │ │ +Vbin/libtbx.create_unzipsfx
│ │ │  p1451
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1452
│ │ │  Rp1453
│ │ │  (dp1454
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/clear_paths.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_unzipsfx.py
│ │ │  p1455
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1456
│ │ │  Rp1457
│ │ │  (dp1458
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.clean_clutter
│ │ │ +Vbin/libtbx.make_sphinx_html
│ │ │  p1459
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1460
│ │ │  Rp1461
│ │ │  (dp1462
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/clean_clutter.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/make_sphinx_html.py
│ │ │  p1463
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1464
│ │ │  Rp1465
│ │ │  (dp1466
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.check_libcpp
│ │ │ +Vbin/libtbx.git_avoid_merges
│ │ │  p1467
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1468
│ │ │  Rp1469
│ │ │  (dp1470
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/check_libcpp.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/git_avoid_merges.py
│ │ │  p1471
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1472
│ │ │  Rp1473
│ │ │  (dp1474
│ │ │ @@ -3993,312 +3993,312 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1480
│ │ │  Rp1481
│ │ │  (dp1482
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.bundle_as_selfx
│ │ │ +Vbin/libtbx.create_selfx
│ │ │  p1483
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1484
│ │ │  Rp1485
│ │ │  (dp1486
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bundle_as_selfx.csh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/create_selfx.py
│ │ │  p1487
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1488
│ │ │  Rp1489
│ │ │  (dp1490
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.bundle_as_exe
│ │ │ +Vbin/libtbx.valgrind
│ │ │  p1491
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1492
│ │ │  Rp1493
│ │ │  (dp1494
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bundle_as_exe.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/valgrind.sh
│ │ │  p1495
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1496
│ │ │  Rp1497
│ │ │  (dp1498
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.bootstrap
│ │ │ +Vbin/libtbx.latex
│ │ │  p1499
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1500
│ │ │  Rp1501
│ │ │  (dp1502
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bootstrap.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/latex.sh
│ │ │  p1503
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1504
│ │ │  Rp1505
│ │ │  (dp1506
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.bibtex
│ │ │ +Vbin/libtbx.make_dist
│ │ │  p1507
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1508
│ │ │  Rp1509
│ │ │  (dp1510
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bibtex.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/make_dist.py
│ │ │  p1511
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1512
│ │ │  Rp1513
│ │ │  (dp1514
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.bash
│ │ │ +Vbin/libtbx.extract_code_from_txt
│ │ │  p1515
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1516
│ │ │  Rp1517
│ │ │  (dp1518
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bash.sh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/extract_code_from_txt.py
│ │ │  p1519
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1520
│ │ │  Rp1521
│ │ │  (dp1522
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.assert_stdin_ends_with
│ │ │ +Vbin/libtbx.bundle_as_selfx
│ │ │  p1523
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1524
│ │ │  Rp1525
│ │ │  (dp1526
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_stdin_ends_with.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bundle_as_selfx.csh
│ │ │  p1527
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1528
│ │ │  Rp1529
│ │ │  (dp1530
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.assert_stdin_contains_strings
│ │ │ +Vbin/libtbx.install_conda
│ │ │  p1531
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1532
│ │ │  Rp1533
│ │ │  (dp1534
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_stdin_contains_strings.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/install_conda.py
│ │ │  p1535
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1536
│ │ │  Rp1537
│ │ │  (dp1538
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.assert_stdin_does_not_contain_strings
│ │ │ +Vbin/libtbx.prime_factors_of
│ │ │  p1539
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1540
│ │ │  Rp1541
│ │ │  (dp1542
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_stdin_contains_strings.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/prime_factors_of.py
│ │ │  p1543
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1544
│ │ │  Rp1545
│ │ │  (dp1546
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.assert_stdin
│ │ │ +Vbin/libtbx.list_files
│ │ │  p1547
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1548
│ │ │  Rp1549
│ │ │  (dp1550
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_stdin.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/list_files.py
│ │ │  p1551
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1552
│ │ │  Rp1553
│ │ │  (dp1554
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.assert_not_show_diff
│ │ │ +Vbin/libtbx.sh
│ │ │  p1555
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1556
│ │ │  Rp1557
│ │ │  (dp1558
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_not_show_diff.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/sh.sh
│ │ │  p1559
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1560
│ │ │  Rp1561
│ │ │  (dp1562
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.assert_line_count
│ │ │ +Vbin/libtbx.path_utility
│ │ │  p1563
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1564
│ │ │  Rp1565
│ │ │  (dp1566
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/assert_line_count.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/path_utility.py
│ │ │  p1567
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1568
│ │ │  Rp1569
│ │ │  (dp1570
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.any2unix
│ │ │ +Vbin/libtbx.import_all_ext
│ │ │  p1571
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1572
│ │ │  Rp1573
│ │ │  (dp1574
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/any2unix.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/import_all_ext.py
│ │ │  p1575
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1576
│ │ │  Rp1577
│ │ │  (dp1578
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.analyse_code_comments
│ │ │ +Vbin/libtbx.bash
│ │ │  p1579
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1580
│ │ │  Rp1581
│ │ │  (dp1582
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/analyse_code_comments.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/bash.sh
│ │ │  p1583
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1584
│ │ │  Rp1585
│ │ │  (dp1586
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/libtbx.add_docstrings_with_ai
│ │ │ +Vbin/libtbx.sge_qstat_counts
│ │ │  p1587
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1588
│ │ │  Rp1589
│ │ │  (dp1590
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/add_docstrings_with_ai.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/libtbx/command_line/sge_qstat_counts.py
│ │ │  p1591
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1592
│ │ │  Rp1593
│ │ │  (dp1594
│ │ │ @@ -4323,466 +4323,466 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1600
│ │ │  Rp1601
│ │ │  (dp1602
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost_adaptbx.show_environ_usage
│ │ │ +Vbin/boost_adaptbx.double_overflow
│ │ │  p1603
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1604
│ │ │  Rp1605
│ │ │  (dp1606
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/show_environ_usage.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/double_overflow.py
│ │ │  p1607
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1608
│ │ │  Rp1609
│ │ │  (dp1610
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost_adaptbx.segmentation_fault
│ │ │ +Vbin/boost.gcd
│ │ │  p1611
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1612
│ │ │  Rp1613
│ │ │  (dp1614
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/segmentation_fault.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/gcd.py
│ │ │  p1615
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1616
│ │ │  Rp1617
│ │ │  (dp1618
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost_adaptbx.nested_cpp_loops_with_check_signals
│ │ │ +Vbin/boost.lcm
│ │ │  p1619
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1620
│ │ │  Rp1621
│ │ │  (dp1622
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/nested_cpp_loops_with_check_signals.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/lcm.py
│ │ │  p1623
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1624
│ │ │  Rp1625
│ │ │  (dp1626
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost.lcm
│ │ │ +Vbin/boost_adaptbx.nested_cpp_loops_with_check_signals
│ │ │  p1627
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1628
│ │ │  Rp1629
│ │ │  (dp1630
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/lcm.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/nested_cpp_loops_with_check_signals.py
│ │ │  p1631
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1632
│ │ │  Rp1633
│ │ │  (dp1634
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost_adaptbx.int_overflow
│ │ │ +Vbin/boost_adaptbx.divide_by_zero
│ │ │  p1635
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1636
│ │ │  Rp1637
│ │ │  (dp1638
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/int_overflow.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/divide_by_zero.py
│ │ │  p1639
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1640
│ │ │  Rp1641
│ │ │  (dp1642
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost_adaptbx.inexact
│ │ │ +Vbin/boost_adaptbx.int_overflow
│ │ │  p1643
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1644
│ │ │  Rp1645
│ │ │  (dp1646
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/inexact.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/int_overflow.py
│ │ │  p1647
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1648
│ │ │  Rp1649
│ │ │  (dp1650
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost.gcd
│ │ │ +Vbin/boost_adaptbx.inexact
│ │ │  p1651
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1652
│ │ │  Rp1653
│ │ │  (dp1654
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/gcd.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/inexact.py
│ │ │  p1655
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1656
│ │ │  Rp1657
│ │ │  (dp1658
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost_adaptbx.double_overflow
│ │ │ +Vbin/boost_adaptbx.segmentation_fault
│ │ │  p1659
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1660
│ │ │  Rp1661
│ │ │  (dp1662
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/double_overflow.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/segmentation_fault.py
│ │ │  p1663
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1664
│ │ │  Rp1665
│ │ │  (dp1666
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/boost_adaptbx.divide_by_zero
│ │ │ +Vbin/boost_adaptbx.show_environ_usage
│ │ │  p1667
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1668
│ │ │  Rp1669
│ │ │  (dp1670
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/divide_by_zero.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/boost_adaptbx/command_line/show_environ_usage.py
│ │ │  p1671
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1672
│ │ │  Rp1673
│ │ │  (dp1674
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/fable.split
│ │ │ +Vbin/fable.show_calls
│ │ │  p1675
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1676
│ │ │  Rp1677
│ │ │  (dp1678
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/split.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/show_calls.py
│ │ │  p1679
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1680
│ │ │  Rp1681
│ │ │  (dp1682
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/fable.show_calls
│ │ │ +Vbin/fable.split
│ │ │  p1683
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1684
│ │ │  Rp1685
│ │ │  (dp1686
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/show_calls.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/split.py
│ │ │  p1687
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1688
│ │ │  Rp1689
│ │ │  (dp1690
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/fable.read
│ │ │ +Vbin/fable.cout
│ │ │  p1691
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1692
│ │ │  Rp1693
│ │ │  (dp1694
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/read.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/cout.py
│ │ │  p1695
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1696
│ │ │  Rp1697
│ │ │  (dp1698
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/fable.insert_write_at_start_of_each_procedure
│ │ │ +Vbin/fable.read
│ │ │  p1699
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1700
│ │ │  Rp1701
│ │ │  (dp1702
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/insert_write_at_start_of_each_procedure.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/read.py
│ │ │  p1703
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1704
│ │ │  Rp1705
│ │ │  (dp1706
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/fable.fem_include_search_paths
│ │ │ +Vbin/fable.insert_write_at_start_of_each_procedure
│ │ │  p1707
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1708
│ │ │  Rp1709
│ │ │  (dp1710
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/fem_include_search_paths.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/insert_write_at_start_of_each_procedure.py
│ │ │  p1711
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1712
│ │ │  Rp1713
│ │ │  (dp1714
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/fable.cout
│ │ │ +Vbin/fable.fem_include_search_paths
│ │ │  p1715
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1716
│ │ │  Rp1717
│ │ │  (dp1718
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/cout.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/fable/command_line/fem_include_search_paths.py
│ │ │  p1719
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1720
│ │ │  Rp1721
│ │ │  (dp1722
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/scitbx.unicode_examples
│ │ │ +Vbin/scitbx.show_sizes
│ │ │  p1723
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1724
│ │ │  Rp1725
│ │ │  (dp1726
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/unicode_examples.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/show_sizes.py
│ │ │  p1727
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1728
│ │ │  Rp1729
│ │ │  (dp1730
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/scitbx.show_sizes
│ │ │ +Vbin/scitbx.histogram
│ │ │  p1731
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1732
│ │ │  Rp1733
│ │ │  (dp1734
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/show_sizes.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/histogram.py
│ │ │  p1735
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1736
│ │ │  Rp1737
│ │ │  (dp1738
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/scitbx.show_exp_times
│ │ │ +Vbin/scitbx.generate_error_h
│ │ │  p1739
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1740
│ │ │  Rp1741
│ │ │  (dp1742
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/show_exp_times.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/generate_error_h.py
│ │ │  p1743
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1744
│ │ │  Rp1745
│ │ │  (dp1746
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/scitbx.histogram
│ │ │ +Vbin/scitbx.show_exp_times
│ │ │  p1747
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1748
│ │ │  Rp1749
│ │ │  (dp1750
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/histogram.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/show_exp_times.py
│ │ │  p1751
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1752
│ │ │  Rp1753
│ │ │  (dp1754
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/scitbx.generate_error_h
│ │ │ +Vbin/scitbx.apply_tapenade_hints
│ │ │  p1755
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1756
│ │ │  Rp1757
│ │ │  (dp1758
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/generate_error_h.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/apply_tapenade_hints.py
│ │ │  p1759
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1760
│ │ │  Rp1761
│ │ │  (dp1762
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/scitbx.apply_tapenade_hints
│ │ │ +Vbin/scitbx.unicode_examples
│ │ │  p1763
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1764
│ │ │  Rp1765
│ │ │  (dp1766
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/apply_tapenade_hints.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/scitbx/command_line/unicode_examples.py
│ │ │  p1767
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1768
│ │ │  Rp1769
│ │ │  (dp1770
│ │ │ @@ -4807,928 +4807,928 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1776
│ │ │  Rp1777
│ │ │  (dp1778
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.web.install
│ │ │ +Vbin/phenix.form_factor_query
│ │ │  p1779
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1780
│ │ │  Rp1781
│ │ │  (dp1782
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/web.install.csh
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/form_factor_query.py
│ │ │  p1783
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1784
│ │ │  Rp1785
│ │ │  (dp1786
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.wavelength_units
│ │ │ +Vbin/cctbx_regression.test_nightly
│ │ │  p1787
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1788
│ │ │  Rp1789
│ │ │  (dp1790
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/wavelength_units.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/cctbx_test_nightly.py
│ │ │  p1791
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1792
│ │ │  Rp1793
│ │ │  (dp1794
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.version
│ │ │ +Vbin/cctbx.cod_select_and_pickle
│ │ │  p1795
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1796
│ │ │  Rp1797
│ │ │  (dp1798
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/version.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/cod_select_and_pickle.py
│ │ │  p1799
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1800
│ │ │  Rp1801
│ │ │  (dp1802
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.subgroups
│ │ │ +Vbin/samosa.join
│ │ │  p1803
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1804
│ │ │  Rp1805
│ │ │  (dp1806
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/subgroups.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/samosa_join.py
│ │ │  p1807
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1808
│ │ │  Rp1809
│ │ │  (dp1810
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.structure_factor_timings
│ │ │ +Vbin/samosa.scale
│ │ │  p1811
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1812
│ │ │  Rp1813
│ │ │  (dp1814
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/structure_factor_timings.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/samosa_scale.py
│ │ │  p1815
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1816
│ │ │  Rp1817
│ │ │  (dp1818
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.space_group_info
│ │ │ +Vbin/cctbx.euclidean_model_matching
│ │ │  p1819
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1820
│ │ │  Rp1821
│ │ │  (dp1822
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/space_group_info.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/euclidean_model_matching.py
│ │ │  p1823
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1824
│ │ │  Rp1825
│ │ │  (dp1826
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.segment_and_split_map
│ │ │ +Vbin/cctbx.eltbx.show_fp_fdp
│ │ │  p1827
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1828
│ │ │  Rp1829
│ │ │  (dp1830
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/segment_and_split_map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/eltbx.show_fp_fdp.py
│ │ │  p1831
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1832
│ │ │  Rp1833
│ │ │  (dp1834
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/samosa.scale
│ │ │ +Vbin/phenix.diffuse
│ │ │  p1835
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1836
│ │ │  Rp1837
│ │ │  (dp1838
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/samosa_scale.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/diffuse.py
│ │ │  p1839
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1840
│ │ │  Rp1841
│ │ │  (dp1842
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/samosa.join
│ │ │ +Vbin/cctbx.brehm_diederichs
│ │ │  p1843
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1844
│ │ │  Rp1845
│ │ │  (dp1846
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/samosa_join.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/brehm_diederichs.py
│ │ │  p1847
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1848
│ │ │  Rp1849
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│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.development.qscore
│ │ │ +Vbin/cctbx.precession_view
│ │ │  p1851
│ │ │  sbg0
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│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1852
│ │ │  Rp1853
│ │ │  (dp1854
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/qscore.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/precession_view.py
│ │ │  p1855
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1856
│ │ │  Rp1857
│ │ │  (dp1858
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│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.precession_view
│ │ │ +Vbin/cctbx.space_group_info
│ │ │  p1859
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1860
│ │ │  Rp1861
│ │ │  (dp1862
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/precession_view.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/space_group_info.py
│ │ │  p1863
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1864
│ │ │  Rp1865
│ │ │  (dp1866
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.form_factor_query
│ │ │ +Vbin/mmtbx.development.qscore
│ │ │  p1867
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1868
│ │ │  Rp1869
│ │ │  (dp1870
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/form_factor_query.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/qscore.py
│ │ │  p1871
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1872
│ │ │  Rp1873
│ │ │  (dp1874
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│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.find_reticular_twin_laws
│ │ │ +Vbin/phenix.segment_and_split_map
│ │ │  p1875
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1876
│ │ │  Rp1877
│ │ │  (dp1878
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/find_reticular_twin_laws.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/segment_and_split_map.py
│ │ │  p1879
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1880
│ │ │  Rp1881
│ │ │  (dp1882
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.euclidean_model_matching
│ │ │ +Vbin/phenix.auto_sharpen
│ │ │  p1883
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1884
│ │ │  Rp1885
│ │ │  (dp1886
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/euclidean_model_matching.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/auto_sharpen.py
│ │ │  p1887
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1888
│ │ │  Rp1889
│ │ │  (dp1890
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.eltbx.show_fp_fdp
│ │ │ +Vbin/cctbx.subgroups
│ │ │  p1891
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1892
│ │ │  Rp1893
│ │ │  (dp1894
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/eltbx.show_fp_fdp.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/subgroups.py
│ │ │  p1895
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1896
│ │ │  Rp1897
│ │ │  (dp1898
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.diffuse
│ │ │ +Vbin/phenix.find_reticular_twin_laws
│ │ │  p1899
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1900
│ │ │  Rp1901
│ │ │  (dp1902
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/diffuse.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/find_reticular_twin_laws.py
│ │ │  p1903
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1904
│ │ │  Rp1905
│ │ │  (dp1906
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.cod_select_and_pickle
│ │ │ +Vbin/cctbx.structure_factor_timings
│ │ │  p1907
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1908
│ │ │  Rp1909
│ │ │  (dp1910
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/cod_select_and_pickle.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/structure_factor_timings.py
│ │ │  p1911
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1912
│ │ │  Rp1913
│ │ │  (dp1914
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx_regression.test_nightly
│ │ │ +Vbin/cctbx.wavelength_units
│ │ │  p1915
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1916
│ │ │  Rp1917
│ │ │  (dp1918
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/cctbx_test_nightly.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/wavelength_units.py
│ │ │  p1919
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1920
│ │ │  Rp1921
│ │ │  (dp1922
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.brehm_diederichs
│ │ │ +Vbin/cctbx.web.install
│ │ │  p1923
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1924
│ │ │  Rp1925
│ │ │  (dp1926
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/brehm_diederichs.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/web.install.csh
│ │ │  p1927
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1928
│ │ │  Rp1929
│ │ │  (dp1930
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.auto_sharpen
│ │ │ +Vbin/cctbx.version
│ │ │  p1931
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1932
│ │ │  Rp1933
│ │ │  (dp1934
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/auto_sharpen.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/cctbx/command_line/version.py
│ │ │  p1935
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1936
│ │ │  Rp1937
│ │ │  (dp1938
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.visualize_r_factors
│ │ │ +Vbin/cctbx.multiplicity_viewer
│ │ │  p1939
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1940
│ │ │  Rp1941
│ │ │  (dp1942
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/visualize_r_factors.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/multiplicity_viewer.py
│ │ │  p1943
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1944
│ │ │  Rp1945
│ │ │  (dp1946
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/crys3d.qttbx.view_structure
│ │ │ +Vbin/phenix.data_viewer
│ │ │  p1947
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1948
│ │ │  Rp1949
│ │ │  (dp1950
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/qttbx.view_structure.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/hklview.py
│ │ │  p1951
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1952
│ │ │  Rp1953
│ │ │  (dp1954
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.multiplicity_viewer
│ │ │ +Vbin/cctbx.data_viewer
│ │ │  p1955
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1956
│ │ │  Rp1957
│ │ │  (dp1958
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/multiplicity_viewer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/hklview.py
│ │ │  p1959
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1960
│ │ │  Rp1961
│ │ │  (dp1962
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/crys3d.model_viewer
│ │ │ +Vbin/cctbx.visualize_r_factors
│ │ │  p1963
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1964
│ │ │  Rp1965
│ │ │  (dp1966
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/model_viewer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/visualize_r_factors.py
│ │ │  p1967
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1968
│ │ │  Rp1969
│ │ │  (dp1970
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.make_install_HKLviewer_ChimeraX
│ │ │ +Vbin/phenix.HKLviewer
│ │ │  p1971
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1972
│ │ │  Rp1973
│ │ │  (dp1974
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/make_install_HKLviewer_ChimeraX.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLviewer.py
│ │ │  p1975
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1976
│ │ │  Rp1977
│ │ │  (dp1978
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.data_viewer
│ │ │ +Vbin/cctbx.HKLviewer
│ │ │  p1979
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1980
│ │ │  Rp1981
│ │ │  (dp1982
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/hklview.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLviewer.py
│ │ │  p1983
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1984
│ │ │  Rp1985
│ │ │  (dp1986
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.data_viewer
│ │ │ +Vbin/phasertng.HKLviewer
│ │ │  p1987
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1988
│ │ │  Rp1989
│ │ │  (dp1990
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/hklview.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLviewer.py
│ │ │  p1991
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1992
│ │ │  Rp1993
│ │ │  (dp1994
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.compare_datasets
│ │ │ +Vbin/crys3d.qttbx.view_structure
│ │ │  p1995
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp1996
│ │ │  Rp1997
│ │ │  (dp1998
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/compare_datasets.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/qttbx.view_structure.py
│ │ │  p1999
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2000
│ │ │  Rp2001
│ │ │  (dp2002
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.HKLviewer
│ │ │ +Vbin/phenix.HKLinfo
│ │ │  p2003
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2004
│ │ │  Rp2005
│ │ │  (dp2006
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLviewer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLinfo.py
│ │ │  p2007
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2008
│ │ │  Rp2009
│ │ │  (dp2010
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.HKLviewer
│ │ │ +Vbin/cctbx.HKLinfo
│ │ │  p2011
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2012
│ │ │  Rp2013
│ │ │  (dp2014
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLviewer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLinfo.py
│ │ │  p2015
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2016
│ │ │  Rp2017
│ │ │  (dp2018
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phasertng.HKLviewer
│ │ │ +Vbin/cctbx.make_install_HKLviewer_ChimeraX
│ │ │  p2019
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2020
│ │ │  Rp2021
│ │ │  (dp2022
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLviewer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/make_install_HKLviewer_ChimeraX.py
│ │ │  p2023
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2024
│ │ │  Rp2025
│ │ │  (dp2026
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.HKLinfo
│ │ │ +Vbin/phenix.compare_datasets
│ │ │  p2027
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2028
│ │ │  Rp2029
│ │ │  (dp2030
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLinfo.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/compare_datasets.py
│ │ │  p2031
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2032
│ │ │  Rp2033
│ │ │  (dp2034
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.HKLinfo
│ │ │ +Vbin/crys3d.model_viewer
│ │ │  p2035
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2036
│ │ │  Rp2037
│ │ │  (dp2038
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/HKLinfo.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/crys3d/command_line/model_viewer.py
│ │ │  p2039
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2040
│ │ │  Rp2041
│ │ │  (dp2042
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/smtbx.refine
│ │ │ +Vbin/smtbx.absolute_structure
│ │ │  p2043
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2044
│ │ │  Rp2045
│ │ │  (dp2046
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/refine.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/absolute_structure.py
│ │ │  p2047
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2048
│ │ │  Rp2049
│ │ │  (dp2050
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/smtbx.masks
│ │ │ +Vbin/smtbx.refine
│ │ │  p2051
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2052
│ │ │  Rp2053
│ │ │  (dp2054
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/masks.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/refine.py
│ │ │  p2055
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2056
│ │ │  Rp2057
│ │ │  (dp2058
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/smtbx.benchmark_refinement
│ │ │ +Vbin/smtbx.anom_refine
│ │ │  p2059
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2060
│ │ │  Rp2061
│ │ │  (dp2062
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/benchmark_refinement.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/anom_refine.py
│ │ │  p2063
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2064
│ │ │  Rp2065
│ │ │  (dp2066
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/smtbx.anom_refine
│ │ │ +Vbin/smtbx.masks
│ │ │  p2067
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2068
│ │ │  Rp2069
│ │ │  (dp2070
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/anom_refine.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/masks.py
│ │ │  p2071
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2072
│ │ │  Rp2073
│ │ │  (dp2074
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/smtbx.absolute_structure
│ │ │ +Vbin/smtbx.benchmark_refinement
│ │ │  p2075
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2076
│ │ │  Rp2077
│ │ │  (dp2078
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/absolute_structure.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/smtbx/command_line/benchmark_refinement.py
│ │ │  p2079
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2080
│ │ │  Rp2081
│ │ │  (dp2082
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.xplor.map.show_summary
│ │ │ +Vbin/iotbx.shelx.as_xray_structure
│ │ │  p2083
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2084
│ │ │  Rp2085
│ │ │  (dp2086
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/xplor.map.show_summary.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/shelx.as_xray_structure.py
│ │ │  p2087
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2088
│ │ │  Rp2089
│ │ │  (dp2090
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.unique_with_biomt
│ │ │ +Vbin/iotbx.cif.as_miller_arrays
│ │ │  p2091
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2092
│ │ │  Rp2093
│ │ │  (dp2094
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/unique_with_biomt.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif.as_miller_arrays.py
│ │ │  p2095
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2096
│ │ │  Rp2097
│ │ │  (dp2098
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.unique_with_biomt
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb_remediator
│ │ │  p2099
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2100
│ │ │  Rp2101
│ │ │  (dp2102
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/unique_with_biomt.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_remediator.py
│ │ │  p2103
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2104
│ │ │  Rp2105
│ │ │  (dp2106
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.symmetry_search
│ │ │ +Vbin/iotbx.simple_map_coefficients
│ │ │  p2107
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2108
│ │ │  Rp2109
│ │ │  (dp2110
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/symmetry_search.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/simple_map_coefficients.py
│ │ │  p2111
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2112
│ │ │  Rp2113
│ │ │  (dp2114
│ │ │ @@ -5775,268 +5775,268 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2128
│ │ │  Rp2129
│ │ │  (dp2130
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.simple_map_coefficients
│ │ │ +Vbin/phenix.french_wilson
│ │ │  p2131
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2132
│ │ │  Rp2133
│ │ │  (dp2134
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/simple_map_coefficients.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/french_wilson.py
│ │ │  p2135
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2136
│ │ │  Rp2137
│ │ │  (dp2138
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.show_systematic_absences
│ │ │ +Vbin/iotbx.french_wilson
│ │ │  p2139
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2140
│ │ │  Rp2141
│ │ │  (dp2142
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/show_systematic_absences.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/french_wilson.py
│ │ │  p2143
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2144
│ │ │  Rp2145
│ │ │  (dp2146
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.show_distances
│ │ │ +Vbin/iotbx.build_phil_cache
│ │ │  p2147
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2148
│ │ │  Rp2149
│ │ │  (dp2150
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/show_distances.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/build_phil_cache.py
│ │ │  p2151
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2152
│ │ │  Rp2153
│ │ │  (dp2154
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.shelx.dump_as_python
│ │ │ +Vbin/iotbx.phil
│ │ │  p2155
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2156
│ │ │  Rp2157
│ │ │  (dp2158
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/shelx.dump_as_python.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/phil.py
│ │ │  p2159
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2160
│ │ │  Rp2161
│ │ │  (dp2162
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.shelx.as_xray_structure
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb_as_cif
│ │ │  p2163
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2164
│ │ │  Rp2165
│ │ │  (dp2166
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/shelx.as_xray_structure.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_as_cif.py
│ │ │  p2167
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2168
│ │ │  Rp2169
│ │ │  (dp2170
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.shelx.as_cif
│ │ │ +Vbin/iotbx.show_distances
│ │ │  p2171
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2172
│ │ │  Rp2173
│ │ │  (dp2174
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/shelx.as_cif.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/show_distances.py
│ │ │  p2175
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2176
│ │ │  Rp2177
│ │ │  (dp2178
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.reindex
│ │ │ +Vbin/labelit.png
│ │ │  p2179
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2180
│ │ │  Rp2181
│ │ │  (dp2182
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reindex.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/detector_image_as_png.py
│ │ │  p2183
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2184
│ │ │  Rp2185
│ │ │  (dp2186
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.reflection_statistics
│ │ │ +Vbin/phenix.explore_metric_symmetry
│ │ │  p2187
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2188
│ │ │  Rp2189
│ │ │  (dp2190
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_statistics.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/explore_metric_symmetry.py
│ │ │  p2191
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2192
│ │ │  Rp2193
│ │ │  (dp2194
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.reflection_file_reader
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.superpose_centers_of_mass
│ │ │  p2195
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2196
│ │ │  Rp2197
│ │ │  (dp2198
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_file_reader.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.superpose_centers_of_mass.py
│ │ │  p2199
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2200
│ │ │  Rp2201
│ │ │  (dp2202
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.reflection_file_editor
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.flip_symmetric_amino_acids
│ │ │  p2203
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2204
│ │ │  Rp2205
│ │ │  (dp2206
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_file_editor.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/flip_symmetric_amino_acids.py
│ │ │  p2207
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2208
│ │ │  Rp2209
│ │ │  (dp2210
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.reflection_file_converter
│ │ │ +Vbin/iotbx.unique_with_biomt
│ │ │  p2211
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2212
│ │ │  Rp2213
│ │ │  (dp2214
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_file_converter.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/unique_with_biomt.py
│ │ │  p2215
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2216
│ │ │  Rp2217
│ │ │  (dp2218
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.reflection_file_converter
│ │ │ +Vbin/phenix.unique_with_biomt
│ │ │  p2219
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2220
│ │ │  Rp2221
│ │ │  (dp2222
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_file_converter.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/unique_with_biomt.py
│ │ │  p2223
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2224
│ │ │  Rp2225
│ │ │  (dp2226
│ │ │ @@ -6061,246 +6061,246 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2232
│ │ │  Rp2233
│ │ │  (dp2234
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.r_free_flags_as_cns
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb_cif_conversion
│ │ │  p2235
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2236
│ │ │  Rp2237
│ │ │  (dp2238
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/r_free_flags_as_cns.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_cif_conversion.py
│ │ │  p2239
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2240
│ │ │  Rp2241
│ │ │  (dp2242
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.r_free_flags_accumulation
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.link_as_geometry_restraints_edits
│ │ │  p2243
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2244
│ │ │  Rp2245
│ │ │  (dp2246
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/r_free_flags_accumulation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.link_as_geometry_restraints_edits.py
│ │ │  p2247
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2248
│ │ │  Rp2249
│ │ │  (dp2250
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.poscar_as_xray_structure
│ │ │ +Vbin/phenix.reflection_file_converter
│ │ │  p2251
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2252
│ │ │  Rp2253
│ │ │  (dp2254
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/poscar_as_xray_structure.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_file_converter.py
│ │ │  p2255
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2256
│ │ │  Rp2257
│ │ │  (dp2258
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.phil
│ │ │ +Vbin/iotbx.reflection_file_converter
│ │ │  p2259
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2260
│ │ │  Rp2261
│ │ │  (dp2262
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/phil.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_file_converter.py
│ │ │  p2263
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2264
│ │ │  Rp2265
│ │ │  (dp2266
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.split_models
│ │ │ +Vbin/iotbx.blast_pdb
│ │ │  p2267
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2268
│ │ │  Rp2269
│ │ │  (dp2270
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_split_models.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/blast_pdb.py
│ │ │  p2271
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2272
│ │ │  Rp2273
│ │ │  (dp2274
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.show_connectivity
│ │ │ +Vbin/iotbx.get_pubmed_citation
│ │ │  p2275
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2276
│ │ │  Rp2277
│ │ │  (dp2278
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_show_connectivity.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/get_pubmed_citation.py
│ │ │  p2279
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2280
│ │ │  Rp2281
│ │ │  (dp2282
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb_remediator
│ │ │ +Vbin/iotbx.lattice_symmetry
│ │ │  p2283
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2284
│ │ │  Rp2285
│ │ │  (dp2286
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_remediator.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/lattice_symmetry.py
│ │ │  p2287
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2288
│ │ │  Rp2289
│ │ │  (dp2290
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb_labels_diff
│ │ │ +Vbin/iotbx.cns.sdb_reader
│ │ │  p2291
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2292
│ │ │  Rp2293
│ │ │  (dp2294
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_labels_diff.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cns.sdb_reader.py
│ │ │  p2295
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2296
│ │ │  Rp2297
│ │ │  (dp2298
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb_labels_comparison
│ │ │ +Vbin/iotbx.cns.transfer_crystal_symmetry
│ │ │  p2299
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2300
│ │ │  Rp2301
│ │ │  (dp2302
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_labels_comparison.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cns.transfer_crystal_symmetry.py
│ │ │  p2303
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2304
│ │ │  Rp2305
│ │ │  (dp2306
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.get_citation
│ │ │ +Vbin/phenix.reflection_statistics
│ │ │  p2307
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2308
│ │ │  Rp2309
│ │ │  (dp2310
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_get_citation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_statistics.py
│ │ │  p2311
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2312
│ │ │  Rp2313
│ │ │  (dp2314
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb_cif_conversion
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb_labels_comparison
│ │ │  p2315
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2316
│ │ │  Rp2317
│ │ │  (dp2318
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_cif_conversion.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_labels_comparison.py
│ │ │  p2319
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2320
│ │ │  Rp2321
│ │ │  (dp2322
│ │ │ @@ -6325,1082 +6325,1082 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2328
│ │ │  Rp2329
│ │ │  (dp2330
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb_as_cif
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb_labels_diff
│ │ │  p2331
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2332
│ │ │  Rp2333
│ │ │  (dp2334
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_as_cif.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_labels_diff.py
│ │ │  p2335
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2336
│ │ │  Rp2337
│ │ │  (dp2338
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.add_conformations
│ │ │ +Vbin/iotbx.cif.as_xray_structure
│ │ │  p2339
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2340
│ │ │  Rp2341
│ │ │  (dp2342
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_add_conformations.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif.as_xray_structure.py
│ │ │  p2343
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2344
│ │ │  Rp2345
│ │ │  (dp2346
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.superpose_centers_of_mass
│ │ │ +Vbin/phenix.reindex
│ │ │  p2347
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2348
│ │ │  Rp2349
│ │ │  (dp2350
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.superpose_centers_of_mass.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reindex.py
│ │ │  p2351
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2352
│ │ │  Rp2353
│ │ │  (dp2354
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.superpose_atoms_by_name
│ │ │ +Vbin/cctbx.patterson_map
│ │ │  p2355
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2356
│ │ │  Rp2357
│ │ │  (dp2358
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.superpose_atoms_by_name.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/patterson_map.py
│ │ │  p2359
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2360
│ │ │  Rp2361
│ │ │  (dp2362
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.print_sequence
│ │ │ +Vbin/phenix.cif_as_pdb
│ │ │  p2363
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2364
│ │ │  Rp2365
│ │ │  (dp2366
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.print_sequence.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif_as_pdb.py
│ │ │  p2367
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2368
│ │ │  Rp2369
│ │ │  (dp2370
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.link_as_geometry_restraints_edits
│ │ │ +Vbin/iotbx.cif_as_pdb
│ │ │  p2371
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2372
│ │ │  Rp2373
│ │ │  (dp2374
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.link_as_geometry_restraints_edits.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif_as_pdb.py
│ │ │  p2375
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2376
│ │ │  Rp2377
│ │ │  (dp2378
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.join_fragment_files
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.get_citation
│ │ │  p2379
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2380
│ │ │  Rp2381
│ │ │  (dp2382
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.join_fragment_files.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_get_citation.py
│ │ │  p2383
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2384
│ │ │  Rp2385
│ │ │  (dp2386
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.insert_scale_records
│ │ │ +Vbin/iotbx.r_free_flags_accumulation
│ │ │  p2387
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2388
│ │ │  Rp2389
│ │ │  (dp2390
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.insert_scale_records.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/r_free_flags_accumulation.py
│ │ │  p2391
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2392
│ │ │  Rp2393
│ │ │  (dp2394
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb.hierarchy
│ │ │ +Vbin/iotbx.reflection_file_reader
│ │ │  p2395
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2396
│ │ │  Rp2397
│ │ │  (dp2398
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.hierarchy.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_file_reader.py
│ │ │  p2399
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2400
│ │ │  Rp2401
│ │ │  (dp2402
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.box_around_molecule
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.print_sequence
│ │ │  p2403
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2404
│ │ │  Rp2405
│ │ │  (dp2406
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.box_around_molecule.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.print_sequence.py
│ │ │  p2407
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2408
│ │ │  Rp2409
│ │ │  (dp2410
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb.b_factor_stats
│ │ │ +Vbin/iotbx.dano_as_amplitudes
│ │ │  p2411
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2412
│ │ │  Rp2413
│ │ │  (dp2414
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.b_factor_stats.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/dano_as_amplitudes.py
│ │ │  p2415
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2416
│ │ │  Rp2417
│ │ │  (dp2418
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.as_xray_structure
│ │ │ +Vbin/iotbx.poscar_as_xray_structure
│ │ │  p2419
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2420
│ │ │  Rp2421
│ │ │  (dp2422
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.as_xray_structure.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/poscar_as_xray_structure.py
│ │ │  p2423
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2424
│ │ │  Rp2425
│ │ │  (dp2426
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.patterson_map
│ │ │ +Vbin/phenix.cns_as_mtz
│ │ │  p2427
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2428
│ │ │  Rp2429
│ │ │  (dp2430
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/patterson_map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cns_as_mtz.py
│ │ │  p2431
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2432
│ │ │  Rp2433
│ │ │  (dp2434
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.mtz_as_cif
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.add_conformations
│ │ │  p2435
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2436
│ │ │  Rp2437
│ │ │  (dp2438
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/mtz_as_cif.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_add_conformations.py
│ │ │  p2439
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2440
│ │ │  Rp2441
│ │ │  (dp2442
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.mtz.dump
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.box_around_molecule
│ │ │  p2443
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2444
│ │ │  Rp2445
│ │ │  (dp2446
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/mtz.dump.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.box_around_molecule.py
│ │ │  p2447
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2448
│ │ │  Rp2449
│ │ │  (dp2450
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.mtz.dump
│ │ │ +Vbin/iotbx.dtrek.to_cns
│ │ │  p2451
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2452
│ │ │  Rp2453
│ │ │  (dp2454
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/mtz.dump.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/dtrek.to_cns.py
│ │ │  p2455
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2456
│ │ │  Rp2457
│ │ │  (dp2458
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb.mtrix_reconstruction
│ │ │ +Vbin/phenix.mtz_as_cif
│ │ │  p2459
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2460
│ │ │  Rp2461
│ │ │  (dp2462
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/mtrix_reconstruction.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/mtz_as_cif.py
│ │ │  p2463
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2464
│ │ │  Rp2465
│ │ │  (dp2466
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.merging_statistics
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.join_fragment_files
│ │ │  p2467
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2468
│ │ │  Rp2469
│ │ │  (dp2470
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/merging_statistics.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.join_fragment_files.py
│ │ │  p2471
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2472
│ │ │  Rp2473
│ │ │  (dp2474
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.merging_statistics
│ │ │ +Vbin/cctbx.show_systematic_absences
│ │ │  p2475
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2476
│ │ │  Rp2477
│ │ │  (dp2478
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/merging_statistics.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/show_systematic_absences.py
│ │ │  p2479
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2480
│ │ │  Rp2481
│ │ │  (dp2482
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.lattice_symmetry
│ │ │ +Vbin/phenix.mtz.dump
│ │ │  p2483
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2484
│ │ │  Rp2485
│ │ │  (dp2486
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/lattice_symmetry.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/mtz.dump.py
│ │ │  p2487
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2488
│ │ │  Rp2489
│ │ │  (dp2490
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.get_pubmed_citation
│ │ │ +Vbin/iotbx.mtz.dump
│ │ │  p2491
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2492
│ │ │  Rp2493
│ │ │  (dp2494
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/get_pubmed_citation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/mtz.dump.py
│ │ │  p2495
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2496
│ │ │  Rp2497
│ │ │  (dp2498
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.french_wilson
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.superpose_atoms_by_name
│ │ │  p2499
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2500
│ │ │  Rp2501
│ │ │  (dp2502
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/french_wilson.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.superpose_atoms_by_name.py
│ │ │  p2503
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2504
│ │ │  Rp2505
│ │ │  (dp2506
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.french_wilson
│ │ │ +Vbin/iotbx.r_free_flags_as_cns
│ │ │  p2507
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2508
│ │ │  Rp2509
│ │ │  (dp2510
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/french_wilson.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/r_free_flags_as_cns.py
│ │ │  p2511
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2512
│ │ │  Rp2513
│ │ │  (dp2514
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.pdb.flip_symmetric_amino_acids
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb.mtrix_reconstruction
│ │ │  p2515
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2516
│ │ │  Rp2517
│ │ │  (dp2518
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/flip_symmetric_amino_acids.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/mtrix_reconstruction.py
│ │ │  p2519
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2520
│ │ │  Rp2521
│ │ │  (dp2522
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.file_reader
│ │ │ +Vbin/phenix.resolution
│ │ │  p2523
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2524
│ │ │  Rp2525
│ │ │  (dp2526
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/file_reader.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/effective_resolution.py
│ │ │  p2527
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2528
│ │ │  Rp2529
│ │ │  (dp2530
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.export_scalepack_unmerged
│ │ │ +Vbin/iotbx.reflection_file_editor
│ │ │  p2531
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2532
│ │ │  Rp2533
│ │ │  (dp2534
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/export_scalepack_unmerged.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/reflection_file_editor.py
│ │ │  p2535
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2536
│ │ │  Rp2537
│ │ │  (dp2538
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.explore_metric_symmetry
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb.b_factor_stats
│ │ │  p2539
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2540
│ │ │  Rp2541
│ │ │  (dp2542
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/explore_metric_symmetry.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.b_factor_stats.py
│ │ │  p2543
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2544
│ │ │  Rp2545
│ │ │  (dp2546
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.emma
│ │ │ +Vbin/iotbx.cif.validate
│ │ │  p2547
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2548
│ │ │  Rp2549
│ │ │  (dp2550
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/emma.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif.validate.py
│ │ │  p2551
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2552
│ │ │  Rp2553
│ │ │  (dp2554
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.emma
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.as_xray_structure
│ │ │  p2555
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2556
│ │ │  Rp2557
│ │ │  (dp2558
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/emma.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.as_xray_structure.py
│ │ │  p2559
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2560
│ │ │  Rp2561
│ │ │  (dp2562
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.resolution
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb.biomt_reconstruction
│ │ │  p2563
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2564
│ │ │  Rp2565
│ │ │  (dp2566
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/effective_resolution.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/biomt_reconstruction.py
│ │ │  p2567
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2568
│ │ │  Rp2569
│ │ │  (dp2570
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.dtrek.to_cns
│ │ │ +Vbin/iotbx.cns.reflection_reader
│ │ │  p2571
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2572
│ │ │  Rp2573
│ │ │  (dp2574
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/dtrek.to_cns.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cns.reflection_reader.py
│ │ │  p2575
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2576
│ │ │  Rp2577
│ │ │  (dp2578
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.distance_least_squares
│ │ │ +Vbin/iotbx.cbf_read
│ │ │  p2579
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2580
│ │ │  Rp2581
│ │ │  (dp2582
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/distance_least_squares.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cbf_read.py
│ │ │  p2583
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2584
│ │ │  Rp2585
│ │ │  (dp2586
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/labelit.png
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.insert_scale_records
│ │ │  p2587
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2588
│ │ │  Rp2589
│ │ │  (dp2590
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/detector_image_as_png.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.insert_scale_records.py
│ │ │  p2591
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2592
│ │ │  Rp2593
│ │ │  (dp2594
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.dano_as_amplitudes
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.show_connectivity
│ │ │  p2595
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2596
│ │ │  Rp2597
│ │ │  (dp2598
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/dano_as_amplitudes.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_show_connectivity.py
│ │ │  p2599
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2600
│ │ │  Rp2601
│ │ │  (dp2602
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.csv_as_mtz
│ │ │ +Vbin/iotbx.shelx.dump_as_python
│ │ │  p2603
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2604
│ │ │  Rp2605
│ │ │  (dp2606
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/csv_as_mtz.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/shelx.dump_as_python.py
│ │ │  p2607
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2608
│ │ │  Rp2609
│ │ │  (dp2610
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.crystal_symmetry_from_any
│ │ │ +Vbin/phenix.emma
│ │ │  p2611
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2612
│ │ │  Rp2613
│ │ │  (dp2614
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/crystal_symmetry_from_any.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/emma.py
│ │ │  p2615
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2616
│ │ │  Rp2617
│ │ │  (dp2618
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.cns_as_mtz
│ │ │ +Vbin/iotbx.emma
│ │ │  p2619
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2620
│ │ │  Rp2621
│ │ │  (dp2622
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cns_as_mtz.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/emma.py
│ │ │  p2623
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2624
│ │ │  Rp2625
│ │ │  (dp2626
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cns.transfer_crystal_symmetry
│ │ │ +Vbin/iotbx.pdb.split_models
│ │ │  p2627
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2628
│ │ │  Rp2629
│ │ │  (dp2630
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cns.transfer_crystal_symmetry.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb_split_models.py
│ │ │  p2631
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2632
│ │ │  Rp2633
│ │ │  (dp2634
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cns.sdb_reader
│ │ │ +Vbin/iotbx.file_reader
│ │ │  p2635
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2636
│ │ │  Rp2637
│ │ │  (dp2638
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cns.sdb_reader.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/file_reader.py
│ │ │  p2639
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2640
│ │ │  Rp2641
│ │ │  (dp2642
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cns.reflection_reader
│ │ │ +Vbin/phenix.merging_statistics
│ │ │  p2643
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2644
│ │ │  Rp2645
│ │ │  (dp2646
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cns.reflection_reader.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/merging_statistics.py
│ │ │  p2647
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2648
│ │ │  Rp2649
│ │ │  (dp2650
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.cif_as_pdb
│ │ │ +Vbin/iotbx.merging_statistics
│ │ │  p2651
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2652
│ │ │  Rp2653
│ │ │  (dp2654
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif_as_pdb.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/merging_statistics.py
│ │ │  p2655
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2656
│ │ │  Rp2657
│ │ │  (dp2658
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cif_as_pdb
│ │ │ +Vbin/iotbx.export_scalepack_unmerged
│ │ │  p2659
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2660
│ │ │  Rp2661
│ │ │  (dp2662
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif_as_pdb.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/export_scalepack_unmerged.py
│ │ │  p2663
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2664
│ │ │  Rp2665
│ │ │  (dp2666
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cif.validate
│ │ │ +Vbin/phenix.csv_as_mtz
│ │ │  p2667
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2668
│ │ │  Rp2669
│ │ │  (dp2670
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif.validate.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/csv_as_mtz.py
│ │ │  p2671
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2672
│ │ │  Rp2673
│ │ │  (dp2674
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cif.as_xray_structure
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb.hierarchy
│ │ │  p2675
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2676
│ │ │  Rp2677
│ │ │  (dp2678
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif.as_xray_structure.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/pdb.hierarchy.py
│ │ │  p2679
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2680
│ │ │  Rp2681
│ │ │  (dp2682
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cif.as_miller_arrays
│ │ │ +Vbin/iotbx.crystal_symmetry_from_any
│ │ │  p2683
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2684
│ │ │  Rp2685
│ │ │  (dp2686
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cif.as_miller_arrays.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/crystal_symmetry_from_any.py
│ │ │  p2687
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2688
│ │ │  Rp2689
│ │ │  (dp2690
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cbf_read
│ │ │ +Vbin/iotbx.xplor.map.show_summary
│ │ │  p2691
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2692
│ │ │  Rp2693
│ │ │  (dp2694
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/cbf_read.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/xplor.map.show_summary.py
│ │ │  p2695
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2696
│ │ │  Rp2697
│ │ │  (dp2698
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.build_phil_cache
│ │ │ +Vbin/iotbx.shelx.as_cif
│ │ │  p2699
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2700
│ │ │  Rp2701
│ │ │  (dp2702
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/build_phil_cache.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/shelx.as_cif.py
│ │ │  p2703
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2704
│ │ │  Rp2705
│ │ │  (dp2706
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.blast_pdb
│ │ │ +Vbin/iotbx.distance_least_squares
│ │ │  p2707
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2708
│ │ │  Rp2709
│ │ │  (dp2710
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/blast_pdb.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/distance_least_squares.py
│ │ │  p2711
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2712
│ │ │  Rp2713
│ │ │  (dp2714
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb.biomt_reconstruction
│ │ │ +Vbin/iotbx.symmetry_search
│ │ │  p2715
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2716
│ │ │  Rp2717
│ │ │  (dp2718
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/biomt_reconstruction.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/iotbx/command_line/symmetry_search.py
│ │ │  p2719
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2720
│ │ │  Rp2721
│ │ │  (dp2722
│ │ │ @@ -7425,2732 +7425,2732 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2728
│ │ │  Rp2729
│ │ │  (dp2730
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.xtriage
│ │ │ +Vbin/phenix.rna_validate_bonds
│ │ │  p2731
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2732
│ │ │  Rp2733
│ │ │  (dp2734
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/xtriage.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_bonds.py
│ │ │  p2735
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2736
│ │ │  Rp2737
│ │ │  (dp2738
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.xtriage
│ │ │ +Vbin/molprobity.rna_validate_bonds
│ │ │  p2739
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2740
│ │ │  Rp2741
│ │ │  (dp2742
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/xtriage.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_bonds.py
│ │ │  p2743
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2744
│ │ │  Rp2745
│ │ │  (dp2746
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.development.xtrapol8
│ │ │ +Vbin/phenix.model_vs_map
│ │ │  p2747
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2748
│ │ │  Rp2749
│ │ │  (dp2750
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/xtrapol8.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_vs_map.py
│ │ │  p2751
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2752
│ │ │  Rp2753
│ │ │  (dp2754
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.xmanip
│ │ │ +Vbin/phenix.fmodel
│ │ │  p2755
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2756
│ │ │  Rp2757
│ │ │  (dp2758
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/xmanip.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fmodel.py
│ │ │  p2759
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2760
│ │ │  Rp2761
│ │ │  (dp2762
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.where_is_that_cif_file
│ │ │ +Vbin/phenix.remove_outliers
│ │ │  p2763
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2764
│ │ │  Rp2765
│ │ │  (dp2766
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/where_is_that_cif_file.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/remove_outliers.py
│ │ │  p2767
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2768
│ │ │  Rp2769
│ │ │  (dp2770
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.development.water_b_factors
│ │ │ +Vbin/phenix.rotalyze
│ │ │  p2771
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2772
│ │ │  Rp2773
│ │ │  (dp2774
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/water_b_factors.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rotalyze.py
│ │ │  p2775
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2776
│ │ │  Rp2777
│ │ │  (dp2778
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.verify_mon_lib_data
│ │ │ +Vbin/molprobity.rotalyze
│ │ │  p2779
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2780
│ │ │  Rp2781
│ │ │  (dp2782
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/verify_mon_lib_data.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rotalyze.py
│ │ │  p2783
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2784
│ │ │  Rp2785
│ │ │  (dp2786
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.validation_summary
│ │ │ +Vbin/phenix.model_model_distances
│ │ │  p2787
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2788
│ │ │  Rp2789
│ │ │  (dp2790
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/validation_summary.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_model_distances.py
│ │ │  p2791
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2792
│ │ │  Rp2793
│ │ │  (dp2794
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.validate_ligands
│ │ │ +Vbin/phenix.pdbtools
│ │ │  p2795
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2796
│ │ │  Rp2797
│ │ │  (dp2798
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/validate_ligands.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/pdbtools.py
│ │ │  p2799
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2800
│ │ │  Rp2801
│ │ │  (dp2802
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.validate_ligands
│ │ │ +Vbin/mmtbx.distance_difference
│ │ │  p2803
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2804
│ │ │  Rp2805
│ │ │  (dp2806
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/validate_ligands.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/distance_difference.py
│ │ │  p2807
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2808
│ │ │  Rp2809
│ │ │  (dp2810
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.validate_H
│ │ │ +Vbin/mmtbx.density_modification
│ │ │  p2811
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2812
│ │ │  Rp2813
│ │ │  (dp2814
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/validate_H_cl_app.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/density_modification.py
│ │ │  p2815
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2816
│ │ │  Rp2817
│ │ │  (dp2818
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.undowser2_validation
│ │ │ +Vbin/phenix.models_as_chains
│ │ │  p2819
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2820
│ │ │  Rp2821
│ │ │  (dp2822
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser2.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/models_as_chains.py
│ │ │  p2823
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2824
│ │ │  Rp2825
│ │ │  (dp2826
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.undowser2_validation
│ │ │ +Vbin/mmtbx.super
│ │ │  p2827
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2828
│ │ │  Rp2829
│ │ │  (dp2830
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser2.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/super.py
│ │ │  p2831
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2832
│ │ │  Rp2833
│ │ │  (dp2834
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.undowser2_validation
│ │ │ +Vbin/phenix.barbed_wire_analysis
│ │ │  p2835
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2836
│ │ │  Rp2837
│ │ │  (dp2838
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser2.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/barbed_wire_analysis.py
│ │ │  p2839
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2840
│ │ │  Rp2841
│ │ │  (dp2842
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.undowser_validation
│ │ │ +Vbin/molprobity.barbed_wire_analysis
│ │ │  p2843
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2844
│ │ │  Rp2845
│ │ │  (dp2846
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/barbed_wire_analysis.py
│ │ │  p2847
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2848
│ │ │  Rp2849
│ │ │  (dp2850
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.undowser_validation
│ │ │ +Vbin/mmtbx.arginine_geometry
│ │ │  p2851
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2852
│ │ │  Rp2853
│ │ │  (dp2854
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/arginine_geometry.py
│ │ │  p2855
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2856
│ │ │  Rp2857
│ │ │  (dp2858
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.tls_as_xyz
│ │ │ +Vbin/mmtbx.rama_z
│ │ │  p2859
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2860
│ │ │  Rp2861
│ │ │  (dp2862
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/tls_as_xyz.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rama_z.py
│ │ │  p2863
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2864
│ │ │  Rp2865
│ │ │  (dp2866
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.tls_analysis
│ │ │ +Vbin/phenix.rama_z
│ │ │  p2867
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2868
│ │ │  Rp2869
│ │ │  (dp2870
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/tls_analysis.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rama_z.py
│ │ │  p2871
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2872
│ │ │  Rp2873
│ │ │  (dp2874
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.tls
│ │ │ +Vbin/phenix.suitename
│ │ │  p2875
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2876
│ │ │  Rp2877
│ │ │  (dp2878
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/tls.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename.py
│ │ │  p2879
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2880
│ │ │  Rp2881
│ │ │  (dp2882
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.table_one
│ │ │ +Vbin/molprobity.suitename
│ │ │  p2883
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2884
│ │ │  Rp2885
│ │ │  (dp2886
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/table_one.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename.py
│ │ │  p2887
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2888
│ │ │  Rp2889
│ │ │  (dp2890
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.TAAM_minus_IAM
│ │ │ +Vbin/cctbx.suitename
│ │ │  p2891
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2892
│ │ │  Rp2893
│ │ │  (dp2894
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/taam_minus_iam.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename.py
│ │ │  p2895
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2896
│ │ │  Rp2897
│ │ │  (dp2898
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.TAAM_minus_IAM
│ │ │ +Vbin/phenix.polder
│ │ │  p2899
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2900
│ │ │  Rp2901
│ │ │  (dp2902
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/taam_minus_iam.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/polder.py
│ │ │  p2903
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2904
│ │ │  Rp2905
│ │ │  (dp2906
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.superpose
│ │ │ +Vbin/mmtbx.model_vs_sequence
│ │ │  p2907
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2908
│ │ │  Rp2909
│ │ │  (dp2910
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/superpose.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_vs_sequence.py
│ │ │  p2911
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2912
│ │ │  Rp2913
│ │ │  (dp2914
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.super
│ │ │ +Vbin/phenix.model_vs_sequence
│ │ │  p2915
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2916
│ │ │  Rp2917
│ │ │  (dp2918
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/super.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_vs_sequence.py
│ │ │  p2919
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2920
│ │ │  Rp2921
│ │ │  (dp2922
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.suitename_old
│ │ │ +Vbin/phenix.reciprocal_space_arrays
│ │ │  p2923
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2924
│ │ │  Rp2925
│ │ │  (dp2926
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename_old.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/reciprocal_space_arrays.py
│ │ │  p2927
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2928
│ │ │  Rp2929
│ │ │  (dp2930
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.suitename_old
│ │ │ +Vbin/phenix.cif_as_mtz
│ │ │  p2931
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2932
│ │ │  Rp2933
│ │ │  (dp2934
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename_old.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cif_as_mtz.py
│ │ │  p2935
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2936
│ │ │  Rp2937
│ │ │  (dp2938
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.suitename_old
│ │ │ +Vbin/iotbx.cif_as_mtz
│ │ │  p2939
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2940
│ │ │  Rp2941
│ │ │  (dp2942
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename_old.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cif_as_mtz.py
│ │ │  p2943
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2944
│ │ │  Rp2945
│ │ │  (dp2946
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.suitename
│ │ │ +Vbin/phenix.reduce_cryoem_resolution
│ │ │  p2947
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2948
│ │ │  Rp2949
│ │ │  (dp2950
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/reduce_cryoem_resolution.py
│ │ │  p2951
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2952
│ │ │  Rp2953
│ │ │  (dp2954
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.suitename
│ │ │ +Vbin/mmtbx.reduce_cryoem_resolution
│ │ │  p2955
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2956
│ │ │  Rp2957
│ │ │  (dp2958
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/reduce_cryoem_resolution.py
│ │ │  p2959
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2960
│ │ │  Rp2961
│ │ │  (dp2962
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.suitename
│ │ │ +Vbin/mmtbx.plan_sad_experiment
│ │ │  p2963
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2964
│ │ │  Rp2965
│ │ │  (dp2966
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/plan_sad_experiment.py
│ │ │  p2967
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2968
│ │ │  Rp2969
│ │ │  (dp2970
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.ss_idealization
│ │ │ +Vbin/mmtbx.rebuild_rotarama_cache
│ │ │  p2971
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2972
│ │ │  Rp2973
│ │ │  (dp2974
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ss_idealization.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rebuild_rotarama_cache.py
│ │ │  p2975
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2976
│ │ │  Rp2977
│ │ │  (dp2978
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.sort_hetatms
│ │ │ +Vbin/phenix.comparama
│ │ │  p2979
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2980
│ │ │  Rp2981
│ │ │  (dp2982
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/sort_hetatms.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/comparama.py
│ │ │  p2983
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2984
│ │ │  Rp2985
│ │ │  (dp2986
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.sisa
│ │ │ +Vbin/mmtbx.ringer
│ │ │  p2987
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2988
│ │ │  Rp2989
│ │ │  (dp2990
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/sisa.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ringer.py
│ │ │  p2991
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2992
│ │ │  Rp2993
│ │ │  (dp2994
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.show_r_factors_by_shell
│ │ │ +Vbin/phenix.mask
│ │ │  p2995
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp2996
│ │ │  Rp2997
│ │ │  (dp2998
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/show_r_factors_by_shell.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mask.py
│ │ │  p2999
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3000
│ │ │  Rp3001
│ │ │  (dp3002
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.select_best_starting_model
│ │ │ +Vbin/phenix.hbond
│ │ │  p3003
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3004
│ │ │  Rp3005
│ │ │  (dp3006
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/select_best_starting_model.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/hbond.py
│ │ │  p3007
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3008
│ │ │  Rp3009
│ │ │  (dp3010
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.secondary_structure_validation
│ │ │ +Vbin/phenix.xmanip
│ │ │  p3011
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3012
│ │ │  Rp3013
│ │ │  (dp3014
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/secondary_structure_validation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/xmanip.py
│ │ │  p3015
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3016
│ │ │  Rp3017
│ │ │  (dp3018
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.secondary_structure_restraints
│ │ │ +Vbin/phenix.sisa
│ │ │  p3019
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3020
│ │ │  Rp3021
│ │ │  (dp3022
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/secondary_structure_restraints.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/sisa.py
│ │ │  p3023
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3024
│ │ │  Rp3025
│ │ │  (dp3026
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.search_pdb_symmetry
│ │ │ +Vbin/phenix.fetch_pdb
│ │ │  p3027
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3028
│ │ │  Rp3029
│ │ │  (dp3030
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/search_pdb_symmetry.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fetch_pdb.py
│ │ │  p3031
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3032
│ │ │  Rp3033
│ │ │  (dp3034
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.rotalyze
│ │ │ +Vbin/iotbx.fetch_pdb
│ │ │  p3035
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3036
│ │ │  Rp3037
│ │ │  (dp3038
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rotalyze.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fetch_pdb.py
│ │ │  p3039
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3040
│ │ │  Rp3041
│ │ │  (dp3042
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.rotalyze
│ │ │ +Vbin/phenix.chiral_validation
│ │ │  p3043
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3044
│ │ │  Rp3045
│ │ │  (dp3046
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rotalyze.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/chiral_validation.py
│ │ │  p3047
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3048
│ │ │  Rp3049
│ │ │  (dp3050
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.rna_validate_suites
│ │ │ +Vbin/molprobity.chiral_validation
│ │ │  p3051
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3052
│ │ │  Rp3053
│ │ │  (dp3054
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_suites.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/chiral_validation.py
│ │ │  p3055
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3056
│ │ │  Rp3057
│ │ │  (dp3058
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.rna_validate_suites
│ │ │ +Vbin/mmtbx.verify_mon_lib_data
│ │ │  p3059
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3060
│ │ │  Rp3061
│ │ │  (dp3062
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_suites.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/verify_mon_lib_data.py
│ │ │  p3063
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3064
│ │ │  Rp3065
│ │ │  (dp3066
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.rna_validate_puckers
│ │ │ +Vbin/mmtbx.mon_lib_cif_triage
│ │ │  p3067
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3068
│ │ │  Rp3069
│ │ │  (dp3070
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_puckers.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mon_lib_cif_triage.py
│ │ │  p3071
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3072
│ │ │  Rp3073
│ │ │  (dp3074
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.rna_validate_puckers
│ │ │ +Vbin/phenix.cbetadev
│ │ │  p3075
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3076
│ │ │  Rp3077
│ │ │  (dp3078
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_puckers.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cbetadev.py
│ │ │  p3079
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3080
│ │ │  Rp3081
│ │ │  (dp3082
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.rna_validate_bonds
│ │ │ +Vbin/molprobity.cbetadev
│ │ │  p3083
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3084
│ │ │  Rp3085
│ │ │  (dp3086
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_bonds.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cbetadev.py
│ │ │  p3087
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3088
│ │ │  Rp3089
│ │ │  (dp3090
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.rna_validate_bonds
│ │ │ +Vbin/phenix.map_to_model_histogram
│ │ │  p3091
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3092
│ │ │  Rp3093
│ │ │  (dp3094
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_bonds.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/map_to_model_histogram.py
│ │ │  p3095
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3096
│ │ │  Rp3097
│ │ │  (dp3098
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.rna_validate
│ │ │ +Vbin/phenix.development.xtrapol8
│ │ │  p3099
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3100
│ │ │  Rp3101
│ │ │  (dp3102
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/xtrapol8.py
│ │ │  p3103
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3104
│ │ │  Rp3105
│ │ │  (dp3106
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.rna_validate
│ │ │ +Vbin/mmtbx.search_pdb_symmetry
│ │ │  p3107
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3108
│ │ │  Rp3109
│ │ │  (dp3110
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/search_pdb_symmetry.py
│ │ │  p3111
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3112
│ │ │  Rp3113
│ │ │  (dp3114
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.ringer
│ │ │ +Vbin/phenix.TAAM_minus_IAM
│ │ │  p3115
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3116
│ │ │  Rp3117
│ │ │  (dp3118
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ringer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/taam_minus_iam.py
│ │ │  p3119
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3120
│ │ │  Rp3121
│ │ │  (dp3122
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.rigid_bond_test
│ │ │ +Vbin/mmtbx.TAAM_minus_IAM
│ │ │  p3123
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3124
│ │ │  Rp3125
│ │ │  (dp3126
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rigid_bond_test.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/taam_minus_iam.py
│ │ │  p3127
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3128
│ │ │  Rp3129
│ │ │  (dp3130
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.ribbons
│ │ │ +Vbin/phenix.cablam
│ │ │  p3131
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3132
│ │ │  Rp3133
│ │ │  (dp3134
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ribbons.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cablam.py
│ │ │  p3135
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3136
│ │ │  Rp3137
│ │ │  (dp3138
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.remove_outliers
│ │ │ +Vbin/molprobity.cablam
│ │ │  p3139
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3140
│ │ │  Rp3141
│ │ │  (dp3142
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/remove_outliers.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cablam.py
│ │ │  p3143
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3144
│ │ │  Rp3145
│ │ │  (dp3146
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.refine_anomalous_substructure
│ │ │ +Vbin/phenix.xtriage
│ │ │  p3147
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3148
│ │ │  Rp3149
│ │ │  (dp3150
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/refine_anomalous_substructure.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/xtriage.py
│ │ │  p3151
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3152
│ │ │  Rp3153
│ │ │  (dp3154
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.reduce_cryoem_resolution
│ │ │ +Vbin/mmtbx.xtriage
│ │ │  p3155
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3156
│ │ │  Rp3157
│ │ │  (dp3158
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/reduce_cryoem_resolution.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/xtriage.py
│ │ │  p3159
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3160
│ │ │  Rp3161
│ │ │  (dp3162
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.reduce_cryoem_resolution
│ │ │ +Vbin/phenix.model_idealization
│ │ │  p3163
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3164
│ │ │  Rp3165
│ │ │  (dp3166
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/reduce_cryoem_resolution.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_idealization.py
│ │ │  p3167
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3168
│ │ │  Rp3169
│ │ │  (dp3170
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.reduce2
│ │ │ +Vbin/phenix.mtz2map
│ │ │  p3171
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3172
│ │ │  Rp3173
│ │ │  (dp3174
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/reduce2.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mtz2map.py
│ │ │  p3175
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3176
│ │ │  Rp3177
│ │ │  (dp3178
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.reciprocal_space_arrays
│ │ │ +Vbin/phenix.fft
│ │ │  p3179
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3180
│ │ │  Rp3181
│ │ │  (dp3182
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/reciprocal_space_arrays.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mtz2map.py
│ │ │  p3183
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3184
│ │ │  Rp3185
│ │ │  (dp3186
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.rebuild_rotarama_cache
│ │ │ +Vbin/mmtbx.fft
│ │ │  p3187
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3188
│ │ │  Rp3189
│ │ │  (dp3190
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rebuild_rotarama_cache.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mtz2map.py
│ │ │  p3191
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3192
│ │ │  Rp3193
│ │ │  (dp3194
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.rebuild_cablam_cache
│ │ │ +Vbin/phenix.undowser2_validation
│ │ │  p3195
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3196
│ │ │  Rp3197
│ │ │  (dp3198
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rebuild_cablam_cache.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser2.py
│ │ │  p3199
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3200
│ │ │  Rp3201
│ │ │  (dp3202
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.real_space_diff_map
│ │ │ +Vbin/mmtbx.undowser2_validation
│ │ │  p3203
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3204
│ │ │  Rp3205
│ │ │  (dp3206
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/real_space_diff_map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser2.py
│ │ │  p3207
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3208
│ │ │  Rp3209
│ │ │  (dp3210
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.real_space_correlation
│ │ │ +Vbin/molprobity.undowser2_validation
│ │ │  p3211
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3212
│ │ │  Rp3213
│ │ │  (dp3214
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/real_space_correlation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser2.py
│ │ │  p3215
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3216
│ │ │  Rp3217
│ │ │  (dp3218
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.rank_scale_map
│ │ │ +Vbin/mmtbx.prune_model
│ │ │  p3219
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3220
│ │ │  Rp3221
│ │ │  (dp3222
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rank_scale_map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/prune_model.py
│ │ │  p3223
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3224
│ │ │  Rp3225
│ │ │  (dp3226
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.ramalyze
│ │ │ +Vbin/mmtbx.model_vs_data
│ │ │  p3227
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3228
│ │ │  Rp3229
│ │ │  (dp3230
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ramalyze.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_vs_data.py
│ │ │  p3231
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3232
│ │ │  Rp3233
│ │ │  (dp3234
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.ramalyze
│ │ │ +Vbin/phenix.mp_validate_bonds
│ │ │  p3235
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3236
│ │ │  Rp3237
│ │ │  (dp3238
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ramalyze.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mp_validate_bonds.py
│ │ │  p3239
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3240
│ │ │  Rp3241
│ │ │  (dp3242
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.rama_z
│ │ │ +Vbin/molprobity.mp_validate_bonds
│ │ │  p3243
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3244
│ │ │  Rp3245
│ │ │  (dp3246
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rama_z.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mp_validate_bonds.py
│ │ │  p3247
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3248
│ │ │  Rp3249
│ │ │  (dp3250
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.rama_z
│ │ │ +Vbin/mmtbx.table_one
│ │ │  p3251
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3252
│ │ │  Rp3253
│ │ │  (dp3254
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rama_z.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/table_one.py
│ │ │  p3255
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3256
│ │ │  Rp3257
│ │ │  (dp3258
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.r_factor_statistics
│ │ │ +Vbin/mmtbx.select_best_starting_model
│ │ │  p3259
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3260
│ │ │  Rp3261
│ │ │  (dp3262
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/r_factor_statistics.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/select_best_starting_model.py
│ │ │  p3263
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3264
│ │ │  Rp3265
│ │ │  (dp3266
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.quantum_interface
│ │ │ +Vbin/phenix.tls_analysis
│ │ │  p3267
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3268
│ │ │  Rp3269
│ │ │  (dp3270
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/quantum_interface.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/tls_analysis.py
│ │ │  p3271
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3272
│ │ │  Rp3273
│ │ │  (dp3274
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.prune_model
│ │ │ +Vbin/phenix.development.valence_simple
│ │ │  p3275
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3276
│ │ │  Rp3277
│ │ │  (dp3278
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/prune_model.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/atom_valence_simple.py
│ │ │  p3279
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3280
│ │ │  Rp3281
│ │ │  (dp3282
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.process_predicted_model
│ │ │ +Vbin/phenix.dynamics
│ │ │  p3283
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3284
│ │ │  Rp3285
│ │ │  (dp3286
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/process_predicted_model.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/dynamics.py
│ │ │  p3287
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3288
│ │ │  Rp3289
│ │ │  (dp3290
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.process_predicted_model
│ │ │ +Vbin/phenix.maximum_entropy_map
│ │ │  p3291
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3292
│ │ │  Rp3293
│ │ │  (dp3294
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/process_predicted_model.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/maximum_entropy_map.py
│ │ │  p3295
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3296
│ │ │  Rp3297
│ │ │  (dp3298
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.probescore_ligand
│ │ │ +Vbin/phenix.validate_H
│ │ │  p3299
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3300
│ │ │  Rp3301
│ │ │  (dp3302
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/probescore_ligand.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/validate_H_cl_app.py
│ │ │  p3303
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3304
│ │ │  Rp3305
│ │ │  (dp3306
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.probe2
│ │ │ +Vbin/phenix.helix_sheet_recs_as_pdb_files
│ │ │  p3307
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3308
│ │ │  Rp3309
│ │ │  (dp3310
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/probe2.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/helix_sheet_recs_as_pdb_files.py
│ │ │  p3311
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3312
│ │ │  Rp3313
│ │ │  (dp3314
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.prepare_pdb_deposition
│ │ │ +Vbin/mmtbx.development.ligand_restraints_validation
│ │ │  p3315
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3316
│ │ │  Rp3317
│ │ │  (dp3318
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/prepare_pdb_deposition.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ligand_restraints_validation.py
│ │ │  p3319
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3320
│ │ │  Rp3321
│ │ │  (dp3322
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.polder
│ │ │ +Vbin/phenix.clashscore
│ │ │  p3323
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3324
│ │ │  Rp3325
│ │ │  (dp3326
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/polder.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore.py
│ │ │  p3327
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3328
│ │ │  Rp3329
│ │ │  (dp3330
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.plan_sad_experiment
│ │ │ +Vbin/molprobity.clashscore
│ │ │  p3331
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3332
│ │ │  Rp3333
│ │ │  (dp3334
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/plan_sad_experiment.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore.py
│ │ │  p3335
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3336
│ │ │  Rp3337
│ │ │  (dp3338
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.perigee
│ │ │ +Vbin/phenix.suitename_old
│ │ │  p3339
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3340
│ │ │  Rp3341
│ │ │  (dp3342
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/perigee.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename_old.py
│ │ │  p3343
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3344
│ │ │  Rp3345
│ │ │  (dp3346
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdbtools
│ │ │ +Vbin/molprobity.suitename_old
│ │ │  p3347
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3348
│ │ │  Rp3349
│ │ │  (dp3350
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/pdbtools.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename_old.py
│ │ │  p3351
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3352
│ │ │  Rp3353
│ │ │  (dp3354
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb_interpretation
│ │ │ +Vbin/cctbx.suitename_old
│ │ │  p3355
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3356
│ │ │  Rp3357
│ │ │  (dp3358
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/pdb_interpretation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/suitename_old.py
│ │ │  p3359
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3360
│ │ │  Rp3361
│ │ │  (dp3362
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.pdb_interpretation
│ │ │ +Vbin/phenix.development.the_run_down
│ │ │  p3363
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3364
│ │ │  Rp3365
│ │ │  (dp3366
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/pdb_interpretation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/next_gen_residue_typing.py
│ │ │  p3367
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3368
│ │ │  Rp3369
│ │ │  (dp3370
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb_atom_selection
│ │ │ +Vbin/phenix.fobs_minus_fobs_map
│ │ │  p3371
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3372
│ │ │  Rp3373
│ │ │  (dp3374
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/pdb_atom_selection.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fobs_minus_fobs_map.py
│ │ │  p3375
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3376
│ │ │  Rp3377
│ │ │  (dp3378
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.omegalyze
│ │ │ +Vbin/phenix.find_peaks_holes
│ │ │  p3379
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3380
│ │ │  Rp3381
│ │ │  (dp3382
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/omegalyze.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/find_peaks_holes.py
│ │ │  p3383
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3384
│ │ │  Rp3385
│ │ │  (dp3386
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.omegalyze
│ │ │ +Vbin/mmtbx.find_peaks_holes
│ │ │  p3387
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3388
│ │ │  Rp3389
│ │ │  (dp3390
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/omegalyze.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/find_peaks_holes.py
│ │ │  p3391
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3392
│ │ │  Rp3393
│ │ │  (dp3394
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.nonbonded_overlaps
│ │ │ +Vbin/phenix.secondary_structure_restraints
│ │ │  p3395
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3396
│ │ │  Rp3397
│ │ │  (dp3398
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/nonbonded_overlaps.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/secondary_structure_restraints.py
│ │ │  p3399
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3400
│ │ │  Rp3401
│ │ │  (dp3402
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.development.the_run_down
│ │ │ +Vbin/phenix.ramalyze
│ │ │  p3403
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3404
│ │ │  Rp3405
│ │ │  (dp3406
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/next_gen_residue_typing.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ramalyze.py
│ │ │  p3407
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3408
│ │ │  Rp3409
│ │ │  (dp3410
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.development.next_gen_atom_typing
│ │ │ +Vbin/molprobity.ramalyze
│ │ │  p3411
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3412
│ │ │  Rp3413
│ │ │  (dp3414
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/next_gen_atom_typing.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ramalyze.py
│ │ │  p3415
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3416
│ │ │  Rp3417
│ │ │  (dp3418
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.mtz2map
│ │ │ +Vbin/phenix.cc_star
│ │ │  p3419
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3420
│ │ │  Rp3421
│ │ │  (dp3422
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mtz2map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cc_star.py
│ │ │  p3423
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3424
│ │ │  Rp3425
│ │ │  (dp3426
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.fft
│ │ │ +Vbin/phenix.sort_hetatms
│ │ │  p3427
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3428
│ │ │  Rp3429
│ │ │  (dp3430
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mtz2map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/sort_hetatms.py
│ │ │  p3431
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3432
│ │ │  Rp3433
│ │ │  (dp3434
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.fft
│ │ │ +Vbin/phenix.geometry_minimization
│ │ │  p3435
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3436
│ │ │  Rp3437
│ │ │  (dp3438
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mtz2map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/geometry_minimization.py
│ │ │  p3439
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3440
│ │ │  Rp3441
│ │ │  (dp3442
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.mp_validate_bonds
│ │ │ +Vbin/mmtbx.development.water_b_factors
│ │ │  p3443
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3444
│ │ │  Rp3445
│ │ │  (dp3446
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mp_validate_bonds.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/water_b_factors.py
│ │ │  p3447
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3448
│ │ │  Rp3449
│ │ │  (dp3450
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.mp_validate_bonds
│ │ │ +Vbin/mmtbx.emringer_score
│ │ │  p3451
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3452
│ │ │  Rp3453
│ │ │  (dp3454
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mp_validate_bonds.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/emringer_score.py
│ │ │  p3455
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3456
│ │ │  Rp3457
│ │ │  (dp3458
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.mp_geo
│ │ │ +Vbin/mmtbx.debugging.riding
│ │ │  p3459
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3460
│ │ │  Rp3461
│ │ │  (dp3462
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mp_geo.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/debug_riding.py
│ │ │  p3463
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3464
│ │ │  Rp3465
│ │ │  (dp3466
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.mon_lib_cif_triage
│ │ │ +Vbin/phenix.holton_geometry_validation
│ │ │  p3467
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3468
│ │ │  Rp3469
│ │ │  (dp3470
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mon_lib_cif_triage.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/holton_geometry_validation.py
│ │ │  p3471
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3472
│ │ │  Rp3473
│ │ │  (dp3474
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.molprobity
│ │ │ +Vbin/mmtbx.holton_geometry_validation
│ │ │  p3475
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3476
│ │ │  Rp3477
│ │ │  (dp3478
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/molprobity.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/holton_geometry_validation.py
│ │ │  p3479
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3480
│ │ │  Rp3481
│ │ │  (dp3482
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.molprobity
│ │ │ +Vbin/mmtbx.apply_ncs_to_ligand
│ │ │  p3483
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3484
│ │ │  Rp3485
│ │ │  (dp3486
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/molprobity.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/apply_ncs_to_ligand.py
│ │ │  p3487
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3488
│ │ │  Rp3489
│ │ │  (dp3490
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.models_as_chains
│ │ │ +Vbin/mmtbx.rebuild_cablam_cache
│ │ │  p3491
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3492
│ │ │  Rp3493
│ │ │  (dp3494
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/models_as_chains.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rebuild_cablam_cache.py
│ │ │  p3495
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3496
│ │ │  Rp3497
│ │ │  (dp3498
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.model_vs_sequence
│ │ │ +Vbin/phenix.development.next_gen_atom_typing
│ │ │  p3499
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3500
│ │ │  Rp3501
│ │ │  (dp3502
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_vs_sequence.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/next_gen_atom_typing.py
│ │ │  p3503
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3504
│ │ │  Rp3505
│ │ │  (dp3506
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.model_vs_sequence
│ │ │ +Vbin/phenix.maps
│ │ │  p3507
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3508
│ │ │  Rp3509
│ │ │  (dp3510
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_vs_sequence.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/maps.py
│ │ │  p3511
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3512
│ │ │  Rp3513
│ │ │  (dp3514
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.model_vs_map
│ │ │ +Vbin/mmtbx.ss_idealization
│ │ │  p3515
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3516
│ │ │  Rp3517
│ │ │  (dp3518
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_vs_map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ss_idealization.py
│ │ │  p3519
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3520
│ │ │  Rp3521
│ │ │  (dp3522
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.model_vs_data
│ │ │ +Vbin/mmtbx.where_is_that_cif_file
│ │ │  p3523
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3524
│ │ │  Rp3525
│ │ │  (dp3526
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_vs_data.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/where_is_that_cif_file.py
│ │ │  p3527
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3528
│ │ │  Rp3529
│ │ │  (dp3530
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.model_model_distances
│ │ │ +Vbin/mmtbx.process_predicted_model
│ │ │  p3531
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3532
│ │ │  Rp3533
│ │ │  (dp3534
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_model_distances.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/process_predicted_model.py
│ │ │  p3535
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3536
│ │ │  Rp3537
│ │ │  (dp3538
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.model_map
│ │ │ +Vbin/phenix.process_predicted_model
│ │ │  p3539
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3540
│ │ │  Rp3541
│ │ │  (dp3542
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/process_predicted_model.py
│ │ │  p3543
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3544
│ │ │  Rp3545
│ │ │  (dp3546
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.model_idealization
│ │ │ +Vbin/phenix.angle
│ │ │  p3547
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3548
│ │ │  Rp3549
│ │ │  (dp3550
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_idealization.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/angle.py
│ │ │  p3551
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3552
│ │ │  Rp3553
│ │ │  (dp3554
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.maximum_entropy_map
│ │ │ +Vbin/mmtbx.probe2
│ │ │  p3555
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3556
│ │ │  Rp3557
│ │ │  (dp3558
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/maximum_entropy_map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/probe2.py
│ │ │  p3559
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3560
│ │ │  Rp3561
│ │ │  (dp3562
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.matthews
│ │ │ +Vbin/mmtbx.ribbons
│ │ │  p3563
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3564
│ │ │  Rp3565
│ │ │  (dp3566
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/matthews.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ribbons.py
│ │ │  p3567
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3568
│ │ │  Rp3569
│ │ │  (dp3570
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.massage_data
│ │ │ +Vbin/phenix.perigee
│ │ │  p3571
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3572
│ │ │  Rp3573
│ │ │  (dp3574
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/massage_data.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/perigee.py
│ │ │  p3575
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3576
│ │ │  Rp3577
│ │ │  (dp3578
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.mask
│ │ │ +Vbin/mmtbx.altloc_remediate
│ │ │  p3579
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3580
│ │ │  Rp3581
│ │ │  (dp3582
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mask.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/altloc_remediate.py
│ │ │  p3583
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3584
│ │ │  Rp3585
│ │ │  (dp3586
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.maps
│ │ │ +Vbin/phenix.f000
│ │ │  p3587
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3588
│ │ │  Rp3589
│ │ │  (dp3590
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/maps.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/f000.py
│ │ │  p3591
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3592
│ │ │  Rp3593
│ │ │  (dp3594
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.map_to_structure_factors
│ │ │ +Vbin/mmtbx.development.electrons
│ │ │  p3595
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3596
│ │ │  Rp3597
│ │ │  (dp3598
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/map_to_structure_factors.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/electrons.py
│ │ │  p3599
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3600
│ │ │  Rp3601
│ │ │  (dp3602
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.map_to_model_histogram
│ │ │ +Vbin/mmtbx.reduce2
│ │ │  p3603
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3604
│ │ │  Rp3605
│ │ │  (dp3606
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/map_to_model_histogram.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/reduce2.py
│ │ │  p3607
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3608
│ │ │  Rp3609
│ │ │  (dp3610
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.map_comparison
│ │ │ +Vbin/mmtbx.development.aev
│ │ │  p3611
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3612
│ │ │  Rp3613
│ │ │  (dp3614
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/map_comparison.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/development_aev.py
│ │ │  p3615
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3616
│ │ │  Rp3617
│ │ │  (dp3618
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.map_box
│ │ │ +Vbin/mmtbx.rigid_bond_test
│ │ │  p3619
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3620
│ │ │  Rp3621
│ │ │  (dp3622
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/map_box.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rigid_bond_test.py
│ │ │  p3623
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3624
│ │ │  Rp3625
│ │ │  (dp3626
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.development.ligand_restraints_validation
│ │ │ +Vbin/mmtbx.massage_data
│ │ │  p3627
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3628
│ │ │  Rp3629
│ │ │  (dp3630
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/ligand_restraints_validation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/massage_data.py
│ │ │  p3631
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3632
│ │ │  Rp3633
│ │ │  (dp3634
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.kinemage
│ │ │ +Vbin/phenix.fab_elbow_angle
│ │ │  p3635
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3636
│ │ │  Rp3637
│ │ │  (dp3638
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/kinemage.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fab_elbow_angle.py
│ │ │  p3639
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3640
│ │ │  Rp3641
│ │ │  (dp3642
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.kinemage
│ │ │ +Vbin/phenix.undowser_validation
│ │ │  p3643
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3644
│ │ │  Rp3645
│ │ │  (dp3646
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/kinemage.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser.py
│ │ │  p3647
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3648
│ │ │  Rp3649
│ │ │  (dp3650
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.debugging.hydrogenate
│ │ │ +Vbin/molprobity.undowser_validation
│ │ │  p3651
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3652
│ │ │  Rp3653
│ │ │  (dp3654
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/hydrogenate.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/undowser.py
│ │ │  p3655
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3656
│ │ │  Rp3657
│ │ │  (dp3658
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.holton_geometry_validation
│ │ │ +Vbin/phenix.rna_validate_suites
│ │ │  p3659
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3660
│ │ │  Rp3661
│ │ │  (dp3662
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/holton_geometry_validation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_suites.py
│ │ │  p3663
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3664
│ │ │  Rp3665
│ │ │  (dp3666
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.holton_geometry_validation
│ │ │ +Vbin/molprobity.rna_validate_suites
│ │ │  p3667
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3668
│ │ │  Rp3669
│ │ │  (dp3670
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/holton_geometry_validation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_suites.py
│ │ │  p3671
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3672
│ │ │  Rp3673
│ │ │  (dp3674
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.helix_sheet_recs_as_pdb_files
│ │ │ +Vbin/phenix.grow_density
│ │ │  p3675
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3676
│ │ │  Rp3677
│ │ │  (dp3678
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/helix_sheet_recs_as_pdb_files.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/grow_density.py
│ │ │  p3679
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3680
│ │ │  Rp3681
│ │ │  (dp3682
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.hbond
│ │ │ +Vbin/mmtbx.debugging.hydrogenate
│ │ │  p3683
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3684
│ │ │  Rp3685
│ │ │  (dp3686
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/hbond.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/hydrogenate.py
│ │ │  p3687
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3688
│ │ │  Rp3689
│ │ │  (dp3690
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.grow_density
│ │ │ +Vbin/molprobity.probescore_ligand
│ │ │  p3691
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3692
│ │ │  Rp3693
│ │ │  (dp3694
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/grow_density.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/probescore_ligand.py
│ │ │  p3695
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3696
│ │ │  Rp3697
│ │ │  (dp3698
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.geometry_minimization
│ │ │ +Vbin/phenix.real_space_diff_map
│ │ │  p3699
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3700
│ │ │  Rp3701
│ │ │  (dp3702
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/geometry_minimization.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/real_space_diff_map.py
│ │ │  p3703
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3704
│ │ │  Rp3705
│ │ │  (dp3706
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.fobs_minus_fobs_map
│ │ │ +Vbin/mmtbx.quantum_interface
│ │ │  p3707
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3708
│ │ │  Rp3709
│ │ │  (dp3710
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fobs_minus_fobs_map.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/quantum_interface.py
│ │ │  p3711
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3712
│ │ │  Rp3713
│ │ │  (dp3714
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.fmodel
│ │ │ +Vbin/phenix.map_comparison
│ │ │  p3715
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3716
│ │ │  Rp3717
│ │ │  (dp3718
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fmodel.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/map_comparison.py
│ │ │  p3719
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3720
│ │ │  Rp3721
│ │ │  (dp3722
│ │ │ @@ -10175,972 +10175,972 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3728
│ │ │  Rp3729
│ │ │  (dp3730
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.find_residue_in_pdb
│ │ │ +Vbin/mmtbx.matthews
│ │ │  p3731
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3732
│ │ │  Rp3733
│ │ │  (dp3734
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/find_residue_in_pdb.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/matthews.py
│ │ │  p3735
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3736
│ │ │  Rp3737
│ │ │  (dp3738
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.find_peaks_holes
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb_interpretation
│ │ │  p3739
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3740
│ │ │  Rp3741
│ │ │  (dp3742
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/find_peaks_holes.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/pdb_interpretation.py
│ │ │  p3743
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3744
│ │ │  Rp3745
│ │ │  (dp3746
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.find_peaks_holes
│ │ │ +Vbin/mmtbx.pdb_interpretation
│ │ │  p3747
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3748
│ │ │  Rp3749
│ │ │  (dp3750
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/find_peaks_holes.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/pdb_interpretation.py
│ │ │  p3751
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3752
│ │ │  Rp3753
│ │ │  (dp3754
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.fetch_pdb
│ │ │ +Vbin/phenix.fake_f_obs
│ │ │  p3755
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3756
│ │ │  Rp3757
│ │ │  (dp3758
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fetch_pdb.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fake_f_obs.py
│ │ │  p3759
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3760
│ │ │  Rp3761
│ │ │  (dp3762
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.fetch_pdb
│ │ │ +Vbin/phenix.rank_scale_map
│ │ │  p3763
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3764
│ │ │  Rp3765
│ │ │  (dp3766
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fetch_pdb.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rank_scale_map.py
│ │ │  p3767
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3768
│ │ │  Rp3769
│ │ │  (dp3770
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.fake_f_obs
│ │ │ +Vbin/mmtbx.estimate_bijvoet_ratio
│ │ │  p3771
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3772
│ │ │  Rp3773
│ │ │  (dp3774
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fake_f_obs.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/estimate_bijvoet_ratio.py
│ │ │  p3775
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3776
│ │ │  Rp3777
│ │ │  (dp3778
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.fab_elbow_angle
│ │ │ +Vbin/phenix.tls_as_xyz
│ │ │  p3779
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3780
│ │ │  Rp3781
│ │ │  (dp3782
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/fab_elbow_angle.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/tls_as_xyz.py
│ │ │  p3783
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3784
│ │ │  Rp3785
│ │ │  (dp3786
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.f000
│ │ │ +Vbin/phenix.real_space_correlation
│ │ │  p3787
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3788
│ │ │  Rp3789
│ │ │  (dp3790
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/f000.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/real_space_correlation.py
│ │ │  p3791
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3792
│ │ │  Rp3793
│ │ │  (dp3794
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.estimate_bijvoet_ratio
│ │ │ +Vbin/mmtbx.superpose
│ │ │  p3795
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3796
│ │ │  Rp3797
│ │ │  (dp3798
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/estimate_bijvoet_ratio.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/superpose.py
│ │ │  p3799
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3800
│ │ │  Rp3801
│ │ │  (dp3802
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.emringer_score
│ │ │ +Vbin/phenix.cablam_idealization
│ │ │  p3803
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3804
│ │ │  Rp3805
│ │ │  (dp3806
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/emringer_score.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cablam_idealization.py
│ │ │  p3807
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3808
│ │ │  Rp3809
│ │ │  (dp3810
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.emringer
│ │ │ +Vbin/mmtbx.refine_anomalous_substructure
│ │ │  p3811
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3812
│ │ │  Rp3813
│ │ │  (dp3814
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/emringer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/refine_anomalous_substructure.py
│ │ │  p3815
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3816
│ │ │  Rp3817
│ │ │  (dp3818
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.development.electrons
│ │ │ +Vbin/mmtbx.show_r_factors_by_shell
│ │ │  p3819
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3820
│ │ │  Rp3821
│ │ │  (dp3822
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/electrons.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/show_r_factors_by_shell.py
│ │ │  p3823
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3824
│ │ │  Rp3825
│ │ │  (dp3826
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.dynamics
│ │ │ +Vbin/phenix.rna_validate_puckers
│ │ │  p3827
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3828
│ │ │  Rp3829
│ │ │  (dp3830
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/dynamics.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_puckers.py
│ │ │  p3831
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3832
│ │ │  Rp3833
│ │ │  (dp3834
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.distance_difference
│ │ │ +Vbin/molprobity.rna_validate_puckers
│ │ │  p3835
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3836
│ │ │  Rp3837
│ │ │  (dp3838
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/distance_difference.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate_puckers.py
│ │ │  p3839
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3840
│ │ │  Rp3841
│ │ │  (dp3842
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.fem
│ │ │ +Vbin/phenix.molprobity
│ │ │  p3843
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3844
│ │ │  Rp3845
│ │ │  (dp3846
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/development_fem.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/molprobity.py
│ │ │  p3847
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3848
│ │ │  Rp3849
│ │ │  (dp3850
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.feature_enhanced_map
│ │ │ +Vbin/molprobity.molprobity
│ │ │  p3851
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3852
│ │ │  Rp3853
│ │ │  (dp3854
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/development_fem.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/molprobity.py
│ │ │  p3855
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3856
│ │ │  Rp3857
│ │ │  (dp3858
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.development.aev
│ │ │ +Vbin/phenix.clashscore2
│ │ │  p3859
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3860
│ │ │  Rp3861
│ │ │  (dp3862
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/development_aev.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore2.py
│ │ │  p3863
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3864
│ │ │  Rp3865
│ │ │  (dp3866
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.density_modification
│ │ │ +Vbin/molprobity.clashscore2
│ │ │  p3867
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3868
│ │ │  Rp3869
│ │ │  (dp3870
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/density_modification.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore2.py
│ │ │  p3871
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3872
│ │ │  Rp3873
│ │ │  (dp3874
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.debugging.riding
│ │ │ +Vbin/mmtbx.clashscore2
│ │ │  p3875
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3876
│ │ │  Rp3877
│ │ │  (dp3878
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/debug_riding.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore2.py
│ │ │  p3879
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3880
│ │ │  Rp3881
│ │ │  (dp3882
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.comparama
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb_atom_selection
│ │ │  p3883
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3884
│ │ │  Rp3885
│ │ │  (dp3886
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/comparama.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/pdb_atom_selection.py
│ │ │  p3887
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3888
│ │ │  Rp3889
│ │ │  (dp3890
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.clashscore2
│ │ │ +Vbin/mmtbx.mp_geo
│ │ │  p3891
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3892
│ │ │  Rp3893
│ │ │  (dp3894
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore2.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/mp_geo.py
│ │ │  p3895
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3896
│ │ │  Rp3897
│ │ │  (dp3898
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.clashscore2
│ │ │ +Vbin/phenix.kinemage
│ │ │  p3899
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3900
│ │ │  Rp3901
│ │ │  (dp3902
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore2.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/kinemage.py
│ │ │  p3903
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3904
│ │ │  Rp3905
│ │ │  (dp3906
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.clashscore2
│ │ │ +Vbin/molprobity.kinemage
│ │ │  p3907
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3908
│ │ │  Rp3909
│ │ │  (dp3910
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore2.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/kinemage.py
│ │ │  p3911
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3912
│ │ │  Rp3913
│ │ │  (dp3914
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.clashscore
│ │ │ +Vbin/phenix.fem
│ │ │  p3915
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3916
│ │ │  Rp3917
│ │ │  (dp3918
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/development_fem.py
│ │ │  p3919
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3920
│ │ │  Rp3921
│ │ │  (dp3922
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.clashscore
│ │ │ +Vbin/phenix.feature_enhanced_map
│ │ │  p3923
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3924
│ │ │  Rp3925
│ │ │  (dp3926
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/clashscore.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/development_fem.py
│ │ │  p3927
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3928
│ │ │  Rp3929
│ │ │  (dp3930
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.cif_as_mtz
│ │ │ +Vbin/phenix.map_box
│ │ │  p3931
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3932
│ │ │  Rp3933
│ │ │  (dp3934
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cif_as_mtz.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/map_box.py
│ │ │  p3935
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3936
│ │ │  Rp3937
│ │ │  (dp3938
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/iotbx.cif_as_mtz
│ │ │ +Vbin/phenix.validate_ligands
│ │ │  p3939
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3940
│ │ │  Rp3941
│ │ │  (dp3942
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cif_as_mtz.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/validate_ligands.py
│ │ │  p3943
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3944
│ │ │  Rp3945
│ │ │  (dp3946
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.chiral_validation
│ │ │ +Vbin/mmtbx.validate_ligands
│ │ │  p3947
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3948
│ │ │  Rp3949
│ │ │  (dp3950
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/chiral_validation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/validate_ligands.py
│ │ │  p3951
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3952
│ │ │  Rp3953
│ │ │  (dp3954
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.chiral_validation
│ │ │ +Vbin/phenix.r_factor_statistics
│ │ │  p3955
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3956
│ │ │  Rp3957
│ │ │  (dp3958
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/chiral_validation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/r_factor_statistics.py
│ │ │  p3959
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3960
│ │ │  Rp3961
│ │ │  (dp3962
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.cc_star
│ │ │ +Vbin/phenix.secondary_structure_validation
│ │ │  p3963
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3964
│ │ │  Rp3965
│ │ │  (dp3966
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cc_star.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/secondary_structure_validation.py
│ │ │  p3967
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3968
│ │ │  Rp3969
│ │ │  (dp3970
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.cbetadev
│ │ │ +Vbin/mmtbx.find_residue_in_pdb
│ │ │  p3971
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3972
│ │ │  Rp3973
│ │ │  (dp3974
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cbetadev.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/find_residue_in_pdb.py
│ │ │  p3975
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3976
│ │ │  Rp3977
│ │ │  (dp3978
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.cbetadev
│ │ │ +Vbin/phenix.rna_validate
│ │ │  p3979
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3980
│ │ │  Rp3981
│ │ │  (dp3982
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cbetadev.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate.py
│ │ │  p3983
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3984
│ │ │  Rp3985
│ │ │  (dp3986
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.cablam_idealization
│ │ │ +Vbin/molprobity.rna_validate
│ │ │  p3987
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3988
│ │ │  Rp3989
│ │ │  (dp3990
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cablam_idealization.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/rna_validate.py
│ │ │  p3991
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3992
│ │ │  Rp3993
│ │ │  (dp3994
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.cablam
│ │ │ +Vbin/mmtbx.validation_summary
│ │ │  p3995
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp3996
│ │ │  Rp3997
│ │ │  (dp3998
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cablam.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/validation_summary.py
│ │ │  p3999
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4000
│ │ │  Rp4001
│ │ │  (dp4002
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.cablam
│ │ │ +Vbin/phenix.model_map
│ │ │  p4003
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4004
│ │ │  Rp4005
│ │ │  (dp4006
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/cablam.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/model_map.py
│ │ │  p4007
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4008
│ │ │  Rp4009
│ │ │  (dp4010
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.barbed_wire_analysis
│ │ │ +Vbin/mmtbx.prepare_pdb_deposition
│ │ │  p4011
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4012
│ │ │  Rp4013
│ │ │  (dp4014
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/barbed_wire_analysis.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/prepare_pdb_deposition.py
│ │ │  p4015
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4016
│ │ │  Rp4017
│ │ │  (dp4018
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/molprobity.barbed_wire_analysis
│ │ │ +Vbin/phenix.tls
│ │ │  p4019
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4020
│ │ │  Rp4021
│ │ │  (dp4022
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/barbed_wire_analysis.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/tls.py
│ │ │  p4023
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4024
│ │ │  Rp4025
│ │ │  (dp4026
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.development.valence_simple
│ │ │ +Vbin/mmtbx.nonbonded_overlaps
│ │ │  p4027
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4028
│ │ │  Rp4029
│ │ │  (dp4030
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/atom_valence_simple.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/nonbonded_overlaps.py
│ │ │  p4031
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4032
│ │ │  Rp4033
│ │ │  (dp4034
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.arginine_geometry
│ │ │ +Vbin/phenix.map_to_structure_factors
│ │ │  p4035
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4036
│ │ │  Rp4037
│ │ │  (dp4038
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/arginine_geometry.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/map_to_structure_factors.py
│ │ │  p4039
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4040
│ │ │  Rp4041
│ │ │  (dp4042
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.apply_ncs_to_ligand
│ │ │ +Vbin/phenix.emringer
│ │ │  p4043
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4044
│ │ │  Rp4045
│ │ │  (dp4046
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/apply_ncs_to_ligand.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/emringer.py
│ │ │  p4047
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4048
│ │ │  Rp4049
│ │ │  (dp4050
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.angle
│ │ │ +Vbin/phenix.omegalyze
│ │ │  p4051
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4052
│ │ │  Rp4053
│ │ │  (dp4054
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/angle.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/omegalyze.py
│ │ │  p4055
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4056
│ │ │  Rp4057
│ │ │  (dp4058
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.altloc_remediate
│ │ │ +Vbin/molprobity.omegalyze
│ │ │  p4059
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4060
│ │ │  Rp4061
│ │ │  (dp4062
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/altloc_remediate.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/mmtbx/command_line/omegalyze.py
│ │ │  p4063
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4064
│ │ │  Rp4065
│ │ │  (dp4066
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/distl.thin_client
│ │ │ +Vbin/distl.image_viewer
│ │ │  p4067
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4068
│ │ │  Rp4069
│ │ │  (dp4070
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/thin_client.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/image_viewer.py
│ │ │  p4071
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4072
│ │ │  Rp4073
│ │ │  (dp4074
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/distl.sweep_strength
│ │ │ +Vbin/distl.thin_client
│ │ │  p4075
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4076
│ │ │  Rp4077
│ │ │  (dp4078
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/sweep_strength.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/thin_client.py
│ │ │  p4079
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4080
│ │ │  Rp4081
│ │ │  (dp4082
│ │ │ @@ -11165,202 +11165,202 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4088
│ │ │  Rp4089
│ │ │  (dp4090
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/distl.mp_spotfinder_server_read_file
│ │ │ +Vbin/distl.sweep_strength
│ │ │  p4091
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4092
│ │ │  Rp4093
│ │ │  (dp4094
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/mp_spotfinder_server_read_file.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/sweep_strength.py
│ │ │  p4095
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4096
│ │ │  Rp4097
│ │ │  (dp4098
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/distl.image_viewer
│ │ │ +Vbin/distl.find_active_area
│ │ │  p4099
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4100
│ │ │  Rp4101
│ │ │  (dp4102
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/image_viewer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/find_active_area.py
│ │ │  p4103
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4104
│ │ │  Rp4105
│ │ │  (dp4106
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/distl.find_active_area
│ │ │ +Vbin/distl.mp_spotfinder_server_read_file
│ │ │  p4107
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4108
│ │ │  Rp4109
│ │ │  (dp4110
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/find_active_area.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/spotfinder/command_line/mp_spotfinder_server_read_file.py
│ │ │  p4111
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4112
│ │ │  Rp4113
│ │ │  (dp4114
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.image_viewer
│ │ │ +Vbin/rstbx.simage.solver
│ │ │  p4115
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4116
│ │ │  Rp4117
│ │ │  (dp4118
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/viewer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/simage.solver.py
│ │ │  p4119
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4120
│ │ │  Rp4121
│ │ │  (dp4122
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.image_viewer
│ │ │ +Vbin/rstbx.simage.explore_completeness
│ │ │  p4123
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4124
│ │ │  Rp4125
│ │ │  (dp4126
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/slip_viewer.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/simage.explore_completeness.py
│ │ │  p4127
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4128
│ │ │  Rp4129
│ │ │  (dp4130
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/rstbx.simage.wx_display
│ │ │ +Vbin/phenix.image_viewer
│ │ │  p4131
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4132
│ │ │  Rp4133
│ │ │  (dp4134
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/simage.wx_display.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/viewer.py
│ │ │  p4135
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4136
│ │ │  Rp4137
│ │ │  (dp4138
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/rstbx.simage.solver
│ │ │ +Vbin/cctbx.image_viewer
│ │ │  p4139
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4140
│ │ │  Rp4141
│ │ │  (dp4142
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/simage.solver.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/slip_viewer.py
│ │ │  p4143
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4144
│ │ │  Rp4145
│ │ │  (dp4146
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/rstbx.simage.explore_completeness
│ │ │ +Vbin/rstbx.simage.create
│ │ │  p4147
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4148
│ │ │  Rp4149
│ │ │  (dp4150
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/simage.explore_completeness.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/simage.create.py
│ │ │  p4151
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4152
│ │ │  Rp4153
│ │ │  (dp4154
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/rstbx.simage.create
│ │ │ +Vbin/rstbx.simage.wx_display
│ │ │  p4155
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4156
│ │ │  Rp4157
│ │ │  (dp4158
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/simage.create.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/rstbx/command_line/simage.wx_display.py
│ │ │  p4159
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4160
│ │ │  Rp4161
│ │ │  (dp4162
│ │ │ @@ -11407,37 +11407,37 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4176
│ │ │  Rp4177
│ │ │  (dp4178
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/wxtbx.xtriage
│ │ │ +Vbin/wxtbx.plan_sad_experiment
│ │ │  p4179
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4180
│ │ │  Rp4181
│ │ │  (dp4182
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/xtriage.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/plan_sad_experiment.py
│ │ │  p4183
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4184
│ │ │  Rp4185
│ │ │  (dp4186
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.xtriage_gui
│ │ │ +Vbin/wxtbx.xtriage
│ │ │  p4187
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4188
│ │ │  Rp4189
│ │ │  (dp4190
│ │ │ @@ -11451,92 +11451,92 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4192
│ │ │  Rp4193
│ │ │  (dp4194
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.wxpython
│ │ │ +Vbin/mmtbx.xtriage_gui
│ │ │  p4195
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4196
│ │ │  Rp4197
│ │ │  (dp4198
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/wxpython.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/xtriage.py
│ │ │  p4199
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4200
│ │ │  Rp4201
│ │ │  (dp4202
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/wxtbx.show_file_info
│ │ │ +Vbin/cctbx.plot_anomalous_scattering
│ │ │  p4203
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4204
│ │ │  Rp4205
│ │ │  (dp4206
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/show_file_info.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/plot_anomalous_scattering.py
│ │ │  p4207
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4208
│ │ │  Rp4209
│ │ │  (dp4210
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.plot_anomalous_scattering
│ │ │ +Vbin/wxtbx.anomalous_differences_histogram
│ │ │  p4211
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4212
│ │ │  Rp4213
│ │ │  (dp4214
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/plot_anomalous_scattering.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/anomalous_differences_histogram.py
│ │ │  p4215
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4216
│ │ │  Rp4217
│ │ │  (dp4218
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/wxtbx.plan_sad_experiment
│ │ │ +Vbin/wxtbx.show_file_info
│ │ │  p4219
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4220
│ │ │  Rp4221
│ │ │  (dp4222
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/plan_sad_experiment.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/show_file_info.py
│ │ │  p4223
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4224
│ │ │  Rp4225
│ │ │  (dp4226
│ │ │ @@ -11561,620 +11561,620 @@
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4232
│ │ │  Rp4233
│ │ │  (dp4234
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/phenix.pdb_editor
│ │ │ +Vbin/cctbx.loggraph
│ │ │  p4235
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4236
│ │ │  Rp4237
│ │ │  (dp4238
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/pdb_editor.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/loggraph.py
│ │ │  p4239
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4240
│ │ │  Rp4241
│ │ │  (dp4242
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cctbx.loggraph
│ │ │ +Vbin/mmtbx.bfactor_plot
│ │ │  p4243
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4244
│ │ │  Rp4245
│ │ │  (dp4246
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/loggraph.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/b_plot.py
│ │ │  p4247
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4248
│ │ │  Rp4249
│ │ │  (dp4250
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/wxtbx.inspect_r_free_flags
│ │ │ +Vbin/phenix.pdb_editor
│ │ │  p4251
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4252
│ │ │  Rp4253
│ │ │  (dp4254
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/inspect_r_free_flags.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/pdb_editor.py
│ │ │  p4255
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4256
│ │ │  Rp4257
│ │ │  (dp4258
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/mmtbx.bfactor_plot
│ │ │ +Vbin/cctbx.wxpython
│ │ │  p4259
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4260
│ │ │  Rp4261
│ │ │  (dp4262
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/b_plot.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/wxpython.py
│ │ │  p4263
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4264
│ │ │  Rp4265
│ │ │  (dp4266
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/wxtbx.anomalous_differences_histogram
│ │ │ +Vbin/wxtbx.inspect_r_free_flags
│ │ │  p4267
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4268
│ │ │  Rp4269
│ │ │  (dp4270
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/anomalous_differences_histogram.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/wxtbx/command_line/inspect_r_free_flags.py
│ │ │  p4271
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4272
│ │ │  Rp4273
│ │ │  (dp4274
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dev.dxtbx.simulate_collection
│ │ │ +Vbin/dxtbx.show_matching_formats
│ │ │  p4275
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4276
│ │ │  Rp4277
│ │ │  (dp4278
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/simulate_collection.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/show_matching_formats.py
│ │ │  p4279
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4280
│ │ │  Rp4281
│ │ │  (dp4282
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.show_registry
│ │ │ +Vbin/dxtbx.overload
│ │ │  p4283
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4284
│ │ │  Rp4285
│ │ │  (dp4286
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/show_registry.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/overload.py
│ │ │  p4287
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4288
│ │ │  Rp4289
│ │ │  (dp4290
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.show_matching_formats
│ │ │ +Vbin/dev.dxtbx.image_availability
│ │ │  p4291
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4292
│ │ │  Rp4293
│ │ │  (dp4294
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/show_matching_formats.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image_availability.py
│ │ │  p4295
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4296
│ │ │  Rp4297
│ │ │  (dp4298
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.show_mask_info
│ │ │ +Vbin/dev.dxtbx.read_sequence
│ │ │  p4299
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4300
│ │ │  Rp4301
│ │ │  (dp4302
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/show_mask_info.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/read_sequence.py
│ │ │  p4303
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4304
│ │ │  Rp4305
│ │ │  (dp4306
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.saturation
│ │ │ +Vbin/dxtbx.detector_superpose
│ │ │  p4307
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4308
│ │ │  Rp4309
│ │ │  (dp4310
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/saturation.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/detector_superpose.py
│ │ │  p4311
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4312
│ │ │  Rp4313
│ │ │  (dp4314
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dev.dxtbx.read_sequence
│ │ │ +Vbin/dxtbx.dlsnxs2cbf
│ │ │  p4315
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4316
│ │ │  Rp4317
│ │ │  (dp4318
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/read_sequence.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/dlsnxs2cbf.py
│ │ │  p4319
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4320
│ │ │  Rp4321
│ │ │  (dp4322
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.radial_average
│ │ │ +Vbin/dxtbx.print_header
│ │ │  p4323
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4324
│ │ │  Rp4325
│ │ │  (dp4326
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/radial_average.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/print_header.py
│ │ │  p4327
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4328
│ │ │  Rp4329
│ │ │  (dp4330
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.print_matching_images
│ │ │ +Vbin/dxtbx.show_mask_info
│ │ │  p4331
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4332
│ │ │  Rp4333
│ │ │  (dp4334
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/print_matching_images.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/show_mask_info.py
│ │ │  p4335
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4336
│ │ │  Rp4337
│ │ │  (dp4338
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.print_header
│ │ │ +Vbin/dxtbx.plot_detector_models
│ │ │  p4339
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4340
│ │ │  Rp4341
│ │ │  (dp4342
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/print_header.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/plot_detector_models.py
│ │ │  p4343
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4344
│ │ │  Rp4345
│ │ │  (dp4346
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.plot_detector_models
│ │ │ +Vbin/dxtbx.print_matching_images
│ │ │  p4347
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4348
│ │ │  Rp4349
│ │ │  (dp4350
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/plot_detector_models.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/print_matching_images.py
│ │ │  p4351
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4352
│ │ │  Rp4353
│ │ │  (dp4354
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.overload
│ │ │ +Vbin/dxtbx.depends_on
│ │ │  p4355
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4356
│ │ │  Rp4357
│ │ │  (dp4358
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/overload.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/depends_on.py
│ │ │  p4359
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4360
│ │ │  Rp4361
│ │ │  (dp4362
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.install_format
│ │ │ +Vbin/dxtbx.show_registry
│ │ │  p4363
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4364
│ │ │  Rp4365
│ │ │  (dp4366
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/install_format.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/show_registry.py
│ │ │  p4367
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4368
│ │ │  Rp4369
│ │ │  (dp4370
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.image_average
│ │ │ +Vbin/dxtbx.saturation
│ │ │  p4371
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4372
│ │ │  Rp4373
│ │ │  (dp4374
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image_average.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/saturation.py
│ │ │  p4375
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4376
│ │ │  Rp4377
│ │ │  (dp4378
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cxi.image_average
│ │ │ +Vbin/dxtbx.any2nexus
│ │ │  p4379
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4380
│ │ │  Rp4381
│ │ │  (dp4382
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image_average.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/any2nexus.py
│ │ │  p4383
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4384
│ │ │  Rp4385
│ │ │  (dp4386
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dev.dxtbx.image_availability
│ │ │ +Vbin/dev.dxtbx.simulate_collection
│ │ │  p4387
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4388
│ │ │  Rp4389
│ │ │  (dp4390
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image_availability.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/simulate_collection.py
│ │ │  p4391
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4392
│ │ │  Rp4393
│ │ │  (dp4394
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.image2pickle
│ │ │ +Vbin/dxtbx.install_format
│ │ │  p4395
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4396
│ │ │  Rp4397
│ │ │  (dp4398
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image2pickle.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/install_format.py
│ │ │  p4399
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4400
│ │ │  Rp4401
│ │ │  (dp4402
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/cxi.image2pickle
│ │ │ +Vbin/dxtbx.display_parallax_correction
│ │ │  p4403
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4404
│ │ │  Rp4405
│ │ │  (dp4406
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image2pickle.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/display_parallax_correction.py
│ │ │  p4407
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4408
│ │ │  Rp4409
│ │ │  (dp4410
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.dlsnxs2cbf
│ │ │ +Vbin/dxtbx.radial_average
│ │ │  p4411
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4412
│ │ │  Rp4413
│ │ │  (dp4414
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/dlsnxs2cbf.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/radial_average.py
│ │ │  p4415
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4416
│ │ │  Rp4417
│ │ │  (dp4418
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.display_parallax_correction
│ │ │ +Vbin/dev.dxtbx.debug_memory
│ │ │  p4419
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4420
│ │ │  Rp4421
│ │ │  (dp4422
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/display_parallax_correction.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/debug_memory.py
│ │ │  p4423
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4424
│ │ │  Rp4425
│ │ │  (dp4426
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.detector_superpose
│ │ │ +Vbin/dxtbx.image2pickle
│ │ │  p4427
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4428
│ │ │  Rp4429
│ │ │  (dp4430
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/detector_superpose.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image2pickle.py
│ │ │  p4431
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4432
│ │ │  Rp4433
│ │ │  (dp4434
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.depends_on
│ │ │ +Vbin/cxi.image2pickle
│ │ │  p4435
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4436
│ │ │  Rp4437
│ │ │  (dp4438
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/depends_on.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image2pickle.py
│ │ │  p4439
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4440
│ │ │  Rp4441
│ │ │  (dp4442
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dev.dxtbx.debug_memory
│ │ │ +Vbin/dxtbx.image_average
│ │ │  p4443
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4444
│ │ │  Rp4445
│ │ │  (dp4446
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/debug_memory.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image_average.py
│ │ │  p4447
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4448
│ │ │  Rp4449
│ │ │  (dp4450
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vbin/dxtbx.any2nexus
│ │ │ +Vbin/cxi.image_average
│ │ │  p4451
│ │ │  sbg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4452
│ │ │  Rp4453
│ │ │  (dp4454
│ │ │  g21
│ │ │  g23
│ │ │  sg26
│ │ │ -Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/any2nexus.py
│ │ │ +Vlib/python3/dist-packages/dxtbx/src/dxtbx/command_line/image_average.py
│ │ │  p4455
│ │ │  sbsg0
│ │ │  (g17
│ │ │  g2
│ │ │  Ntp4456
│ │ │  Rp4457
│ │ │  (dp4458