--- /srv/rebuilderd/tmp/rebuilderduzysR1/inputs/python3-pysam_0.23.3+ds-2+b1_riscv64.deb +++ /srv/rebuilderd/tmp/rebuilderduzysR1/out/python3-pysam_0.23.3+ds-2+b1_riscv64.deb ├── file list │ @@ -1,3 +1,3 @@ │ -rw-r--r-- 0 0 0 4 2025-12-07 20:52:32.000000 debian-binary │ -rw-r--r-- 0 0 0 9640 2025-12-07 20:52:32.000000 control.tar.xz │ --rw-r--r-- 0 0 0 4787596 2025-12-07 20:52:32.000000 data.tar.xz │ +-rw-r--r-- 0 0 0 4785980 2025-12-07 20:52:32.000000 data.tar.xz ├── control.tar.xz │ ├── control.tar │ │ ├── ./md5sums │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │┄ Files differ ├── data.tar.xz │ ├── data.tar │ │ ├── file list │ │ │ @@ -290,15 +290,15 @@ │ │ │ -rwxr-xr-x 0 root (0) root (0) 1537 2025-06-10 10:37:29.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/include/samtools/version.sh │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 3567332 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignedsegment.c │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 573816 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignedsegment.cpython-313-riscv64-linux-gnu.so │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 569720 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignedsegment.cpython-314-riscv64-linux-gnu.so │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 3246 2025-06-10 10:37:29.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignedsegment.pxd │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 8205 2025-06-10 10:37:29.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignedsegment.pyi │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 121060 2025-06-10 10:37:29.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignedsegment.pyx │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 2815055 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignmentfile.c │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 2815052 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignmentfile.c │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 488032 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignmentfile.cpython-313-riscv64-linux-gnu.so │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 488032 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignmentfile.cpython-314-riscv64-linux-gnu.so │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 3558 2025-06-10 10:37:29.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignmentfile.pxd │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 7840 2025-06-10 10:37:29.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignmentfile.pyi │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 104799 2025-06-10 10:37:29.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignmentfile.pyx │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 5322859 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcbcf.c │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 875016 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcbcf.cpython-313-riscv64-linux-gnu.so │ │ │ @@ -338,15 +338,15 @@ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 822 2025-06-10 10:37:29.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcsamfile.pyx │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 270654 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcsamtools.c │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 666712 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcsamtools.cpython-313-riscv64-linux-gnu.so │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 666712 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcsamtools.cpython-314-riscv64-linux-gnu.so │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 301 2025-06-10 10:37:29.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcsamtools.pxd │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 31 2025-06-10 10:37:29.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcsamtools.pyi │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 28 2025-06-10 10:37:29.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcsamtools.pyx │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 1636490 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libctabix.c │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 1636487 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libctabix.c │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 275384 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libctabix.cpython-313-riscv64-linux-gnu.so │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 275384 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libctabix.cpython-314-riscv64-linux-gnu.so │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 2679 2025-06-10 10:37:29.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libctabix.pxd │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 3153 2025-06-10 10:37:29.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libctabix.pyi │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 42550 2025-06-10 10:37:29.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libctabix.pyx │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 1460462 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libctabixproxies.c │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 230072 2025-12-07 20:52:32.000000 ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libctabixproxies.cpython-313-riscv64-linux-gnu.so │ │ ├── ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignedsegment.c │ │ │ @@ -65736,15 +65736,15 @@ │ │ │ (void)__Pyx_modinit_variable_export_code(__pyx_mstate); │ │ │ if (unlikely((__Pyx_modinit_function_export_code(__pyx_mstate) < 0))) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ if (unlikely((__Pyx_modinit_type_init_code(__pyx_mstate) < 0))) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ if (unlikely((__Pyx_modinit_type_import_code(__pyx_mstate) < 0))) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ (void)__Pyx_modinit_variable_import_code(__pyx_mstate); │ │ │ if (unlikely((__Pyx_modinit_function_import_code(__pyx_mstate) < 0))) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ /*--- Execution code ---*/ │ │ │ - __Pyx_TraceStartFunc("PyInit_libcalignedsegment", __pyx_f[0], 1, 3, 0, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ + __Pyx_TraceStartFunc("PyInit_libcalignedsegment", __pyx_f[0], 1, 4, 0, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ │ │ │ /* "EnumBase":10 │ │ │ * │ │ │ * cdef object __Pyx_EnumBase │ │ │ * from enum import IntEnum as __Pyx_EnumBase # <<<<<<<<<<<<<< │ │ │ * │ │ │ * cdef object __Pyx_FlagBase │ │ │ @@ -67659,15 +67659,15 @@ │ │ │ * # cython: embedsignature=True │ │ │ * # cython: profile=True │ │ │ */ │ │ │ __pyx_t_19 = __Pyx_PyDict_NewPresized(0); if (unlikely(!__pyx_t_19)) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ __Pyx_GOTREF(__pyx_t_19); │ │ │ if (PyDict_SetItem(__pyx_mstate_global->__pyx_d, __pyx_mstate_global->__pyx_n_u_test, __pyx_t_19) < (0)) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ __Pyx_DECREF(__pyx_t_19); __pyx_t_19 = 0; │ │ │ - __Pyx_TraceReturnValue(Py_None, 3, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ + __Pyx_TraceReturnValue(Py_None, 4, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ __Pyx_PyMonitoring_ExitScope(0); │ │ │ │ │ │ /*--- Wrapped vars code ---*/ │ │ │ │ │ │ goto __pyx_L0; │ │ │ __pyx_L1_error:; │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_2); │ │ │ @@ -67683,15 +67683,15 @@ │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_17); │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_18); │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_19); │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_20); │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_21); │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_22); │ │ │ __Pyx_TraceException(__pyx_lineno, 0, 0); │ │ │ - __Pyx_TraceExceptionUnwind(3, 0); │ │ │ + __Pyx_TraceExceptionUnwind(4, 0); │ │ │ if (__pyx_m) { │ │ │ if (__pyx_mstate->__pyx_d && stringtab_initialized) { │ │ │ __Pyx_AddTraceback("init pysam.libcalignedsegment", __pyx_clineno, __pyx_lineno, __pyx_filename); │ │ │ } │ │ │ #if !CYTHON_USE_MODULE_STATE │ │ │ Py_CLEAR(__pyx_m); │ │ │ #else │ │ ├── ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignedsegment.cpython-313-riscv64-linux-gnu.so │ │ │┄ File has been modified after NT_GNU_BUILD_ID has been applied. │ │ │ ├── readelf --wide --notes {} │ │ │ │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Displaying notes found in: .note.gnu.build-id │ │ │ │ Owner Data size Description │ │ │ │ - GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: 477b23cb110eb8265ad2178f2e8ef0754fddff87 │ │ │ │ + GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: ac48e58f0476610454ae6276b548656cd327d1b2 │ │ │ ├── objdump --line-numbers --disassemble --demangle --reloc --no-show-raw-insn --section=.text {} │ │ │ │ @@ -8384,15 +8384,15 @@ │ │ │ │ jal 19d08 │ │ │ │ sd a0,184(sp) │ │ │ │ bnez a0,144b0 │ │ │ │ j 18fc8 │ │ │ │ mv a1,a0 │ │ │ │ li a3,0 │ │ │ │ mv a0,s0 │ │ │ │ - li a2,3 │ │ │ │ + li a2,4 │ │ │ │ jal 1aad0 │ │ │ │ li a5,-1 │ │ │ │ bne a0,a5,144c6 │ │ │ │ j 15ede │ │ │ │ auipc s0,0x78 │ │ │ │ addi s0,s0,1938 │ │ │ │ ld a1,-864(s0) │ │ │ │ @@ -8460,15 +8460,15 @@ │ │ │ │ mv a2,s10 │ │ │ │ addi a0,sp,280 │ │ │ │ jal ebfc │ │ │ │ ld a5,192(sp) │ │ │ │ lbu a4,276(sp) │ │ │ │ beqz a4,14594 │ │ │ │ ld a1,184(sp) │ │ │ │ - li a2,3 │ │ │ │ + li a2,4 │ │ │ │ addi a0,sp,276 │ │ │ │ sd a5,192(sp) │ │ │ │ jal ebf0 │ │ │ │ ld a5,192(sp) │ │ │ │ auipc a4,0x77 │ │ │ │ ld a4,1036(a4) │ │ │ │ beqz a4,145e2 │ │ │ │ @@ -13506,15 +13506,15 @@ │ │ │ │ jal d1c0 │ │ │ │ ld a0,184(sp) │ │ │ │ jal 1a8b6 │ │ │ │ j 145fe │ │ │ │ ld a1,184(sp) │ │ │ │ auipc a3,0x70 │ │ │ │ ld a3,210(a3) │ │ │ │ - li a2,3 │ │ │ │ + li a2,4 │ │ │ │ addi a0,sp,274 │ │ │ │ jal d730 <_PyMonitoring_FirePyReturnEvent@plt> │ │ │ │ li a5,-1 │ │ │ │ bne a0,a5,17e66 │ │ │ │ li s10,1 │ │ │ │ mv a5,s10 │ │ │ │ li t0,0 │ │ │ ├── readelf --wide --decompress --hex-dump=.gnu_debuglink {} │ │ │ │ @@ -1,7 +1,7 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Hex dump of section '.gnu_debuglink': │ │ │ │ - 0x00000000 37623233 63623131 30656238 32363561 7b23cb110eb8265a │ │ │ │ - 0x00000010 64323137 38663265 38656630 37353466 d2178f2e8ef0754f │ │ │ │ - 0x00000020 64646666 38372e64 65627567 00000000 ddff87.debug.... │ │ │ │ - 0x00000030 4658ca88 FX.. │ │ │ │ + 0x00000000 34386535 38663034 37363631 30343534 48e58f0476610454 │ │ │ │ + 0x00000010 61653632 37366235 34383635 36636433 ae6276b548656cd3 │ │ │ │ + 0x00000020 32376431 62322e64 65627567 00000000 27d1b2.debug.... │ │ │ │ + 0x00000030 d16c2f45 .l/E │ │ ├── ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignedsegment.cpython-314-riscv64-linux-gnu.so │ │ │┄ File has been modified after NT_GNU_BUILD_ID has been applied. │ │ │ ├── readelf --wide --notes {} │ │ │ │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Displaying notes found in: .note.gnu.build-id │ │ │ │ Owner Data size Description │ │ │ │ - GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: 5ccbbee260a5c658b6ae08cdac5ff1db8622c394 │ │ │ │ + GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: b0cc537adbce318ff16c6ed5d148d63262a52e9e │ │ │ ├── objdump --line-numbers --disassemble --demangle --reloc --no-show-raw-insn --section=.text {} │ │ │ │ @@ -8375,15 +8375,15 @@ │ │ │ │ jal 19bba │ │ │ │ sd a0,184(sp) │ │ │ │ bnez a0,144cc │ │ │ │ j 18dde │ │ │ │ mv a1,a0 │ │ │ │ li a3,0 │ │ │ │ mv a0,s0 │ │ │ │ - li a2,3 │ │ │ │ + li a2,4 │ │ │ │ jal 1a956 │ │ │ │ li a5,-1 │ │ │ │ bne a0,a5,144e2 │ │ │ │ j 15daa │ │ │ │ auipc s0,0x77 │ │ │ │ addi s0,s0,1918 │ │ │ │ ld a1,-864(s0) │ │ │ │ @@ -8451,15 +8451,15 @@ │ │ │ │ mv a2,s10 │ │ │ │ addi a0,sp,280 │ │ │ │ jal ec28 │ │ │ │ ld a5,192(sp) │ │ │ │ lbu a4,276(sp) │ │ │ │ beqz a4,145b0 │ │ │ │ ld a1,184(sp) │ │ │ │ - li a2,3 │ │ │ │ + li a2,4 │ │ │ │ addi a0,sp,276 │ │ │ │ sd a5,192(sp) │ │ │ │ jal ec1c │ │ │ │ ld a5,192(sp) │ │ │ │ auipc a4,0x76 │ │ │ │ ld a4,936(a4) │ │ │ │ beqz a4,145fa │ │ │ │ @@ -13349,15 +13349,15 @@ │ │ │ │ jal d1c0 │ │ │ │ ld a0,184(sp) │ │ │ │ jal 1a498 │ │ │ │ j 14616 │ │ │ │ ld a1,184(sp) │ │ │ │ auipc a3,0x6f │ │ │ │ ld a3,700(a3) │ │ │ │ - li a2,3 │ │ │ │ + li a2,4 │ │ │ │ addi a0,sp,274 │ │ │ │ jal d730 <_PyMonitoring_FirePyReturnEvent@plt> │ │ │ │ li a5,-1 │ │ │ │ bne a0,a5,17c7c │ │ │ │ li s10,1 │ │ │ │ mv a5,s10 │ │ │ │ li t0,0 │ │ │ ├── readelf --wide --decompress --hex-dump=.gnu_debuglink {} │ │ │ │ @@ -1,7 +1,7 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Hex dump of section '.gnu_debuglink': │ │ │ │ - 0x00000000 63626265 65323630 61356336 35386236 cbbee260a5c658b6 │ │ │ │ - 0x00000010 61653038 63646163 35666631 64623836 ae08cdac5ff1db86 │ │ │ │ - 0x00000020 32326333 39342e64 65627567 00000000 22c394.debug.... │ │ │ │ - 0x00000030 9a755552 .uUR │ │ │ │ + 0x00000000 63633533 37616462 63653331 38666631 cc537adbce318ff1 │ │ │ │ + 0x00000010 36633665 64356431 34386436 33323632 6c6ed5d148d63262 │ │ │ │ + 0x00000020 61353265 39652e64 65627567 00000000 a52e9e.debug.... │ │ │ │ + 0x00000030 6c642149 ld!I │ │ ├── ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignmentfile.c │ │ │ @@ -48619,15 +48619,15 @@ │ │ │ (void)__Pyx_modinit_variable_export_code(__pyx_mstate); │ │ │ (void)__Pyx_modinit_function_export_code(__pyx_mstate); │ │ │ if (unlikely((__Pyx_modinit_type_init_code(__pyx_mstate) < 0))) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ if (unlikely((__Pyx_modinit_type_import_code(__pyx_mstate) < 0))) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ (void)__Pyx_modinit_variable_import_code(__pyx_mstate); │ │ │ if (unlikely((__Pyx_modinit_function_import_code(__pyx_mstate) < 0))) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ /*--- Execution code ---*/ │ │ │ - __Pyx_TraceStartFunc("PyInit_libcalignmentfile", __pyx_f[0], 1, 10, 0, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ + __Pyx_TraceStartFunc("PyInit_libcalignmentfile", __pyx_f[0], 1, 3, 0, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ │ │ │ /* "pysam/libcalignmentfile.pyx":58 │ │ │ * # │ │ │ * ######################################################## │ │ │ * import os # <<<<<<<<<<<<<< │ │ │ * import collections │ │ │ * try: │ │ │ @@ -50071,28 +50071,28 @@ │ │ │ * # cython: profile=True │ │ │ * ######################################################## │ │ │ */ │ │ │ __pyx_t_2 = __Pyx_PyDict_NewPresized(0); if (unlikely(!__pyx_t_2)) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ __Pyx_GOTREF(__pyx_t_2); │ │ │ if (PyDict_SetItem(__pyx_mstate_global->__pyx_d, __pyx_mstate_global->__pyx_n_u_test, __pyx_t_2) < (0)) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ __Pyx_DECREF(__pyx_t_2); __pyx_t_2 = 0; │ │ │ - __Pyx_TraceReturnValue(Py_None, 10, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ + __Pyx_TraceReturnValue(Py_None, 3, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ __Pyx_PyMonitoring_ExitScope(0); │ │ │ │ │ │ /*--- Wrapped vars code ---*/ │ │ │ │ │ │ goto __pyx_L0; │ │ │ __pyx_L1_error:; │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_2); │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_5); │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_7); │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_8); │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_9); │ │ │ __Pyx_TraceException(__pyx_lineno, 0, 0); │ │ │ - __Pyx_TraceExceptionUnwind(10, 0); │ │ │ + __Pyx_TraceExceptionUnwind(3, 0); │ │ │ if (__pyx_m) { │ │ │ if (__pyx_mstate->__pyx_d && stringtab_initialized) { │ │ │ __Pyx_AddTraceback("init pysam.libcalignmentfile", __pyx_clineno, __pyx_lineno, __pyx_filename); │ │ │ } │ │ │ #if !CYTHON_USE_MODULE_STATE │ │ │ Py_CLEAR(__pyx_m); │ │ │ #else │ │ ├── ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignmentfile.cpython-313-riscv64-linux-gnu.so │ │ │┄ File has been modified after NT_GNU_BUILD_ID has been applied. │ │ │ ├── readelf --wide --notes {} │ │ │ │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Displaying notes found in: .note.gnu.build-id │ │ │ │ Owner Data size Description │ │ │ │ - GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: 5198f99748a9fcb5d679db9f04d9316187b760e2 │ │ │ │ + GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: 560d8a08bf97978c47d94c870465c79cbb9a25ea │ │ │ ├── objdump --line-numbers --disassemble --demangle --reloc --no-show-raw-insn --section=.text {} │ │ │ │ @@ -7261,15 +7261,15 @@ │ │ │ │ auipc a0,0x46 │ │ │ │ addi a0,a0,-736 │ │ │ │ jal d3e0 │ │ │ │ mv s0,a0 │ │ │ │ beqz a0,12b08 │ │ │ │ addi a0,sp,64 │ │ │ │ li a3,0 │ │ │ │ - li a2,10 │ │ │ │ + li a2,3 │ │ │ │ mv a1,s0 │ │ │ │ jal db32 │ │ │ │ mv s3,s0 │ │ │ │ bne a0,s8,12c50 │ │ │ │ j 1542c │ │ │ │ j 12c54 │ │ │ │ li s3,0 │ │ │ │ @@ -10506,15 +10506,15 @@ │ │ │ │ bnez a5,153fa │ │ │ │ jal ca00 │ │ │ │ mv a0,s3 │ │ │ │ jal 16da6 │ │ │ │ j 1634e │ │ │ │ auipc a3,0x5e │ │ │ │ ld a3,-1186(a3) │ │ │ │ - li a2,10 │ │ │ │ + li a2,3 │ │ │ │ mv a1,s3 │ │ │ │ addi a0,sp,66 │ │ │ │ jal cf70 <_PyMonitoring_FirePyReturnEvent@plt> │ │ │ │ li a5,-1 │ │ │ │ beq a0,a5,153aa │ │ │ │ j 153ec │ │ │ │ li s0,0 │ │ │ │ @@ -11830,15 +11830,15 @@ │ │ │ │ mv a2,s1 │ │ │ │ mv a1,s3 │ │ │ │ addi a0,sp,72 │ │ │ │ jal 16f5e │ │ │ │ lbu a5,68(sp) │ │ │ │ beqz a5,162ee │ │ │ │ mv a1,s3 │ │ │ │ - li a2,10 │ │ │ │ + li a2,3 │ │ │ │ addi a0,sp,68 │ │ │ │ jal e74e │ │ │ │ ld a5,32(s4) │ │ │ │ beqz a5,16332 │ │ │ │ ld a5,0(s2) │ │ │ │ beqz a5,1630e │ │ │ │ beqz s9,1630e │ │ │ ├── readelf --wide --decompress --hex-dump=.gnu_debuglink {} │ │ │ │ @@ -1,7 +1,7 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Hex dump of section '.gnu_debuglink': │ │ │ │ - 0x00000000 39386639 39373438 61396663 62356436 98f99748a9fcb5d6 │ │ │ │ - 0x00000010 37396462 39663034 64393331 36313837 79db9f04d9316187 │ │ │ │ - 0x00000020 62373630 65322e64 65627567 00000000 b760e2.debug.... │ │ │ │ - 0x00000030 36e441b4 6.A. │ │ │ │ + 0x00000000 30643861 30386266 39373937 38633437 0d8a08bf97978c47 │ │ │ │ + 0x00000010 64393463 38373034 36356337 39636262 d94c870465c79cbb │ │ │ │ + 0x00000020 39613235 65612e64 65627567 00000000 9a25ea.debug.... │ │ │ │ + 0x00000030 2e010611 .... │ │ ├── ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcalignmentfile.cpython-314-riscv64-linux-gnu.so │ │ │┄ File has been modified after NT_GNU_BUILD_ID has been applied. │ │ │ ├── readelf --wide --notes {} │ │ │ │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Displaying notes found in: .note.gnu.build-id │ │ │ │ Owner Data size Description │ │ │ │ - GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: cbda1601df8ca24e94f99d38858b77c4eb5e828d │ │ │ │ + GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: 74df7c46c86cb129188ecd4e60cb50c11ebb185b │ │ │ ├── objdump --line-numbers --disassemble --demangle --reloc --no-show-raw-insn --section=.text {} │ │ │ │ @@ -7255,15 +7255,15 @@ │ │ │ │ auipc a0,0x46 │ │ │ │ addi a0,a0,492 │ │ │ │ jal d3e0 │ │ │ │ mv s8,a0 │ │ │ │ beqz a0,12b08 │ │ │ │ addi a0,sp,64 │ │ │ │ li a3,0 │ │ │ │ - li a2,10 │ │ │ │ + li a2,3 │ │ │ │ mv a1,s8 │ │ │ │ jal db44 │ │ │ │ mv s3,s8 │ │ │ │ bne a0,s0,12c4c │ │ │ │ j 15274 │ │ │ │ j 12c50 │ │ │ │ li s3,0 │ │ │ │ @@ -10388,15 +10388,15 @@ │ │ │ │ bnez a5,15242 │ │ │ │ jal ca00 │ │ │ │ mv a0,s3 │ │ │ │ jal 16c70 │ │ │ │ j 16192 │ │ │ │ auipc a3,0x5f │ │ │ │ ld a3,-746(a3) │ │ │ │ - li a2,10 │ │ │ │ + li a2,3 │ │ │ │ mv a1,s3 │ │ │ │ addi a0,sp,66 │ │ │ │ jal cf70 <_PyMonitoring_FirePyReturnEvent@plt> │ │ │ │ li a5,-1 │ │ │ │ beq a0,a5,151f6 │ │ │ │ j 15234 │ │ │ │ li s0,0 │ │ │ │ @@ -11712,15 +11712,15 @@ │ │ │ │ mv a2,s1 │ │ │ │ mv a1,s3 │ │ │ │ addi a0,sp,72 │ │ │ │ jal 16e26 │ │ │ │ lbu a5,68(sp) │ │ │ │ beqz a5,16136 │ │ │ │ mv a1,s3 │ │ │ │ - li a2,10 │ │ │ │ + li a2,3 │ │ │ │ addi a0,sp,68 │ │ │ │ jal e770 │ │ │ │ ld a5,32(s4) │ │ │ │ beqz a5,16176 │ │ │ │ ld a5,0(s2) │ │ │ │ beqz a5,16156 │ │ │ │ beqz s9,16156 │ │ │ ├── readelf --wide --decompress --hex-dump=.gnu_debuglink {} │ │ │ │ @@ -1,7 +1,7 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Hex dump of section '.gnu_debuglink': │ │ │ │ - 0x00000000 64613136 30316466 38636132 34653934 da1601df8ca24e94 │ │ │ │ - 0x00000010 66393964 33383835 38623737 63346562 f99d38858b77c4eb │ │ │ │ - 0x00000020 35653832 38642e64 65627567 00000000 5e828d.debug.... │ │ │ │ - 0x00000030 33be40c2 3.@. │ │ │ │ + 0x00000000 64663763 34366338 36636231 32393138 df7c46c86cb12918 │ │ │ │ + 0x00000010 38656364 34653630 63623530 63313165 8ecd4e60cb50c11e │ │ │ │ + 0x00000020 62623138 35622e64 65627567 00000000 bb185b.debug.... │ │ │ │ + 0x00000030 eec0fdba .... │ │ ├── ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcbcf.c │ │ │ @@ -106378,15 +106378,15 @@ │ │ │ (void)__Pyx_modinit_variable_export_code(__pyx_mstate); │ │ │ (void)__Pyx_modinit_function_export_code(__pyx_mstate); │ │ │ if (unlikely((__Pyx_modinit_type_init_code(__pyx_mstate) < 0))) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ if (unlikely((__Pyx_modinit_type_import_code(__pyx_mstate) < 0))) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ (void)__Pyx_modinit_variable_import_code(__pyx_mstate); │ │ │ if (unlikely((__Pyx_modinit_function_import_code(__pyx_mstate) < 0))) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ /*--- Execution code ---*/ │ │ │ - __Pyx_TraceStartFunc("PyInit_libcbcf", __pyx_f[0], 1, 15, 0, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ + __Pyx_TraceStartFunc("PyInit_libcbcf", __pyx_f[0], 1, 20, 0, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ │ │ │ /* "pysam/libcbcf.pyx":85 │ │ │ * from __future__ import division, print_function │ │ │ * │ │ │ * import os # <<<<<<<<<<<<<< │ │ │ * import sys │ │ │ * │ │ │ @@ -108584,26 +108584,26 @@ │ │ │ * # cython: embedsignature=True │ │ │ * # cython: profile=True │ │ │ */ │ │ │ __pyx_t_4 = __Pyx_PyDict_NewPresized(0); if (unlikely(!__pyx_t_4)) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ __Pyx_GOTREF(__pyx_t_4); │ │ │ if (PyDict_SetItem(__pyx_mstate_global->__pyx_d, __pyx_mstate_global->__pyx_n_u_test, __pyx_t_4) < (0)) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ __Pyx_DECREF(__pyx_t_4); __pyx_t_4 = 0; │ │ │ - __Pyx_TraceReturnValue(Py_None, 15, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ + __Pyx_TraceReturnValue(Py_None, 20, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ __Pyx_PyMonitoring_ExitScope(0); │ │ │ │ │ │ /*--- Wrapped vars code ---*/ │ │ │ │ │ │ goto __pyx_L0; │ │ │ __pyx_L1_error:; │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_2); │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_3); │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_4); │ │ │ __Pyx_TraceException(__pyx_lineno, 0, 0); │ │ │ - __Pyx_TraceExceptionUnwind(15, 0); │ │ │ + __Pyx_TraceExceptionUnwind(20, 0); │ │ │ if (__pyx_m) { │ │ │ if (__pyx_mstate->__pyx_d && stringtab_initialized) { │ │ │ __Pyx_AddTraceback("init pysam.libcbcf", __pyx_clineno, __pyx_lineno, __pyx_filename); │ │ │ } │ │ │ #if !CYTHON_USE_MODULE_STATE │ │ │ Py_CLEAR(__pyx_m); │ │ │ #else │ │ ├── ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcbcf.cpython-313-riscv64-linux-gnu.so │ │ │┄ File has been modified after NT_GNU_BUILD_ID has been applied. │ │ │ ├── readelf --wide 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--hex-dump=.gnu_debuglink {} │ │ │ │ @@ -1,7 +1,7 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Hex dump of section '.gnu_debuglink': │ │ │ │ - 0x00000000 39643337 30306461 39653766 30393333 9d3700da9e7f0933 │ │ │ │ - 0x00000010 34646535 66316533 33326462 65306361 4de5f1e332dbe0ca │ │ │ │ - 0x00000020 33653730 33632e64 65627567 00000000 3e703c.debug.... │ │ │ │ - 0x00000030 df563b10 .V;. │ │ │ │ + 0x00000000 63646337 63356532 64306234 37373263 cdc7c5e2d0b4772c │ │ │ │ + 0x00000010 63363064 30323531 61313130 62623330 c60d0251a110bb30 │ │ │ │ + 0x00000020 30366161 65642e64 65627567 00000000 06aaed.debug.... │ │ │ │ + 0x00000030 9571923c .q.< │ │ ├── ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcbcftools.c │ │ │ @@ -35,71 +35,71 @@ │ │ │ "/build/reproducible-path/python-pysam-0.23.3+ds/.pybuild/cpython3_3.14_pysam/build/pysam", │ │ │ "/build/reproducible-path/python-pysam-0.23.3+ds/.pybuild/cpython3_3.14_pysam/build/pysam", │ │ │ "/build/reproducible-path/python-pysam-0.23.3+ds/.pybuild/cpython3_3.14_pysam/build/pysam" │ │ │ ], │ │ │ "name": "pysam.libcbcftools", │ │ │ "sources": [ │ │ │ "pysam/libcbcftools.pyx", │ │ │ + "bcftools/vcfisec.c.pysam.c", │ │ │ "bcftools/version.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/vcmp.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/vcfview.c.pysam.c", │ │ │ "bcftools/vcfstats.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/vcfsort.c.pysam.c", │ │ │ "bcftools/vcfsom.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/vcfroh.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/vcfquery.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/vcfplugin.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/vcfnorm.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/vcfmerge.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/vcfisec.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/vcfindex.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/vcfhead.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/vcfgtcheck.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/vcffilter.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/vcfconvert.c.pysam.c", │ │ │ "bcftools/vcfconcat.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/vcfcnv.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/vcfcall.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/vcfbuf.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/HMM.c.pysam.c", │ │ │ "bcftools/vcfannotate.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/tsv2vcf.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/tabix.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/bam2bcf_indel.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/main.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/prob1.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/extsort.c.pysam.c", │ │ │ "bcftools/str_finder.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/smpl_ilist.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/vcfsort.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/vcfconvert.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/kmin.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/vcfnorm.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/convert.c.pysam.c", │ │ │ "bcftools/reheader.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/regidx.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/vcmp.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/ccall.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/tabix.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/edlib.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/em.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/smpl_ilist.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/vcfroh.c.pysam.c", │ │ │ "bcftools/read_consensus.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/prob1.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/ploidy.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/mpileup.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/mcall.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/main.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/kmin.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/bam2bcf_edlib.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/bam_sample.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/bam2bcf.c.pysam.c", │ │ │ "bcftools/hclust.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/bcftools.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/bam2bcf_iaux.c.pysam.c", │ │ │ "bcftools/gvcf.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/mcall.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/vcfquery.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/cols.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/vcfcnv.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/consensus.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/abuf.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/vcfmerge.c.pysam.c", │ │ │ "bcftools/gff.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/filter.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/extsort.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/em.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/edlib.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/vcfview.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/mpileup.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/vcfgtcheck.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/vcfbuf.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/vcfplugin.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/ploidy.c.pysam.c", │ │ │ "bcftools/dist.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/csq.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/convert.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/consensus.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/cols.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/ccall.c.pysam.c", │ │ │ "bcftools/bin.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/bcftools.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/bam_sample.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/bam2bcf_indel.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/bam2bcf_iaux.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/bam2bcf_edlib.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/bam2bcf.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/abuf.c.pysam.c", │ │ │ - "bcftools/HMM.c.pysam.c" │ │ │ + "bcftools/regidx.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/vcfindex.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/vcfcall.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/vcffilter.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/filter.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/tsv2vcf.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/vcfhead.c.pysam.c", │ │ │ + "bcftools/csq.c.pysam.c" │ │ │ ] │ │ │ }, │ │ │ "module_name": "pysam.libcbcftools" │ │ │ } │ │ │ END: Cython Metadata */ │ │ │ │ │ │ #ifndef PY_SSIZE_T_CLEAN │ │ ├── ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcfaidx.c │ │ │ @@ -18627,15 +18627,15 @@ │ │ │ (void)__Pyx_modinit_variable_export_code(__pyx_mstate); │ │ │ (void)__Pyx_modinit_function_export_code(__pyx_mstate); │ │ │ if (unlikely((__Pyx_modinit_type_init_code(__pyx_mstate) < 0))) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ if (unlikely((__Pyx_modinit_type_import_code(__pyx_mstate) < 0))) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ (void)__Pyx_modinit_variable_import_code(__pyx_mstate); │ │ │ if (unlikely((__Pyx_modinit_function_import_code(__pyx_mstate) < 0))) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ /*--- Execution code ---*/ │ │ │ - __Pyx_TraceStartFunc("PyInit_libcfaidx", __pyx_f[0], 1, 0, 0, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ + __Pyx_TraceStartFunc("PyInit_libcfaidx", __pyx_f[0], 1, 2, 0, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ │ │ │ /* "pysam/libcfaidx.pyx":48 │ │ │ * # │ │ │ * ############################################################################### │ │ │ * import sys # <<<<<<<<<<<<<< │ │ │ * import os │ │ │ * import re │ │ │ @@ -19056,24 +19056,24 @@ │ │ │ * # cython: profile=True │ │ │ * ############################################################################### │ │ │ */ │ │ │ __pyx_t_2 = __Pyx_PyDict_NewPresized(0); if (unlikely(!__pyx_t_2)) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ __Pyx_GOTREF(__pyx_t_2); │ │ │ if (PyDict_SetItem(__pyx_mstate_global->__pyx_d, __pyx_mstate_global->__pyx_n_u_test, __pyx_t_2) < (0)) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ __Pyx_DECREF(__pyx_t_2); __pyx_t_2 = 0; │ │ │ - __Pyx_TraceReturnValue(Py_None, 0, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ + __Pyx_TraceReturnValue(Py_None, 2, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ __Pyx_PyMonitoring_ExitScope(0); │ │ │ │ │ │ /*--- Wrapped vars code ---*/ │ │ │ │ │ │ goto __pyx_L0; │ │ │ __pyx_L1_error:; │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_2); │ │ │ __Pyx_TraceException(__pyx_lineno, 0, 0); │ │ │ - __Pyx_TraceExceptionUnwind(0, 0); │ │ │ + __Pyx_TraceExceptionUnwind(2, 0); │ │ │ if (__pyx_m) { │ │ │ if (__pyx_mstate->__pyx_d && stringtab_initialized) { │ │ │ __Pyx_AddTraceback("init pysam.libcfaidx", __pyx_clineno, __pyx_lineno, __pyx_filename); │ │ │ } │ │ │ #if !CYTHON_USE_MODULE_STATE │ │ │ Py_CLEAR(__pyx_m); │ │ │ #else │ │ ├── ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcfaidx.cpython-313-riscv64-linux-gnu.so │ │ │┄ File has been modified after NT_GNU_BUILD_ID has been applied. │ │ │ ├── readelf --wide --notes {} │ │ │ │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Displaying notes found in: .note.gnu.build-id │ │ │ │ Owner Data size Description │ │ │ │ - GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: e17784f8bc630eb370669c7f7638775c161cdb7f │ │ │ │ + GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: 1b29cda3e86119b09d504a4e9bcfd84a60d79e78 │ │ │ ├── objdump --line-numbers --disassemble --demangle --reloc --no-show-raw-insn --section=.text {} │ │ │ │ @@ -4504,15 +4504,15 @@ │ │ │ │ mv a2,s0 │ │ │ │ mv a1,s7 │ │ │ │ addi a0,sp,40 │ │ │ │ jal 7200 <_PyMonitoring_FireRaiseEvent@plt> │ │ │ │ lbu a5,36(sp) │ │ │ │ beqz a5,b086 │ │ │ │ mv a1,s7 │ │ │ │ - li a2,0 │ │ │ │ + li a2,2 │ │ │ │ addi a0,sp,36 │ │ │ │ jal 75f0 <_PyMonitoring_FirePyUnwindEvent@plt> │ │ │ │ ld a5,16(s5) │ │ │ │ beqz a5,b0c8 │ │ │ │ ld a5,0(s4) │ │ │ │ beqz a5,b0a4 │ │ │ │ beqz s1,b0a4 │ │ │ │ @@ -4611,15 +4611,15 @@ │ │ │ │ add a5,a5,s1 │ │ │ │ sd a5,0(s0) │ │ │ │ bnez a5,a68c │ │ │ │ mv a0,s0 │ │ │ │ jal 7060 <_Py_Dealloc@plt> │ │ │ │ j a68c │ │ │ │ mv a0,s0 │ │ │ │ - li a2,0 │ │ │ │ + li a2,2 │ │ │ │ mv a1,s7 │ │ │ │ jal 7160 <_PyMonitoring_FirePyStartEvent@plt> │ │ │ │ bne a0,s1,a6ea │ │ │ │ j b888 │ │ │ │ addi a5,a5,-1 │ │ │ │ sd a5,0(s0) │ │ │ │ bnez a5,a71c │ │ │ │ @@ -4840,15 +4840,15 @@ │ │ │ │ sd a5,0(s2) │ │ │ │ bnez a5,b022 │ │ │ │ mv a0,s2 │ │ │ │ jal 7060 <_Py_Dealloc@plt> │ │ │ │ j b022 │ │ │ │ auipc a3,0x21 │ │ │ │ ld a3,-1308(a3) │ │ │ │ - li a2,0 │ │ │ │ + li a2,2 │ │ │ │ mv a1,s7 │ │ │ │ addi a0,sp,34 │ │ │ │ jal 75d0 <_PyMonitoring_FirePyReturnEvent@plt> │ │ │ │ li a5,-1 │ │ │ │ beq a0,a5,b888 │ │ │ │ j b02a │ │ │ │ li s3,0 │ │ │ ├── readelf --wide --decompress --hex-dump=.gnu_debuglink {} │ │ │ │ @@ -1,7 +1,7 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Hex dump of section '.gnu_debuglink': │ │ │ │ - 0x00000000 37373834 66386263 36333065 62333730 7784f8bc630eb370 │ │ │ │ - 0x00000010 36363963 37663736 33383737 35633136 669c7f7638775c16 │ │ │ │ - 0x00000020 31636462 37662e64 65627567 00000000 1cdb7f.debug.... │ │ │ │ - 0x00000030 3f00f1bc ?... │ │ │ │ + 0x00000000 32396364 61336538 36313139 62303964 29cda3e86119b09d │ │ │ │ + 0x00000010 35303461 34653962 63666438 34613630 504a4e9bcfd84a60 │ │ │ │ + 0x00000020 64373965 37382e64 65627567 00000000 d79e78.debug.... │ │ │ │ + 0x00000030 71b74477 q.Dw │ │ ├── ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcfaidx.cpython-314-riscv64-linux-gnu.so │ │ │┄ File has been modified after NT_GNU_BUILD_ID has been applied. │ │ │ ├── readelf --wide --notes {} │ │ │ │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Displaying notes found in: .note.gnu.build-id │ │ │ │ Owner Data size Description │ │ │ │ - GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: 7a4668503d7fbbabfd92a641da84ff2f8b7590b4 │ │ │ │ + GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: 8f4a55c790d74934912584299c5014d071df84e5 │ │ │ ├── objdump --line-numbers --disassemble --demangle --reloc --no-show-raw-insn --section=.text {} │ │ │ │ @@ -4467,15 +4467,15 @@ │ │ │ │ mv a2,s0 │ │ │ │ mv a1,s7 │ │ │ │ addi a0,sp,40 │ │ │ │ jal 7200 <_PyMonitoring_FireRaiseEvent@plt> │ │ │ │ lbu a5,36(sp) │ │ │ │ beqz a5,b00c │ │ │ │ mv a1,s7 │ │ │ │ - li a2,0 │ │ │ │ + li a2,2 │ │ │ │ addi a0,sp,36 │ │ │ │ jal 75f0 <_PyMonitoring_FirePyUnwindEvent@plt> │ │ │ │ ld a5,16(s5) │ │ │ │ beqz a5,b04a │ │ │ │ ld a5,0(s4) │ │ │ │ beqz a5,b02a │ │ │ │ beqz s1,b02a │ │ │ │ @@ -4573,15 +4573,15 @@ │ │ │ │ addiw a5,a5,-1 │ │ │ │ sw a5,0(s0) │ │ │ │ bnez a5,a682 │ │ │ │ mv a0,s0 │ │ │ │ jal 7060 <_Py_Dealloc@plt> │ │ │ │ j a682 │ │ │ │ mv a0,s0 │ │ │ │ - li a2,0 │ │ │ │ + li a2,2 │ │ │ │ mv a1,s7 │ │ │ │ jal 7160 <_PyMonitoring_FirePyStartEvent@plt> │ │ │ │ bne a0,s1,a6e0 │ │ │ │ j b808 │ │ │ │ addiw a5,a5,-1 │ │ │ │ sw a5,0(s0) │ │ │ │ bnez a5,a70e │ │ │ │ @@ -4802,15 +4802,15 @@ │ │ │ │ sw a5,0(s2) │ │ │ │ bnez a5,afa8 │ │ │ │ mv a0,s2 │ │ │ │ jal 7060 <_Py_Dealloc@plt> │ │ │ │ j afa8 │ │ │ │ auipc a3,0x21 │ │ │ │ ld a3,-1180(a3) │ │ │ │ - li a2,0 │ │ │ │ + li a2,2 │ │ │ │ mv a1,s7 │ │ │ │ addi a0,sp,34 │ │ │ │ jal 75d0 <_PyMonitoring_FirePyReturnEvent@plt> │ │ │ │ li a5,-1 │ │ │ │ beq a0,a5,b808 │ │ │ │ j afb0 │ │ │ │ li s3,0 │ │ │ ├── readelf --wide --decompress --hex-dump=.gnu_debuglink {} │ │ │ │ @@ -1,7 +1,7 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Hex dump of section '.gnu_debuglink': │ │ │ │ - 0x00000000 34363638 35303364 37666262 61626664 4668503d7fbbabfd │ │ │ │ - 0x00000010 39326136 34316461 38346666 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Execution code ---*/ │ │ │ - __Pyx_TraceStartFunc("PyInit_libchtslib", __pyx_f[0], 1, 1, 0, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ + __Pyx_TraceStartFunc("PyInit_libchtslib", __pyx_f[0], 1, 0, 0, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ │ │ │ /* "pysam/libchtslib.pyx":25 │ │ │ * ######################################################################## │ │ │ * │ │ │ * import os # <<<<<<<<<<<<<< │ │ │ * import io │ │ │ * import re │ │ │ @@ -21130,27 +21130,27 @@ │ │ │ * # cython: embedsignature=True │ │ │ * # cython: profile=True │ │ │ */ │ │ │ __pyx_t_3 = __Pyx_PyDict_NewPresized(0); if (unlikely(!__pyx_t_3)) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ __Pyx_GOTREF(__pyx_t_3); │ │ │ if (PyDict_SetItem(__pyx_mstate_global->__pyx_d, __pyx_mstate_global->__pyx_n_u_test, __pyx_t_3) < (0)) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ __Pyx_DECREF(__pyx_t_3); __pyx_t_3 = 0; │ │ │ - __Pyx_TraceReturnValue(Py_None, 1, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ + __Pyx_TraceReturnValue(Py_None, 0, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ __Pyx_PyMonitoring_ExitScope(0); │ │ │ │ │ │ /*--- Wrapped vars code ---*/ │ │ │ │ │ │ goto __pyx_L0; │ │ │ __pyx_L1_error:; │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_2); │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_3); │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_5); │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_6); │ │ │ __Pyx_TraceException(__pyx_lineno, 0, 0); │ │ │ - __Pyx_TraceExceptionUnwind(1, 0); │ │ │ + __Pyx_TraceExceptionUnwind(0, 0); │ │ │ if (__pyx_m) { │ │ │ if (__pyx_mstate->__pyx_d && stringtab_initialized) { │ │ │ __Pyx_AddTraceback("init pysam.libchtslib", __pyx_clineno, __pyx_lineno, __pyx_filename); │ │ │ } │ │ │ #if !CYTHON_USE_MODULE_STATE │ │ │ Py_CLEAR(__pyx_m); │ │ │ #else │ │ ├── ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libchtslib.cpython-313-riscv64-linux-gnu.so │ │ │┄ File has been modified after NT_GNU_BUILD_ID has been applied. │ │ │ ├── readelf --wide --notes {} │ │ │ │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Displaying notes found in: .note.gnu.build-id │ │ │ │ Owner Data size Description │ │ │ │ - GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: cf8ad4ec52d4399ab27bc933de8deb2e4fd63ab4 │ │ │ │ + GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: 9d8297a0c383eb4b760b6026928a39eaa1dc8609 │ │ │ ├── objdump --line-numbers --disassemble --demangle --reloc --no-show-raw-insn --section=.text {} │ │ │ │ @@ -3763,15 +3763,15 @@ │ │ │ │ mv a2,s5 │ │ │ │ mv a1,s3 │ │ │ │ addi a0,sp,136 │ │ │ │ jal 8040 <_PyMonitoring_FireRaiseEvent@plt> │ │ │ │ lbu a5,132(sp) │ │ │ │ beqz a5,b51a │ │ │ │ mv a1,s3 │ │ │ │ - li a2,1 │ │ │ │ + li a2,0 │ │ │ │ addi a0,sp,132 │ │ │ │ jal 84a0 <_PyMonitoring_FirePyUnwindEvent@plt> │ │ │ │ ld a5,8(s4) │ │ │ │ beqz a5,b55c │ │ │ │ ld a5,0(s1) │ │ │ │ beqz a5,b538 │ │ │ │ beqz s7,b538 │ │ │ │ @@ -4324,15 +4324,15 @@ │ │ │ │ li s5,-1 │ │ │ │ jal 82f0 │ │ │ │ bne a0,s5,bc7a │ │ │ │ j d228 │ │ │ │ lbu a5,128(sp) │ │ │ │ beqz a5,bc8e │ │ │ │ addi a0,sp,128 │ │ │ │ - li a2,1 │ │ │ │ + li a2,0 │ │ │ │ mv a1,s3 │ │ │ │ jal 7fa0 <_PyMonitoring_FirePyStartEvent@plt> │ │ │ │ beq a0,s5,be26 │ │ │ │ auipc s5,0x26 │ │ │ │ addi s5,s5,-838 │ │ │ │ ld a0,-1640(s5) │ │ │ │ jal 91e8 │ │ │ │ @@ -6608,15 +6608,15 @@ │ │ │ │ beqz a5,d904 │ │ │ │ j b474 │ │ │ │ mv a0,s11 │ │ │ │ jal 7e90 <_Py_Dealloc@plt> │ │ │ │ j b474 │ │ │ │ auipc a3,0x21 │ │ │ │ ld a3,1634(a3) │ │ │ │ - li a2,1 │ │ │ │ + li a2,0 │ │ │ │ mv a1,s3 │ │ │ │ addi a0,sp,130 │ │ │ │ jal 8480 <_PyMonitoring_FirePyReturnEvent@plt> │ │ │ │ li a5,-1 │ │ │ │ beq a0,a5,d92c │ │ │ │ j b47e │ │ │ │ li s5,1 │ │ │ ├── readelf --wide --decompress --hex-dump=.gnu_debuglink {} │ │ │ │ @@ -1,7 +1,7 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Hex dump of section '.gnu_debuglink': │ │ │ │ - 0x00000000 38616434 65633532 64343339 39616232 8ad4ec52d4399ab2 │ │ │ │ - 0x00000010 37626339 33336465 38646562 32653466 7bc933de8deb2e4f │ │ │ │ - 0x00000020 64363361 62342e64 65627567 00000000 d63ab4.debug.... │ │ │ │ - 0x00000030 30cb58a0 0.X. │ │ │ │ + 0x00000000 38323937 61306333 38336562 34623736 8297a0c383eb4b76 │ │ │ │ + 0x00000010 30623630 32363932 38613339 65616131 0b6026928a39eaa1 │ │ │ │ + 0x00000020 64633836 30392e64 65627567 00000000 dc8609.debug.... │ │ │ │ + 0x00000030 12b5a5c5 .... │ │ ├── ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libchtslib.cpython-314-riscv64-linux-gnu.so │ │ │┄ File has been modified after NT_GNU_BUILD_ID has been applied. │ │ │ ├── readelf --wide --notes {} │ │ │ │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Displaying notes found in: .note.gnu.build-id │ │ │ │ Owner Data size Description │ │ │ │ - GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: a7c49fabf811bf6ab2840ca4ab293acad6105c6c │ │ │ │ + GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: 0f03f3a38b2e32c743a8ec0b0230ed207163b8d1 │ │ │ ├── objdump --line-numbers --disassemble --demangle --reloc --no-show-raw-insn --section=.text {} │ │ │ │ @@ -3742,15 +3742,15 @@ │ │ │ │ mv a2,s3 │ │ │ │ mv a1,s4 │ │ │ │ addi a0,sp,120 │ │ │ │ jal 8080 <_PyMonitoring_FireRaiseEvent@plt> │ │ │ │ lbu a5,116(sp) │ │ │ │ beqz a5,b528 │ │ │ │ mv a1,s4 │ │ │ │ - li a2,1 │ │ │ │ + li a2,0 │ │ │ │ addi a0,sp,116 │ │ │ │ jal 84f0 <_PyMonitoring_FirePyUnwindEvent@plt> │ │ │ │ ld a5,8(s5) │ │ │ │ beqz a5,b566 │ │ │ │ ld a5,0(s1) │ │ │ │ beqz a5,b546 │ │ │ │ beqz s7,b546 │ │ │ │ @@ -4295,15 +4295,15 @@ │ │ │ │ li s3,-1 │ │ │ │ jal 8330 │ │ │ │ bne a0,s3,bc76 │ │ │ │ j d19e │ │ │ │ lbu a5,112(sp) │ │ │ │ beqz a5,bc8a │ │ │ │ addi a0,sp,112 │ │ │ │ - li a2,1 │ │ │ │ + li a2,0 │ │ │ │ mv a1,s4 │ │ │ │ jal 7fe0 <_PyMonitoring_FirePyStartEvent@plt> │ │ │ │ beq a0,s3,be12 │ │ │ │ auipc s3,0x27 │ │ │ │ addi s3,s3,-834 │ │ │ │ ld a0,-1640(s3) │ │ │ │ jal 925a │ │ │ │ @@ -6518,15 +6518,15 @@ │ │ │ │ beqz a5,d832 │ │ │ │ j b482 │ │ │ │ mv a0,s9 │ │ │ │ jal 7ed0 <_Py_Dealloc@plt> │ │ │ │ j b482 │ │ │ │ auipc a3,0x22 │ │ │ │ ld a3,1844(a3) │ │ │ │ - li a2,1 │ │ │ │ + li a2,0 │ │ │ │ mv a1,s4 │ │ │ │ addi a0,sp,114 │ │ │ │ jal 84d0 <_PyMonitoring_FirePyReturnEvent@plt> │ │ │ │ li a5,-1 │ │ │ │ beq a0,a5,d85a │ │ │ │ j b48c │ │ │ │ li s3,1 │ │ │ ├── readelf --wide --decompress --hex-dump=.gnu_debuglink {} │ │ │ │ @@ -1,7 +1,7 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Hex dump of section '.gnu_debuglink': │ │ │ │ - 0x00000000 63343966 61626638 31316266 36616232 c49fabf811bf6ab2 │ │ │ │ - 0x00000010 38343063 61346162 32393361 63616436 840ca4ab293acad6 │ │ │ │ - 0x00000020 31303563 36632e64 65627567 00000000 105c6c.debug.... │ │ │ │ - 0x00000030 91c3ddf8 .... │ │ │ │ + 0x00000000 30336633 61333862 32653332 63373433 03f3a38b2e32c743 │ │ │ │ + 0x00000010 61386563 30623032 33306564 32303731 a8ec0b0230ed2071 │ │ │ │ + 0x00000020 36336238 64312e64 65627567 00000000 63b8d1.debug.... │ │ │ │ + 0x00000030 9e2bb4af .+.. │ │ ├── ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libcsamtools.c │ │ │┄ Ordering differences only │ │ │ @@ -34,63 +34,63 @@ │ │ │ "/usr/lib/riscv64-linux-gnu", │ │ │ "/build/reproducible-path/python-pysam-0.23.3+ds/.pybuild/cpython3_3.14_pysam/build/pysam", │ │ │ "/build/reproducible-path/python-pysam-0.23.3+ds/.pybuild/cpython3_3.14_pysam/build/pysam" │ │ │ ], │ │ │ "name": "pysam.libcsamtools", │ │ │ "sources": [ │ │ │ "pysam/libcsamtools.pyx", │ │ │ - "samtools/tmp_file.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/stats_isize.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/stats.c.pysam.c", │ │ │ "samtools/samtools.pysam.c", │ │ │ - "samtools/sample.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/sam_view.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/sam_utils.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/sam_opts.c.pysam.c", │ │ │ "samtools/reset.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/reference.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/phase.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/padding.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/faidx.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/dict.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bam_md.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bam_aux.c.pysam.c", │ │ │ "samtools/cut_target.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/cram_size.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/coverage.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/consensus_pileup.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bedidx.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bedcov.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bam_consensus.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/faidx.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bam_index.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bam_lpileup.c.pysam.c", │ │ │ "samtools/bamtk.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/tmp_file.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/reference.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/sam_opts.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bedcov.c.pysam.c", │ │ │ "samtools/bamshuf.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bam_stat.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bam_split.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bam_sort.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bam_mate.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/stats.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bam.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bam_markdup.c.pysam.c", │ │ │ "samtools/bam_samples.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bam_rmdupse.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/sam_view.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bam_split.c.pysam.c", │ │ │ "samtools/bam_rmdup.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/stats_isize.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bam_color.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/sample.c.pysam.c", │ │ │ "samtools/bam_reheader.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bam_quickcheck.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/amplicon_stats.c.pysam.c", │ │ │ "samtools/bam_plcmd.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bam_sort.c.pysam.c", │ │ │ "samtools/bam_plbuf.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bam_md.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bam_mate.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bam_markdup.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bam_lpileup.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bam_index.c.pysam.c", │ │ │ "samtools/bam_import.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/phase.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/dict.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bam_stat.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bam_rmdupse.c.pysam.c", │ │ │ "samtools/bam_flags.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bam_fastq.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bam_consensus.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bam_color.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bam_cat.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bam_aux.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/consensus_pileup.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bam_quickcheck.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/sam_utils.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bam2depth.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/coverage.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/padding.c.pysam.c", │ │ │ "samtools/bam_ampliconclip.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/cram_size.c.pysam.c", │ │ │ "samtools/bam_addrprg.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bam2depth.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/bam.c.pysam.c", │ │ │ - "samtools/amplicon_stats.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bam_cat.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bedidx.c.pysam.c", │ │ │ + "samtools/bam_fastq.c.pysam.c", │ │ │ "samtools/lz4/lz4.c" │ │ │ ] │ │ │ }, │ │ │ "module_name": "pysam.libcsamtools" │ │ │ } │ │ │ END: Cython Metadata */ │ │ ├── ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libctabix.c │ │ │ @@ -28133,15 +28133,15 @@ │ │ │ (void)__Pyx_modinit_variable_export_code(__pyx_mstate); │ │ │ (void)__Pyx_modinit_function_export_code(__pyx_mstate); │ │ │ if (unlikely((__Pyx_modinit_type_init_code(__pyx_mstate) < 0))) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ if (unlikely((__Pyx_modinit_type_import_code(__pyx_mstate) < 0))) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ (void)__Pyx_modinit_variable_import_code(__pyx_mstate); │ │ │ if (unlikely((__Pyx_modinit_function_import_code(__pyx_mstate) < 0))) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ /*--- Execution code ---*/ │ │ │ - __Pyx_TraceStartFunc("PyInit_libctabix", __pyx_f[0], 1, 18, 0, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ + __Pyx_TraceStartFunc("PyInit_libctabix", __pyx_f[0], 1, 7, 0, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ │ │ │ /* "pysam/libctabix.pyx":57 │ │ │ * # │ │ │ * ############################################################################### │ │ │ * import os # <<<<<<<<<<<<<< │ │ │ * import sys │ │ │ * │ │ │ @@ -28800,26 +28800,26 @@ │ │ │ * # cython: embedsignature=True │ │ │ * # cython: profile=True │ │ │ */ │ │ │ __pyx_t_2 = __Pyx_PyDict_NewPresized(0); if (unlikely(!__pyx_t_2)) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ __Pyx_GOTREF(__pyx_t_2); │ │ │ if (PyDict_SetItem(__pyx_mstate_global->__pyx_d, __pyx_mstate_global->__pyx_n_u_test, __pyx_t_2) < (0)) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error) │ │ │ __Pyx_DECREF(__pyx_t_2); __pyx_t_2 = 0; │ │ │ - __Pyx_TraceReturnValue(Py_None, 18, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ + __Pyx_TraceReturnValue(Py_None, 7, 0, __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)); │ │ │ __Pyx_PyMonitoring_ExitScope(0); │ │ │ │ │ │ /*--- Wrapped vars code ---*/ │ │ │ │ │ │ goto __pyx_L0; │ │ │ __pyx_L1_error:; │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_2); │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_3); │ │ │ __Pyx_XDECREF(__pyx_t_4); │ │ │ __Pyx_TraceException(__pyx_lineno, 0, 0); │ │ │ - __Pyx_TraceExceptionUnwind(18, 0); │ │ │ + __Pyx_TraceExceptionUnwind(7, 0); │ │ │ if (__pyx_m) { │ │ │ if (__pyx_mstate->__pyx_d && stringtab_initialized) { │ │ │ __Pyx_AddTraceback("init pysam.libctabix", __pyx_clineno, __pyx_lineno, __pyx_filename); │ │ │ } │ │ │ #if !CYTHON_USE_MODULE_STATE │ │ │ Py_CLEAR(__pyx_m); │ │ │ #else │ │ ├── ./usr/lib/python3/dist-packages/pysam/libctabix.cpython-313-riscv64-linux-gnu.so │ │ │┄ File has been modified after NT_GNU_BUILD_ID has been applied. │ │ │ ├── readelf --wide --notes {} │ │ │ │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ │ │ │ │ │ │ Displaying notes found in: .note.gnu.build-id │ │ │ │ Owner Data size Description │ │ │ │ - GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: 547403e7696e0ca23aa9e6924efa97218bf67371 │ │ │ │ + GNU 0x00000014 NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring) Build ID: 5f55747a8454f6b15708beaeef12c0570cdd333b │ │ │ ├── objdump --line-numbers --disassemble --demangle --reloc --no-show-raw-insn --section=.text {} │ │ │ │ @@ -4728,15 +4728,15 @@ │ │ │ │ auipc a0,0x24 │ │ │ │ addi a0,a0,438 │ │ │ │ jal fade │ │ │ │ mv s9,a0 │ │ │ │ bnez a0,d1b6 │ │ │ │ j e4a2 │ │ │ │ addi a0,sp,64 │ │ │ │ - li a2,18 │ │ │ │ + li a2,7 │ │ │ │ mv a1,s9 │ │ │ │ jal ffee │ │ │ │ li a5,-1 │ │ │ │ bne a0,a5,d1ca │ │ │ │ j e7f2 │ │ │ │ auipc 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