--- /srv/rebuilderd/tmp/rebuilderdXZ2wOS/inputs/r-bioc-gosemsim_2.38.3+ds-1_amd64.deb +++ /srv/rebuilderd/tmp/rebuilderdXZ2wOS/out/r-bioc-gosemsim_2.38.3+ds-1_amd64.deb ├── file list │ @@ -1,3 +1,3 @@ │ -rw-r--r-- 0 0 0 4 2026-08-11 13:27:42.000000 debian-binary │ --rw-r--r-- 0 0 0 1816 2026-08-11 13:27:42.000000 control.tar.xz │ --rw-r--r-- 0 0 0 1115344 2026-08-11 13:27:42.000000 data.tar.xz │ +-rw-r--r-- 0 0 0 1720 2026-08-11 13:27:42.000000 control.tar.xz │ +-rw-r--r-- 0 0 0 1116568 2026-08-11 13:27:42.000000 data.tar.xz ├── control.tar.xz │ ├── control.tar │ │ ├── file list │ │ │ @@ -1,3 +1,3 @@ │ │ │ drwxr-xr-x 0 root (0) root (0) 0 2026-08-11 13:27:42.000000 ./ │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 1180 2026-08-11 13:27:42.000000 ./control │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 2563 2026-08-11 13:27:42.000000 ./md5sums │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 999 2026-08-11 13:27:42.000000 ./control │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 2479 2026-08-11 13:27:42.000000 ./md5sums │ │ 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important basis for many bioinformatics analysis approaches. │ │ ├── ./md5sums │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │┄ Files differ │ │ │ ├── line order │ │ │ │ @@ -4,15 +4,14 @@ │ │ │ │ usr/lib/R/site-library/GOSemSim/Meta/Rd.rds │ │ │ │ usr/lib/R/site-library/GOSemSim/Meta/data.rds │ │ │ │ usr/lib/R/site-library/GOSemSim/Meta/features.rds │ │ │ │ usr/lib/R/site-library/GOSemSim/Meta/hsearch.rds │ │ │ │ usr/lib/R/site-library/GOSemSim/Meta/links.rds │ │ │ │ usr/lib/R/site-library/GOSemSim/Meta/nsInfo.rds │ │ │ │ usr/lib/R/site-library/GOSemSim/Meta/package.rds │ │ │ │ -usr/lib/R/site-library/GOSemSim/Meta/vignette.rds │ │ │ │ usr/lib/R/site-library/GOSemSim/NAMESPACE │ │ │ │ usr/lib/R/site-library/GOSemSim/NEWS │ │ │ │ usr/lib/R/site-library/GOSemSim/NEWS.md │ │ │ │ usr/lib/R/site-library/GOSemSim/R/GOSemSim │ │ │ │ usr/lib/R/site-library/GOSemSim/R/GOSemSim.rdb │ │ │ │ usr/lib/R/site-library/GOSemSim/R/GOSemSim.rdx │ │ │ │ usr/lib/R/site-library/GOSemSim/data/gotbl.rda ├── data.tar.xz │ ├── 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Vignettes from package 'GOSemSim'

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Other files in the doc directory

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GOSemSim::GOSemSimGOSemSimHTMLsourceR code
GOSemSim.R
GOSemSim.Rmd
GOSemSim.html
│ │ │ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ @@ -1,5 +1,9 @@ │ │ │ │ ************ VViiggnneetttteess aanndd ootthheerr ddooccuummeennttaattiioonn[[[[RR llooggoo]]]] ************ │ │ │ │ =============================================================================== │ │ │ │ _[_[_U_p_]_]_[_[_T_o_p_]_] │ │ │ │ ********** VViiggnneetttteess ffrroomm ppaacckkaaggee ''GGOOSSeemmSSiimm'' ********** │ │ │ │ -_G_O_S_e_m_S_i_m_:_:_G_O_S_e_m_S_i_m GOSemSim _H_T_M_L _s_o_u_r_c_e _R_ _c_o_d_e │ │ │ │ +The package contains no vignette meta-information. │ │ │ │ +********** OOtthheerr ffiilleess iinn tthhee ddoocc ddiirreeccttoorryy ********** │ │ │ │ + _G_O_S_e_m_S_i_m_._R │ │ │ │ + _G_O_S_e_m_S_i_m_._R_m_d │ │ │ │ + _G_O_S_e_m_S_i_m_._h_t_m_l │ │ ├── ./usr/lib/R/site-library/GOSemSim/help/GOSemSim.rdb │ │ │ ├── Rscript --vanilla - {} │ │ │ │ @@ -34,15 +34,15 @@ │ │ │ │ structure(list(structure("\n", Rd_tag = "TEXT"), structure(" ", Rd_tag = "TEXT"), │ │ │ │ structure(list(), Rd_tag = "\\item"), structure(" ", Rd_tag = "TEXT"), │ │ │ │ structure(list(structure("https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book/", Rd_tag = "VERB")), Rd_tag = "\\url"), │ │ │ │ structure("\n", Rd_tag = "TEXT"), structure(" ", Rd_tag = "TEXT"), │ │ │ │ structure(list(), Rd_tag = "\\item"), structure(" Report bugs at ", Rd_tag = "TEXT"), │ │ │ │ structure(list(structure("https://github.com/YuLab-SMU/GOSemSim/issues", Rd_tag = "VERB")), Rd_tag = "\\url"), │ │ │ │ structure("\n", Rd_tag = "TEXT")), Rd_tag = "\\itemize"), │ │ │ │ - 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